seq1 = pF1KB9554.tfa, 510 bp
seq2 = pF1KB9554/gi568815576r_29631228.tfa (gi568815576r:29631228_29848544), 217317 bp

>pF1KB9554 510
>gi568815576r:29631228_29848544 (Chr22)

(complement)

1-127  (100001-100127)   100% ->
128-190  (106065-106127)   100% ->
191-271  (107815-107895)   100% ->
272-383  (110104-110215)   100% ->
384-510  (117191-117317)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGAAGCGATACTTCTGTGACTACTGCGACCGCTCCTTCCAGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGAAGCGATACTTCTGTGACTACTGCGACCGCTCCTTCCAGGACAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCCACAACCGCAAGAAGCACCTGAACGGGCTGCAGCACCTCAAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTCCACAACCGCAAGAAGCACCTGAACGGGCTGCAGCACCTCAAGGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAAGGTCTGGTACGACATGTTCCGAG         ATGCAGCTGCCATC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100101 AGAAGGTCTGGTACGACATGTTCCGAGGTG...CAGATGCAGCTGCCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTGCTGGATGAGCAGAACAAGCGGCCCTGCAGGAAGTTTCTACTGACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 106079 TTGCTGGATGAGCAGAACAAGCGGCCCTGCAGGAAGTTTCTACTGACAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191         GCCAGTGCGACTTTGGCTCCAACTGCAGATTTTCCCACATGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106129 TA...CAGGCCAGTGCGACTTTGGCTCCAACTGCAGATTTTCCCACATGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAGAGCGAGACCTGCAGGAGCTGAGCATCCAGGTGGAGG         AG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 107857 CAGAGCGAGACCTGCAGGAGCTGAGCATCCAGGTGGAGGGTA...CAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAGAGGCGAGCCAGGGAGTGGCTACTAGATGCTCCTGAGCTCCCCGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110106 GAGAGGCGAGCCAGGGAGTGGCTACTAGATGCTCCTGAGCTCCCCGAGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCATCTGGAGGACTGGCTGGAGAAGAGAGCCAAGCGGCTGAGCTCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110156 CCATCTGGAGGACTGGCTGGAGAAGAGAGCCAAGCGGCTGAGCTCAGCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CAAGTAGCAG         GGCTGAACCCATCAGAACCACTGTCTTCCAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 110206 CAAGTAGCAGGTA...TAGGGCTGAACCCATCAGAACCACTGTCTTCCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TACCCCGTGGGCTGGCCACCAGTTCAGGAGCTGCCTCCATCCCTGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117222 TACCCCGTGGGCTGGCCACCAGTTCAGGAGCTGCCTCCATCCCTGCGGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    465 ACCCCCACCTGGGGGGTGGCCTCTGCAGCCCAGAGTCCAGTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117272 ACCCCCACCTGGGGGGTGGCCTCTGCAGCCCAGAGTCCAGTGGGGC