seq1 = pF1KB9585.tfa, 1035 bp
seq2 = pF1KB9585/gi568815578f_50091034.tfa (gi568815578f:50091034_50292068), 201035 bp

>pF1KB9585 1035
>gi568815578f:50091034_50292068 (Chr20)

1-1035  (100001-101035)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAACGCCTGGTGGCCTGGGACCCAGCATGTCTCCCCCTGCCGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAACGCCTGGTGGCCTGGGACCCAGCATGTCTCCCCCTGCCGCCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGCCTGCCTTTAAATCCATGGAAGTGGCCAACTTCTACTACGAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCGCCTGCCTTTAAATCCATGGAAGTGGCCAACTTCTACTACGAGGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTGCTTGGCTGCTGCGTACGGCGGCAAGGCGGCCCCCGCGGCGCCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTGCTTGGCTGCTGCGTACGGCGGCAAGGCGGCCCCCGCGGCGCCCCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCGGCCAGACCCGGGCCGCGCCCCCCCGCCGGCGAGCTGGGCAGCATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCGGCCAGACCCGGGCCGCGCCCCCCCGCCGGCGAGCTGGGCAGCATCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGACCACGAGCGCGCCATCGACTTCAGCCCGTACCTGGAGCCGCTGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGACCACGAGCGCGCCATCGACTTCAGCCCGTACCTGGAGCCGCTGGGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGCCGCAGGCCCCGGCGCCCGCCACGGCCACGGACACCTTCGAGGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGCCGCAGGCCCCGGCGCCCGCCACGGCCACGGACACCTTCGAGGCGGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCGCCCGCGCCCGCCCCCGCGCCCGCCTCCTCCGGGCAGCACCACGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCGCCCGCGCCCGCCCCCGCGCCCGCCTCCTCCGGGCAGCACCACGACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTCTCCGACCTCTTCTCCGACGACTACGGGGGCAAGAACTGCAAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTCTCCGACCTCTTCTCCGACGACTACGGGGGCAAGAACTGCAAGAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGGCCGAGTACGGCTACGTGAGCCTGGGGCGCCTGGGGGCCGCCAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGGCCGAGTACGGCTACGTGAGCCTGGGGCGCCTGGGGGCCGCCAAGGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCGCTGCACCCCGGCTGCTTCGCGCCCCTGCACCCACCGCCCCCGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCGCTGCACCCCGGCTGCTTCGCGCCCCTGCACCCACCGCCCCCGCCGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCCGCCGCCCGCCGAGCTCAAGGCGGAGCCGGGCTTCGAGCCCGCGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCCGCCGCCCGCCGAGCTCAAGGCGGAGCCGGGCTTCGAGCCCGCGGACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCAAGCGGAAGGAGGAGGCCGGGGCGCCGGGCGGCGGCGCAGGCATGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCAAGCGGAAGGAGGAGGCCGGGGCGCCGGGCGGCGGCGCAGGCATGGCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCGGGCTTCCCGTACGCGCTGCGCGCTTACCTCGGCTACCAGGCGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCGGGCTTCCCGTACGCGCTGCGCGCTTACCTCGGCTACCAGGCGGTGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GAGCGGCAGCAGCGGGAGCCTCTCCACGTCCTCCTCGTCCAGCCCGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GAGCGGCAGCAGCGGGAGCCTCTCCACGTCCTCCTCGTCCAGCCCGCCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCACGCCGAGCCCCGCTGACGCCAAGGCGCCCCCGACCGCCTGCTACGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCACGCCGAGCCCCGCTGACGCCAAGGCGCCCCCGACCGCCTGCTACGCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGGGCCGCGCCGGCGCCCTCGCAGGTCAAGAGCAAGGCCAAGAAGACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGGGCCGCGCCGGCGCCCTCGCAGGTCAAGAGCAAGGCCAAGAAGACCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGACAAGCACAGCGACGAGTACAAGATCCGGCGCGAGCGCAACAACATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGACAAGCACAGCGACGAGTACAAGATCCGGCGCGAGCGCAACAACATCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCGTGCGCAAGAGCCGCGACAAGGCCAAGATGCGCAACCTGGAGACGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCGTGCGCAAGAGCCGCGACAAGGCCAAGATGCGCAACCTGGAGACGCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CACAAGGTCCTGGAGCTCACGGCCGAGAACGAGCGGCTGCAGAAGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CACAAGGTCCTGGAGCTCACGGCCGAGAACGAGCGGCTGCAGAAGAAGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GGAGCAGCTGTCGCGCGAGCTCAGCACCCTGCGGAACTTGTTCAAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GGAGCAGCTGTCGCGCGAGCTCAGCACCCTGCGGAACTTGTTCAAGCAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .
   1001 TGCCCGAGCCCCTGCTCGCCTCCTCCGGCCACTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGCCCGAGCCCCTGCTCGCCTCCTCCGGCCACTGC