seq1 = pF1KB9505.tfa, 675 bp
seq2 = pF1KB9505/gi568815586f_71655175.tfa (gi568815586f:71655175_71885670), 230496 bp

>pF1KB9505 675
>gi568815586f:71655175_71885670 (Chr12)

1-159  (99956-100114)   100% ->
160-219  (114626-114685)   100% ->
220-327  (115418-115525)   100% ->
328-391  (118785-118848)   100% ->
392-446  (126857-126911)   100% ->
447-535  (127396-127484)   100% ->
536-675  (130357-130496)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCGGCCGGCGGCGGCGGCGGCGGGGCGGCGGCGGCGGGCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99956 ATGGCTGCGGCCGGCGGCGGCGGCGGCGGGGCGGCGGCGGCGGGCCGAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTACTCGTTCAAGGTGGTGCTGCTGGGGGAAGGCTGCGTGGGGAAGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100006 CTACTCGTTCAAGGTGGTGCTGCTGGGGGAAGGCTGCGTGGGGAAGACGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCTGGTGCTGCGCTACTGCGAGAACAAGTTTAACGACAAGCACATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100056 CGCTGGTGCTGCGCTACTGCGAGAACAAGTTTAACGACAAGCACATCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACTCTGCAG         GCATCATTCTTAACAAAGAAGTTAAATATTGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100106 ACTCTGCAGGTG...TAGGCATCATTCTTAACAAAGAAGTTAAATATTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGGGAAAAGAGTAAACCTTGCCATATGG         GATACGGCAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 114658 TGGGAAAAGAGTAAACCTTGCCATATGGGTA...TAGGATACGGCAGGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AAGAGAGATTCCATGCATTGGGTCCAATTTACTACAGAGATTCAAATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115431 AAGAGAGATTCCATGCATTGGGTCCAATTTACTACAGAGATTCAAATGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCGATTTTAGTTTATGACATAACAGATGAAGATTCTTTTCAGAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 115481 GCGATTTTAGTTTATGACATAACAGATGAAGATTCTTTTCAGAAGGTA..

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    328     GTAAAAAACTGGGTCAAAGAATTACGGAAAATGTTGGGAAATGAAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115531 .CAGGTAAAAAACTGGGTCAAAGAATTACGGAAAATGTTGGGAAATGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCTGTTTATGTATAGTTG         GTAATAAAATAGACTTGGAAAAG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 118831 TCTGTTTATGTATAGTTGGTA...TAGGTAATAAAATAGACTTGGAAAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GAGAGACATGTTTCCATTCAAGAAGCAGAGTC         GTATGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 126880 GAGAGACATGTTTCCATTCAAGAAGCAGAGTCGTA...AAGGTATGCAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 ATCTGTGGGAGCAAAACATTATCATACTTCAGCCAAACAGAACAAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127405 ATCTGTGGGAGCAAAACATTATCATACTTCAGCCAAACAGAACAAAGGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TTGAGGAACTCTTTCTTGACCTTTGTAAAA         GGATGATAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 127455 TTGAGGAACTCTTTCTTGACCTTTGTAAAAGTA...TAGGGATGATAGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 ACAGCACAAGTGGATGAGAGAGCAAAAGGCAATGGCTCTAGTCAGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130368 ACAGCACAAGTGGATGAGAGAGCAAAAGGCAATGGCTCTAGTCAGCCGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AACTGCAAGGCGAGGTGTACAGATTATTGATGATGAACCTCAAGCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130418 AACTGCAAGGCGAGGTGTACAGATTATTGATGATGAACCTCAAGCCCAGA

    700     .    :    .    :    .
    647 CCAGTGGTGGAGGGTGCTGTTCTTCTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||
 130468 CCAGTGGTGGAGGGTGCTGTTCTTCTGGA