seq1 = pF1KB9538.tfa, 1056 bp
seq2 = pF1KB9538/gi568815582f_75069276.tfa (gi568815582f:75069276_75270331), 201056 bp

>pF1KB9538 1056
>gi568815582f:75069276_75270331 (Chr16)

1-1056  (100001-101056)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAGAGACCACAGAAACCCAGACGAGCAGGCGAGGCAATTTTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAGAGACCACAGAAACCCAGACGAGCAGGCGAGGCAATTTTTAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTTAAGAACCAAACCCCAATTGAGGAAAGAGGCGATCTCTTTGGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTTAAGAACCAAACCCCAATTGAGGAAAGAGGCGATCTCTTTGGAAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CACTTAATCTGAACACAGACTTTGTTTCTTTAAGACAAGTACCTTATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CACTTAATCTGAACACAGACTTTGTTTCTTTAAGACAAGTACCTTATAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TATGACTTATATGAAAAAACTTTGAAATATAATTCAGACTTGCTTAATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TATGACTTATATGAAAAAACTTTGAAATATAATTCAGACTTGCTTAATAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TAATAGAAGCTATGCAGGAAAGCAGACTGATGAGTGTAATGAATTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TAATAGAAGCTATGCAGGAAAGCAGACTGATGAGTGTAATGAATTTGGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAGCACTTCTCTACCTGAAGCAAGAGAAAACCCACAGTGGAGTAGAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AAGCACTTCTCTACCTGAAGCAAGAGAAAACCCACAGTGGAGTAGAATAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCTGAATACAATAAAAGTGGAAAAGCCCTCAGCCATAAAGCAGCCATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCTGAATACAATAAAAGTGGAAAAGCCCTCAGCCATAAAGCAGCCATTTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TAAACATCAGAAAATAAAAAACTTGGTTCAACCTTTCATTTGTACTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TAAACATCAGAAAATAAAAAACTTGGTTCAACCTTTCATTTGTACTTACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGACAAGGCTTTCTCCTTTAAGTCACTCCTCATTAGTCATAAGAGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTGACAAGGCTTTCTCCTTTAAGTCACTCCTCATTAGTCATAAGAGAATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CATACTGGAGAAAAGCCATATGAATGCAATGTATGTAAGAAAACCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CATACTGGAGAAAAGCCATATGAATGCAATGTATGTAAGAAAACCTTCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCATAAGGCCAACCTCATCAAACATCAGAGAATTCACACTGGGGAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCATAAGGCCAACCTCATCAAACATCAGAGAATTCACACTGGGGAGAAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTTTCGAGTGTCCGGAATGTGGAAAAGCTTTCACCCACCAGTCAAACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTTTCGAGTGTCCGGAATGTGGAAAAGCTTTCACCCACCAGTCAAACCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATTGTACACCAGAGAGCACATATGGAGAAGAAGCCCTATGAGTGCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATTGTACACCAGAGAGCACATATGGAGAAGAAGCCCTATGAGTGCAGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ATGTGGAAAGACATTTGCCCAAAAGTTTGAACTCACCACACACCAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ATGTGGAAAGACATTTGCCCAAAAGTTTGAACTCACCACACACCAGAGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TTCATACAGGAGAGCGACCCTATGAGTGTAACGAATGTGCAAAAACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TTCATACAGGAGAGCGACCCTATGAGTGTAACGAATGTGCAAAAACCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTTAAGAAGTCAAACCTTATCATACATCAGAAGATTCACACGGGGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTTAAGAAGTCAAACCTTATCATACATCAGAAGATTCACACGGGGGAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ACGCTATGAGTGCAGTGAATGTGGAAAATCCTTTATCCAGAACTCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ACGCTATGAGTGCAGTGAATGTGGAAAATCCTTTATCCAGAACTCACAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCATCATACACATGAGAACTCATACAGGAGAGAAACCCTATGAATGTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCATCATACACATGAGAACTCATACAGGAGAGAAACCCTATGAATGTACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GAGTGCGGCAAAACTTTCAGCCAGAGGTCAACTCTTAGATTACACTTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GAGTGCGGCAAAACTTTCAGCCAGAGGTCAACTCTTAGATTACACTTGCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AATCCACACAGGAGAGAAACCATATGAGTGTTCCGAATGTGGGAAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AATCCACACAGGAGAGAAACCATATGAGTGTTCCGAATGTGGGAAGGCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TTAGCAGGAAGTCCCGACTCAGTGTCCATCAGAGAGTTCACATCGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TTAGCAGGAAGTCCCGACTCAGTGTCCATCAGAGAGTTCACATCGGGGAG

   1050     .
   1051 AAACCC
        ||||||
 101051 AAACCC