seq1 = pF1KB9575.tfa, 1821 bp
seq2 = pF1KB9575/gi568815576f_37749321.tfa (gi568815576f:37749321_37988461), 239141 bp

>pF1KB9575 1821
>gi568815576f:37749321_37988461 (Chr22)

1-162  (100001-100162)   100% ->
163-211  (100695-100743)   100% ->
212-422  (101960-102170)   100% ->
423-502  (106245-106324)   100% ->
503-564  (109359-109420)   100% ->
565-634  (113649-113718)   100% ->
635-708  (113952-114025)   100% ->
709-880  (120856-121027)   100% ->
881-1035  (125050-125204)   100% ->
1036-1206  (126521-126691)   100% ->
1207-1704  (128354-128851)   100% ->
1705-1785  (137445-137525)   100% ->
1786-1821  (139106-139141)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGAGGCCTCGGAAAGGCTTCCGGTTTCCCGGCAGGCCCGAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAGAGGCCTCGGAAAGGCTTCCGGTTTCCCGGCAGGCCCGAGTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGAACTTCCGGCCTCAGGACGCAGGCGCGGGCCGCTCATTTCGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTGAACTTCCGGCCTCAGGACGCAGGCGCGGGCCGCTCATTTCGCTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCCGGCGGTGCTCGCAAGCGAGGCAGCCATGTCTTATCCCGCTGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTCCGGCGGTGCTCGCAAGCGAGGCAGCCATGTCTTATCCCGCTGATGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TATGAGTCTGAG         GCGGCTTATGACCCCTACGCTTATCCCAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TATGAGTCTGAGGTA...TAGGCGGCTTATGACCCCTACGCTTATCCCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGACTATGATATGCACACAG         GAGATCCAAAGCAGGACCTTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100724 CGACTATGATATGCACACAGGTG...CAGGAGATCCAAAGCAGGACCTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTTATGAACGTCAGTATGAACAGCAAACCTATCAGGTGATCCCTGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101981 CTTATGAACGTCAGTATGAACAGCAAACCTATCAGGTGATCCCTGAGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATCAAAAACTTCATCCAGTATTTCCACAAAACTGTCTCAGATTTGATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102031 ATCAAAAACTTCATCCAGTATTTCCACAAAACTGTCTCAGATTTGATTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCAGAAAGTGTATGAGCTACAGGCCAGTCGTGTCTCCAGTGATGTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102081 CCAGAAAGTGTATGAGCTACAGGCCAGTCGTGTCTCCAGTGATGTCATTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACCAGAAGGTGTATGAGATCCAGGACATCTATGAGAACAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 102131 ACCAGAAGGTGTATGAGATCCAGGACATCTATGAGAACAGGTA...TAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TGGACCAAGCTGACTGAAAGATTCTTCAAGAATACACCTTGGCCCGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106246 TGGACCAAGCTGACTGAAAGATTCTTCAAGAATACACCTTGGCCCGAGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGAAGCCATTGCTCCACAGGTTGGCAATG         ATGCTGTCTTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 106296 TGAAGCCATTGCTCCACAGGTTGGCAATGGTA...CAGATGCTGTCTTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGATTTTATACAAAGAATTATACTACAGGCACATATATGCCAAAGTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109371 TGATTTTATACAAAGAATTATACTACAGGCACATATATGCCAAAGTCAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565          GGGGGACCTTCCTTGGAGCAGAGGTTTGAATCCTATTACAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109421 GTA...CAGGGGGGACCTTCCTTGGAGCAGAGGTTTGAATCCTATTACAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CTACTGCAATCTCTTCAACTACATTCTTA         ATGCCGATGGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 113690 CTACTGCAATCTCTTCAACTACATTCTTAGTG...CAGATGCCGATGGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CTGCTCCCCTTGAACTACCCAACCAGTGGCTCTGGGATATTATCGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113964 CTGCTCCCCTTGAACTACCCAACCAGTGGCTCTGGGATATTATCGATGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TTCATCTACCAG         TTTCAGTCATTCAGTCAGTACCGCTGTAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 114014 TTCATCTACCAGGTA...CAGTTTCAGTCATTCAGTCAGTACCGCTGTAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GACTGCCAAGAAGTCAGAGGAGGAGATTGACTTTCTTCGTTCCAATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120885 GACTGCCAAGAAGTCAGAGGAGGAGATTGACTTTCTTCGTTCCAATCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AAATCTGGAATGTTCATAGTGTCCTCAATGTCCTTCATTCCCTGGTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120935 AAATCTGGAATGTTCATAGTGTCCTCAATGTCCTTCATTCCCTGGTAGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AAATCCAACATCAACCGACAGTTGGAGGTATACACAAGCGGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 120985 AAATCCAACATCAACCGACAGTTGGAGGTATACACAAGCGGAGGTG...C

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    881   GTGACCCTGAGAGTGTGGCTGGGGAGTATGGGCGGCACTCCCTCTACA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125048 AGGTGACCCTGAGAGTGTGGCTGGGGAGTATGGGCGGCACTCCCTCTACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 AAATGCTTGGTTACTTCAGCCTGGTCGGGCTTCTCCGCCTGCACTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125098 AAATGCTTGGTTACTTCAGCCTGGTCGGGCTTCTCCGCCTGCACTCCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TTAGGAGATTACTACCAGGCCATCAAGGTGCTGGAGAACATCGAACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125148 TTAGGAGATTACTACCAGGCCATCAAGGTGCTGGAGAACATCGAACTGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CAAGAAG         AGTATGTATTCCCGTGTGCCAGAGTGCCAGGTCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125198 CAAGAAGGTG...CAGAGTATGTATTCCCGTGTGCCAGAGTGCCAGGTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CCACATACTATTATGTTGGGTTTGCATATTTGATGATGCGTCGTTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126555 CCACATACTATTATGTTGGGTTTGCATATTTGATGATGCGTCGTTACCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GATGCCATCCGGGTCTTCGCCAACATCCTCCTCTACATCCAGAGGACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126605 GATGCCATCCGGGTCTTCGCCAACATCCTCCTCTACATCCAGAGGACCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GAGCATGTTCCAGAGGACCACGTACAAGTATGAGATG         ATTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 126655 GAGCATGTTCCAGAGGACCACGTACAAGTATGAGATGGTA...CAGATTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 ACAAGCAGAATGAGCAGATGCATGCGCTGCTGGCCATTGCCCTCACGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128358 ACAAGCAGAATGAGCAGATGCATGCGCTGCTGGCCATTGCCCTCACGATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TACCCCATGCGTATTGATGAGAGCATTCACCTCCAGCTGCGGGAGAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128408 TACCCCATGCGTATTGATGAGAGCATTCACCTCCAGCTGCGGGAGAAATA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TGGGGACAAGATGTTGCGCATGCAGAAAGGTGACCCACAAGTCTATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128458 TGGGGACAAGATGTTGCGCATGCAGAAAGGTGACCCACAAGTCTATGAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 AACTTTTCAGTTACTCCTGCCCCAAGTTCCTGTCGCCTGTAGTGCCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128508 AACTTTTCAGTTACTCCTGCCCCAAGTTCCTGTCGCCTGTAGTGCCCAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 TATGATAATGTGCACCCCAACTACCACAAAGAGCCCTTCCTGCAGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128558 TATGATAATGTGCACCCCAACTACCACAAAGAGCCCTTCCTGCAGCAGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GAAGGTGTTTTCTGATGAAGTACAGCAGCAGGCCCAGCTTTCAACCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128608 GAAGGTGTTTTCTGATGAAGTACAGCAGCAGGCCCAGCTTTCAACCATCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 GCAGCTTCCTGAAGCTCTACACCACCATGCCTGTGGCCAAGCTGGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128658 GCAGCTTCCTGAAGCTCTACACCACCATGCCTGTGGCCAAGCTGGCTGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 TTCCTGGACCTCACAGAGCAGGAGTTCCGGATCCAGCTTCTTGTCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128708 TTCCTGGACCTCACAGAGCAGGAGTTCCGGATCCAGCTTCTTGTCTTCAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 ACACAAGATGAAGAACCTCGTGTGGACCAGCGGTATCTCAGCCCTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128758 ACACAAGATGAAGAACCTCGTGTGGACCAGCGGTATCTCAGCCCTGGATG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 GTGAATTTCAGTCAGCCTCAGAGGTTGACTTCTACATTGATAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 128808 GTGAATTTCAGTCAGCCTCAGAGGTTGACTTCTACATTGATAAGGTA...

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1705    GACATGATCCACATCGCGGACACCAAGGTCGCCAGGCGTTATGGGGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137442 CAGGACATGATCCACATCGCGGACACCAAGGTCGCCAGGCGTTATGGGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 TTTCTTCATCCGTCAGATCCACAAATTTGAGGAG         CTTAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 137492 TTTCTTCATCCGTCAGATCCACAAATTTGAGGAGGTG...TAGCTTAATC

   1900     .    :    .    :    .
   1793 GAACCCTGAAGAAGATGGGACAGAGACCT
        |||||||||||||||||||||||||||||
 139113 GAACCCTGAAGAAGATGGGACAGAGACCT