seq1 = pF1KB9519.tfa, 1119 bp
seq2 = pF1KB9519/gi568815575f_52976622.tfa (gi568815575f:52976622_53177740), 201119 bp

>pF1KB9519 1119
>gi568815575f:52976622_53177740 (ChrX)

1-1119  (100001-101119)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAACACTACCGGAGAGCCTGAGGAGGTGAGCGGCGCTCTGTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAACACTACCGGAGAGCCTGAGGAGGTGAGCGGCGCTCTGTCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCGTCCGCATCAGCTTATGTGAAGCTGGTACTGCTGGGACTGATTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACCGTCCGCATCAGCTTATGTGAAGCTGGTACTGCTGGGACTGATTATGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGTGAGCCTGGCGGGTAACGCCATCTTGTCCCTGCTGGTGCTCAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGTGAGCCTGGCGGGTAACGCCATCTTGTCCCTGCTGGTGCTCAAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGTGCCCTGCACAAGGCTCCTTACTACTTCCTGCTGGACCTGTGCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGTGCCCTGCACAAGGCTCCTTACTACTTCCTGCTGGACCTGTGCCTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGATGGCATACGCTCTGCCGTCTGCTTCCCCTTTGTGCTGGCTTCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGATGGCATACGCTCTGCCGTCTGCTTCCCCTTTGTGCTGGCTTCTGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCACGGCTCTTCATGGACCTTCAGTGCACTCAGCTGCAAGATTGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCACGGCTCTTCATGGACCTTCAGTGCACTCAGCTGCAAGATTGTGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTATGGCCGTGCTCTTTTGCTTCCATGCGGCCTTCATGCTGTTCTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTATGGCCGTGCTCTTTTGCTTCCATGCGGCCTTCATGCTGTTCTGCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGCGTCACCCGCTACATGGCCATCGCCCACCACCGCTTCTACGCCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGCGTCACCCGCTACATGGCCATCGCCCACCACCGCTTCTACGCCAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCATGACACTCTGGACATGCGCGGCTGTCATCTGCATGGCCTGGACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCATGACACTCTGGACATGCGCGGCTGTCATCTGCATGGCCTGGACCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCTGTGGCCATGGCCTTCCCACCTGTCTTTGACGTGGGCACCTACAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCTGTGGCCATGGCCTTCCCACCTGTCTTTGACGTGGGCACCTACAAGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TATTCGGGAGGAGGACCAGTGCATCTTTGAGCATCGCTACTTCAAGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TATTCGGGAGGAGGACCAGTGCATCTTTGAGCATCGCTACTTCAAGGCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATGACACGCTGGGCTTCATGCTTATGTTGGCTGTGCTCATGGCAGCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATGACACGCTGGGCTTCATGCTTATGTTGGCTGTGCTCATGGCAGCTACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CATGCTGTCTACGGCAAGCTGCTCCTCTTCGAGTATCGTCACCGCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CATGCTGTCTACGGCAAGCTGCTCCTCTTCGAGTATCGTCACCGCAAGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GAAGCCAGTGCAGATGGTGCCAGCCATCAGCCAGAACTGGACATTCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GAAGCCAGTGCAGATGGTGCCAGCCATCAGCCAGAACTGGACATTCCATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTCCCGGGGCCACCGGCCAGGCTGCTGCCAACTGGATCGCCGGCTTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTCCCGGGGCCACCGGCCAGGCTGCTGCCAACTGGATCGCCGGCTTTGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CGTGGGCCCATGCCACCAACCCTGCTGGGTATCCGGCAGAATGGGCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CGTGGGCCCATGCCACCAACCCTGCTGGGTATCCGGCAGAATGGGCATGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGCCAGCCGGCGGCTACTGGGCATGGACGAGGTCAAGGGTGAAAAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGCCAGCCGGCGGCTACTGGGCATGGACGAGGTCAAGGGTGAAAAGCAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGGCCGCATGTTCTACGCGATCACACTGCTCTTTCTGCTCCTCTGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGGCCGCATGTTCTACGCGATCACACTGCTCTTTCTGCTCCTCTGGTCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCCTACATCGTGGCCTGCTACTGGCGAGTGTTTGTGAAAGCCTGTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCCTACATCGTGGCCTGCTACTGGCGAGTGTTTGTGAAAGCCTGTGCTGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCCCCACCGCTACCTGGCCACTGCTGTTTGGATGAGCTTCGCCCAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCCCCACCGCTACCTGGCCACTGCTGTTTGGATGAGCTTCGCCCAGGCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCGTCAACCCAATTGTCTGCTTCCTGCTCAACAAGGACCTCAAGAAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCGTCAACCCAATTGTCTGCTTCCTGCTCAACAAGGACCTCAAGAAGTGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CTGAGGACTCACGCCCCCTGCTGGGGCACAGGAGGTGCCCCGGCTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CTGAGGACTCACGCCCCCTGCTGGGGCACAGGAGGTGCCCCGGCTCCCAG

   1100     .    :    .
   1101 AGAACCCTACTGTGTCATG
        |||||||||||||||||||
 101101 AGAACCCTACTGTGTCATG