seq1 = pF1KB9547.tfa, 330 bp
seq2 = pF1KB9547/gi568815576r_41360401.tfa (gi568815576r:41360401_41568653), 208253 bp

>pF1KB9547 330
>gi568815576r:41360401_41568653 (Chr22)

(complement)

1-52  (100001-100052)   100% ->
53-76  (100507-100530)   100% ->
77-243  (101040-101206)   100% ->
244-330  (108167-108253)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTAAACATCATCCTGATTTGATCTTTTGCCGCAAGCAGGCTGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTAAACATCATCCTGATTTGATCTTTTGCCGCAAGCAGGCTGGTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TG         CCATCGGAAGACTGTGTGAAAAAT         GTGATG
        ||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100051 TGGTG...CAGCCATCGGAAGACTGTGTGAAAAATGTG...CAGGTGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 GCAAGTGTGTGATTTGTGACTCCTATGTGCGTCCCTGCACTCTGGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101046 GCAAGTGTGTGATTTGTGACTCCTATGTGCGTCCCTGCACTCTGGTGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ATATGTGATGAGTGTAACTATGGATCTTACCAGGGGCGCTGTGTGATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101096 ATATGTGATGAGTGTAACTATGGATCTTACCAGGGGCGCTGTGTGATCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGGAGGACCTGGGGTCTCTGATGCCTATTATTGTAAGGAGTGCACCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101146 TGGAGGACCTGGGGTCTCTGATGCCTATTATTGTAAGGAGTGCACCATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGAGAAGGAC         AGAGATGGCTGCCCAAAGATTGTCAATCTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101196 AGGAGAAGGACGTA...CAGAGAGATGGCTGCCCAAAGATTGTCAATCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GGGAGCTCTAAGACAGACCTCTTCTATGAACGCAAAAAATACGGCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108197 GGGAGCTCTAAGACAGACCTCTTCTATGAACGCAAAAAATACGGCTTCAA

    350     .
    324 GAAGAGG
        |||||||
 108247 GAAGAGG