seq1 = pF1KB9498.tfa, 1833 bp
seq2 = pF1KB9498/gi568815591f_104567749.tfa (gi568815591f:104567749_104769570), 201822 bp

>pF1KB9498 1833
>gi568815591f:104567749_104769570 (Chr7)

1-1833  (100001-101824)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCTCAGCAAAAAAGAAGAATAAGAAGGGGAAGACTATCTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCTCAGCAAAAAAGAAGAATAAGAAGGGGAAGACTATCTCCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AACAGACTTTCTGGCTGAGGATGGGGGTACTGGTGGAGGAAGCACCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AACAGACTTTCTGGCTGAGGATGGGGGTACTGGTGGAGGAAGCACCTATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTCCAAACCAGTCAGCTGGGCTGATGAAACGGATGACCTGGAAGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTTCCAAACCAGTCAGCTGGGCTGATGAAACGGATGACCTGGAAGGAGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTTTCGACCACTTGGCACAGTAACGATGACGATGTGTATAGGGCGCCTCC
        ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 100151 GTTTCTACAACTTGGCACAGTAACGATGACGATGTGTACAGGGCGCCTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AATTGACCGTTCCATCCTTCCCACTGCTCCACGGGCTGCTCGGGAACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AATTGACCGTTCCATCCTTCCCACTGCTCCACGGGCTGCTCGGGAACCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATATCGACCGGAGCCGTCTTCCCAAATCGCCACCCTACACTGCTTTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATATCGACCGGAGCCGTCTTCCCAAATCGCCACCCTACACTGCTTTTCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGAAACCTACCCTATGATGTTACAGAAGAGTCAATTAAGGAATTCTTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGAAACCTACCCTATGATGTTACAGAAGAGTCAATTAAGGAATTCTTTCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGGATTAAATATCAGTGCAGTGCGTTTACCACGTGAACCCAGCAATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGGATTAAATATCAGTGCAGTGCGTTTACCACGTGAACCCAGCAATCCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGAGGTTGAAAGGTTTTGGTTATGCTGAATTTGAGGACCTGGATTCCCTG
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGAGGCTGAAAGGTTTTGGTTATGCTGAATTTGAGGACCTGGATTCCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCAGTGCCCTGAGTCTCAATGAAGAGTCTCTAGGTAACAGGAGAATTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 100451 CTCAGTGCCCTGAGTCTCAATGAAGAGTCTCTAAGTAACAGGAGAATTCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGTGGACGTTGCTGATCAAGCACAGGATAAAGACAGGGATGATCGTTCTT
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||
 100501 AGTGGACGTTGCTGATCAAGCACTGGATAAAGACAGGGATGATCCTCCTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTGGCCGTGATAGAAATCGGGATTCTGACAAAACAGATACAGACTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTGGCCGTGATAGAAATCGGGATTCTGACAAAACAGATACAGACTGGAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCTCGTCCTGCTACAGACAGCTTTGATGACTACCCACCTAGAAGAGGTGA
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCTCGTCCTGCTACAGACACCTTTGATGACTACCCACCTAGAAGAGGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGATAGCTTTGGAGACAAGTATCGAGATCGTTATGATTCAGACCGGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||------
 100651 TGATAGCTTTGGAGACAAGTATCGAGATCGTTATGATTCAGACC      

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGGATGGGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGCCCACGCCGGGATATGGAT
        ------||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100695       GGTATCGGGATGGGTATCGGGATGGCCCACGCCGGGATATGGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CGATATGGTGGCCGGGATCGCTATGATGACCGAGGCAGCAGAGACTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100739 CGATATGGTGGCCGGGATCGCTATGATGACCGAGGCAGCAGAGACTATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TAGAGGCTATGATTCCCGGATAGGCAGTGGCAGAAGAGCATTTGGCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100789 TAGAGGCTATGATTCCCGGATAGGCAGTGGCAGAAGAGCATTTGGCAGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GGTATCGCAGGGATGATGACTACAGAGGAGGCGGGGACCGCTATGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||
 100839 GGTATCGCAGGGATGATGACTACAGAGAAGGCAGGGACTGCTATGAAGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CGATATGACAGACGGGATGATCGGTCGTGGAGCTCCAGAGATGATTACTC
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100889 CAATATGACAGACGGGATGATCGGTCGTGGAGCTCCAGAGATGATTACTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TCGGGATGATTATAGGCGTGATGATAGAGGT     CCCCCCCAAAGACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||-----||||||||||||||
 100939 TCGGGATGATTATAGGCGTGATGATAGAGGTCCCCCCCCCCCCAAAGACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    996 CAAACTGAATCTAAAGCCTCGGAGTACTCCTAAGGAAGATGATTCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100989 CAAACTGAATCTAAAGCCTCGGAGTACTCCTAAGGAAGATGATTCCTCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1046 CTAGTACCTCCCAGTCCACTCGAGCTGCTTCTATCTTTGGAGGGGCAAAG
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101039 CTAGTAACTCCCAGTCCACTCGAGCTGCTTCTATCTTTGGAGGGGCAAAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1096 CCTGTTGACACAGCTGCTAGAGAAAGAGAAGTAGAAGAACGGCTACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-|||
 101089 CCTGTTGACACAGCTGCTAGAGAAAGAGAAGTAGAAGAACGGCTAC GAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1146 GGAACAAGAGAAGTTGCAGCGTCAGCTGGATGAGCCAAAACTAGAACGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 101138 GGAACAAGAGAAGTTGCAGCGTCAGCTGGATGGGCCAAAACTAGAACGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1196 GGCCTCGGGAGAGACACCCAAGCTGGCGAAGTGAAGAAACTCAGGAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 101188 GGCCTCGGGAGAGACACCCAAGCTGGCAAAGTGAAGAAACTCAGGAACGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1246 GAACGGTCGAGGACAGGAAGTGAGTCATCACAAACTGGGACCTCCACCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 101238 GAACGGTCGAGGACAGGAAGTGAGTCATCACAGACTGGGACCTCCACCAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1296 ATCTAGCAGAAATGCACGAAGGAGAGAGAGTGAGAAGTCTCTAGAAAATG
        |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 101288 ATCTGGCAGAAATGCATGAAGGAGAGAGAGTGAGAAGTCTCTAGAAAATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1346 AAACACTCAATAAGGAGGAAGATTGCCACTCTCCAACTTCTAAACCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101338 AAACACTCAATAAGGAGGAAGATTGCCACTCTCCAACTTCTAAACCTCCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1396 AAACCTGATCAGCCCCTAAAGGTAATGCCAGCCCCTCCACCAAAGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101388 AAACCTGATCAGCCCCTAAAGGTAATGCCAGCCCCTCCACCAAAGGAGAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1446 TGCTTGGGTGAAGCGAAGTTCTAACCCTCCTGCTCGATCTCAGAGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101438 TGCTTGGGTGAAGCGAAGTTCTAACCCTCCTGCTCGATCTCAGAGCTCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1496 ACACAGAGCAGCAGTCCCCTACAAGTGGTGGGGGAAAAGTAGCTCCAGCT
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101488 ACACAGAGCAGCAATCCCCTACAAGTGGTGGGGGAAAAGTAGCTCCAGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1546 CAACCATCTGAGGAAGGACCAGGAAGGAAAGATGAAAATAAAGTAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101538 CAACCATCTGAGGAAGGACCAGGAAGGAAAGATGAAAATAAAGTAGATGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1596 GATGAATGCCCCAAAAGGCCAAACTGGGAACTCTAGCCGTGGTCCAGGAG
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101588 GATGAATGTCCCAAAAGGCCAAACTGGGAACTCTAGCCGTGGTCCAGGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1646 ACGGAGGGAACAGAGACCACTGGAAGGAGTCAGATAGGAAAGATGGCAAA
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101638 ACTGAGGGAACAGAGACCACTGGAAGGAGTCAGATAGGAAAGATGGCAAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1696 AAGGATCAAGACTCCAGATCTGCACCTGAGCCAAAGAAACCTGAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101688 AAGGATCAAGACTCCAGATCTGCACCTGAGCCAAAGAAACCTGAGGAAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1746 TCCAGCTTCCAAGTTCAGTTCTGCAAGCAAGTATGCTGCTCTCTCTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101738 TCCAGCTTCCAAGTTCAGTTCTGCAAGCAAGTATGCTGCTCTCTCTGTTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .
   1796 ATGGTGAAGATGAAAATGAGGGAGAAGATTATGCCGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||-||
 101788 ATGGTGAAGATGAAAATGAGGGAGAAGATTATGCC AA