seq1 = pF1KB9603.tfa, 1035 bp
seq2 = pF1KB9603/gi568815582f_86478724.tfa (gi568815582f:86478724_86679758), 201035 bp

>pF1KB9603 1035
>gi568815582f:86478724_86679758 (Chr16)

1-1035  (100001-101035)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTCACCTCTTCGATCCCCGGCTGCCTGCCCTGGCCGCCTCGCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTCACCTCTTCGATCCCCGGCTGCCTGCCCTGGCCGCCTCGCCCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGTATCTGTACGGTCCCGAGAGACCCGGCCTCCCTCTGGCCTTCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGTATCTGTACGGTCCCGAGAGACCCGGCCTCCCTCTGGCCTTCGCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGCGGCTGCTCTAGCTGCCTCGGGCCGGGCCGAGACCCCGCAGAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGCGGCTGCTCTAGCTGCCTCGGGCCGGGCCGAGACCCCGCAGAAGCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCTACAGCTACATCGCGCTCATCGCCATGGCGATCCAGGACGCGCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCTACAGCTACATCGCGCTCATCGCCATGGCGATCCAGGACGCGCCCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCAGAGGGTCACGCTCAACGGCATCTACCAGTTCATCATGGACCGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCAGAGGGTCACGCTCAACGGCATCTACCAGTTCATCATGGACCGCTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCTTCTACCACGACAACCGGCAGGGCTGGCAGAACAGCATCCGCCACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCTTCTACCACGACAACCGGCAGGGCTGGCAGAACAGCATCCGCCACAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCTCGCTCAACGACTGCTTCGTCAAGGTGCCCCGCGAGAAAGGGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCTCGCTCAACGACTGCTTCGTCAAGGTGCCCCGCGAGAAAGGGCGGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGGCAAGGGCAGCTACTGGACGCTGGACCCCCGCTGCCTGGACATGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGGCAAGGGCAGCTACTGGACGCTGGACCCCCGCTGCCTGGACATGTTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGAACGGCAACTACCGGCGCCGGAAGAGGAAGCCCAAGCCGGGCCCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGAACGGCAACTACCGGCGCCGGAAGAGGAAGCCCAAGCCGGGCCCCGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCCCGGAGGCCAAGAGGCCCCGCGCCGAGACGCACCAGCGCAGCGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCCCGGAGGCCAAGAGGCCCCGCGCCGAGACGCACCAGCGCAGCGCGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGCGCAGCCGGAGGCGGGGAGCGGGGCAGGGGGCTCGGGCCCCGCAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGCGCAGCCGGAGGCGGGGAGCGGGGCAGGGGGCTCGGGCCCCGCAATCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCCGCCTGCAGGCAGCGCCCGCGGGCCCCTCGCCCCTCCTGGACGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCCGCCTGCAGGCAGCGCCCGCGGGCCCCTCGCCCCTCCTGGACGGCCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCTCCGCCGGCGCCCCTCCACTGGCCGGGGACCGCGTCCCCGAACGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCTCCGCCGGCGCCCCTCCACTGGCCGGGGACCGCGTCCCCGAACGAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGCTGGTGACGCTGCCCAGGGCGCAGCGGCCGTGGCGGTCGGCCAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGCTGGTGACGCTGCCCAGGGCGCAGCGGCCGTGGCGGTCGGCCAGGCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CGCGCACAGGGGACGGCCCGGGGTCCCCTCTGCGCCCCGCCTCCCGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CGCGCACAGGGGACGGCCCGGGGTCCCCTCTGCGCCCCGCCTCCCGCAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCTCCGAAGAGCTCCGACAAGTCCAAGAGCTTCAGCATAGACAGCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCTCCGAAGAGCTCCGACAAGTCCAAGAGCTTCAGCATAGACAGCATCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGCGGGAAAGCAGGGCCAGAAGCCGCCTTCAGGGGACGAACTCCTAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGCGGGAAAGCAGGGCCAGAAGCCGCCTTCAGGGGACGAACTCCTAGGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GTGCCAAGCCTGGGCCCGGCGGCCGTCTGGGTGCCTCGCTCCTGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GTGCCAAGCCTGGGCCCGGCGGCCGTCTGGGTGCCTCGCTCCTGGCCGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TCCTCCAGCCTCCGTCCGCCTTTCAACGCTTCCCTGATGCTCGACCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TCCTCCAGCCTCCGTCCGCCTTTCAACGCTTCCCTGATGCTCGACCCGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGTCCAGGGCGGCTTTTACCAGCTCGGGATCCCCTTCCTCTCTTATTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGTCCAGGGCGGCTTTTACCAGCTCGGGATCCCCTTCCTCTCTTATTTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .
   1001 CCCTGCAGGTTCCCGACACGGTACTCCACTTCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCCTGCAGGTTCCCGACACGGTACTCCACTTCCAG