seq1 = pF1KB9536.tfa, 1206 bp
seq2 = pF1KB9536/gi568815592r_26537348.tfa (gi568815592r:26537348_26738553), 201206 bp

>pF1KB9536 1206
>gi568815592r:26537348_26738553 (Chr6)

(complement)

1-1206  (100001-101206)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACACTTCAGAAGAGAAATGTAATCAGAGAACTCAAAAAAGGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTACACTTCAGAAGAGAAATGTAATCAGAGAACTCAAAAAAGGAAAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATATAATGTATGCCCTCGGAAGGGTAAAAAGATTTTTATTCATATGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATATAATGTATGCCCTCGGAAGGGTAAAAAGATTTTTATTCATATGCATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGATTATTCAGATAGATGGTCATATATACCAGTGCCTTGAATGCAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGATTATTCAGATAGATGGTCATATATACCAGTGCCTTGAATGCAAGCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACTTCTGTGAAAACTTAGCTCTTATTATGTGTGAGAGAACCCATACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AACTTCTGTGAAAACTTAGCTCTTATTATGTGTGAGAGAACCCATACTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAGAAACCTTATAAATGTGATATGTGTGAGAAAACCTTTGTCCAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAGAAACCTTATAAATGTGATATGTGTGAGAAAACCTTTGTCCAAAGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAGATCTTACTTCACACCAGAGGATCCACAATTACGAGAAACCTTATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAGATCTTACTTCACACCAGAGGATCCACAATTACGAGAAACCTTATAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGTAGCAAATGTGAGAAGAGCTTTTGGCATCACTTAGCGCTTTCAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGTAGCAAATGTGAGAAGAGCTTTTGGCATCACTTAGCGCTTTCAGGACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCAGAGAACACATGCAGGTAAAAAATTCTATACATGTGACATTTGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCAGAGAACACATGCAGGTAAAAAATTCTATACATGTGACATTTGTGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGAATTTTGGTCAGAGTTCTGATCTGCTTGTCCACCAGCGAAGCCATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGAATTTTGGTCAGAGTTCTGATCTGCTTGTCCACCAGCGAAGCCATACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCGAGAAACCATATCTATGTAGTGAGTGTGACAAATGCTTCAGTAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCGAGAAACCATATCTATGTAGTGAGTGTGACAAATGCTTCAGTAGAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TACAAACCTCATAAGGCATCGAAGAACTCACACAGGTGAGAAACCATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TACAAACCTCATAAGGCATCGAAGAACTCACACAGGTGAGAAACCATTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGTGTCTCGAGTGTGAAAAAGCTTTTAGTGGGAAATCAGATCTTATTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGTGTCTCGAGTGTGAAAAAGCTTTTAGTGGGAAATCAGATCTTATTAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CACCAGAGAACTCACACTGGGGAAAGGCCCTACAAATGTAATAAGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CACCAGAGAACTCACACTGGGGAAAGGCCCTACAAATGTAATAAGTGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GAAAAGTTACCGACACCGTTCAGCCTTCATTGTACATAAAAGAGTTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GAAAAGTTACCGACACCGTTCAGCCTTCATTGTACATAAAAGAGTTCATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTGGGGAGAAGCCCTATAAGTGTGGTGCCTGTGAAAAATGCTTTGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTGGGGAGAAGCCCTATAAGTGTGGTGCCTGTGAAAAATGCTTTGGCCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAATCAGACCTTATCGTGCACCAGAGAGTCCACACAGGTGAGAAGCCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAATCAGACCTTATCGTGCACCAGAGAGTCCACACAGGTGAGAAGCCGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TAAATGCCTGGAATGTATGAGAAGTTTTACTCGGAGTGCCAACCTAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TAAATGCCTGGAATGTATGAGAAGTTTTACTCGGAGTGCCAACCTAATTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GGCACCAGGCAACTCACACTCACACTTTTAAATGCCTTGAATATGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GGCACCAGGCAACTCACACTCACACTTTTAAATGCCTTGAATATGAAAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGCTTTAACTGTAGCTCAGATCTTATTGTACATCAGAGAATTCACATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGCTTTAACTGTAGCTCAGATCTTATTGTACATCAGAGAATTCACATGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AGAGAAACCACATCAGTGGTCTGCGTGTGAGAGTGGCTTCCTCCTAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AGAGAAACCACATCAGTGGTCTGCGTGTGAGAGTGGCTTCCTCCTAGGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGGACTTTGTTGCCCAACAGAAAATGAGAACTCAAACAGAGGAGCTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGGACTTTGTTGCCCAACAGAAAATGAGAACTCAAACAGAGGAGCTACAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TATAAATACACTGTATGTGATAAAAGCTTCCACCAGAGTTCAGCCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TATAAATACACTGTATGTGATAAAAGCTTCCACCAGAGTTCAGCCCTTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TCAACATCAGACAGTACACATTGGTGAAAAACCGTTTGTCTGTAATGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TCAACATCAGACAGTACACATTGGTGAAAAACCGTTTGTCTGTAATGTGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GTGAAAAAGGTCTTGAGCTTAGCCCTCCCCATGCGTCAGAAGCCTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GTGAAAAAGGTCTTGAGCTTAGCCCTCCCCATGCGTCAGAAGCCTCACAG

   1200     .
   1201 ATGTCT
        ||||||
 101201 ATGTCT