Result of SIM4 for
pF1KB9465
seq1 = pF1KB9465.tfa, 3111 bp
seq2 = pF1KB9465/gi568815591r_75438175.tfa (gi568815591r:75438175_75838920), 400746 bp
>pF1KB9465 3111
>gi568815591r:75438175_75838920 (Chr7)
(complement)
1-120 (100001-100120) 100% ->
121-184 (239674-239737) 100% ->
185-327 (246407-246549) 100% ->
328-384 (246809-246865) 100% ->
385-465 (252088-252168) 100% ->
466-542 (256770-256846) 100% ->
543-604 (257623-257684) 100% ->
605-745 (265020-265160) 100% ->
746-803 (270665-270722) 100% ->
804-879 (275658-275733) 100% ->
880-1020 (275846-275986) 100% ->
1021-1118 (276751-276848) 100% ->
1119-1191 (277520-277592) 100% ->
1192-1375 (279006-279189) 100% ->
1376-1464 (280666-280754) 100% ->
1465-1581 (281151-281267) 100% ->
1582-1683 (282110-282211) 100% ->
1684-1827 (282752-282895) 100% ->
1828-1963 (283370-283505) 100% ->
1964-2050 (284395-284481) 100% ->
2051-2158 (284701-284808) 100% ->
2159-2295 (285332-285468) 100% ->
2296-2406 (289920-290030) 100% ->
2407-2465 (291108-291166) 100% ->
2466-2559 (291889-291982) 98% ->
2560-2660 (293733-293833) 100% ->
2661-2766 (294121-294226) 100% ->
2767-2890 (295947-296070) 99% ->
2891-2952 (296941-297002) 100% ->
2953-3061 (299490-299598) 100% ->
3062-3111 (300697-300746) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGATCGGATGGCCAGCTCCATGAAGCAGGTGCCCAACCCACTGCCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGATCGGATGGCCAGCTCCATGAAGCAGGTGCCCAACCCACTGCCCAA
50 . : . : . : . : . :
51 GGTGCTGAGCCGGCGCGGGGTCGGCGCTGGGCTGGAGGCGGCGGAGCGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 GGTGCTGAGCCGGCGCGGGGTCGGCGCTGGGCTGGAGGCGGCGGAGCGCG
100 . : . : . : . : . :
101 AGAGCTTCGAGCGGACTCAG ACTGTCAGCATCAATAAGGCC
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
100101 AGAGCTTCGAGCGGACTCAGGTG...CAGACTGTCAGCATCAATAAGGCC
150 . : . : . : . : . :
142 ATTAATACGCAGGAAGTGGCTGTAAAGGAAAAACACGCCAGAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
239695 ATTAATACGCAGGAAGTGGCTGTAAAGGAAAAACACGCCAGAAATA...C
200 . : . : . : . : . :
185 CGTGCATACTGGGCACCCACCATGAGAAAGGGGCACAGACCTTCTGGT
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246405 ACCGTGCATACTGGGCACCCACCATGAGAAAGGGGCACAGACCTTCTGGT
250 . : . : . : . : . :
233 CTGTTGTCAACCGCCTGCCTCTGTCTAGCAACGCAGTGCTCTGCTGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246455 CTGTTGTCAACCGCCTGCCTCTGTCTAGCAACGCAGTGCTCTGCTGGAAG
300 . : . : . : . : . :
283 TTCTGCCATGTGTTCCACAAACTCCTCCGAGATGGACACCCGAAC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
246505 TTCTGCCATGTGTTCCACAAACTCCTCCGAGATGGACACCCGAACGTG..
350 . : . : . : . : . :
328 GTCCTGAAGGACTCTCTGAGATACAGAAATGAATTGAGTGACATGA
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
246555 .CAGGTCCTGAAGGACTCTCTGAGATACAGAAATGAATTGAGTGACATGA
400 . : . : . : . : . :
374 GCAGGATGTGG GGCCACCTGAGCGAGGGGTATGGCCAGCTG
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
246855 GCAGGATGTGGGTG...AAGGGCCACCTGAGCGAGGGGTATGGCCAGCTG
450 . : . : . : . : . :
415 TGCAGCATCTACCTGAAACTGCTAAGAACCAAGATGGAGTACCACACCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
252118 TGCAGCATCTACCTGAAACTGCTAAGAACCAAGATGGAGTACCACACCAA
500 . : . : . : . : . :
465 A AATCCCAGGTTCCCAGGCAACCTGCAGATGAGTGACCGCC
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
252168 AGTG...CAGAATCCCAGGTTCCCAGGCAACCTGCAGATGAGTGACCGCC
550 . : . : . : . : . :
506 AGCTGGACGAGGCTGGAGAAAGTGACGTGAACAACTT TTTC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
256810 AGCTGGACGAGGCTGGAGAAAGTGACGTGAACAACTTGTA...CAGTTTC
600 . : . : . : . : . :
547 CAGTTAACAGTGGAGATGTTTGACTACCTGGAGTGTGAACTCAACCTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
257627 CAGTTAACAGTGGAGATGTTTGACTACCTGGAGTGTGAACTCAACCTCTT
650 . : . : . : . : . :
597 CCAAACAG TATTCAACTCCCTGGACATGTCCCGCTCTGTGT
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
257677 CCAAACAGGTG...TAGTATTCAACTCCCTGGACATGTCCCGCTCTGTGT
700 . : . : . : . : . :
638 CCGTGACGGCAGCAGGGCAGTGCCGCCTCGCCCCGCTGATCCAGGTCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
265053 CCGTGACGGCAGCAGGGCAGTGCCGCCTCGCCCCGCTGATCCAGGTCATC
750 . : . : . : . : . :
688 TTGGACTGCAGCCACCTTTATGACTACACTGTCAAGCTTCTCTTCAAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
265103 TTGGACTGCAGCCACCTTTATGACTACACTGTCAAGCTTCTCTTCAAACT
800 . : . : . : . : . :
738 CCACTCCT GCCTCCCAGCTGACACCCTGCAAGGCCACCGGG
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
265153 CCACTCCTGTG...CAGGCCTCCCAGCTGACACCCTGCAAGGCCACCGGG
850 . : . : . : . : . :
779 ACCGCTTCATGGAGCAGTTTACAAA GTTGAAAGATCTGTTC
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
270698 ACCGCTTCATGGAGCAGTTTACAAAGTA...TAGGTTGAAAGATCTGTTC
900 . : . : . : . : . :
820 TACCGCTCCAGCAACCTGCAGTACTTCAAGCGGCTCATTCAGATCCCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
275674 TACCGCTCCAGCAACCTGCAGTACTTCAAGCGGCTCATTCAGATCCCCCA
950 . : . : . : . : . :
870 GCTGCCTGAG AACCCACCCAACTTCCTGCGAGCCTCAGCCC
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
275724 GCTGCCTGAGGTA...CAGAACCCACCCAACTTCCTGCGAGCCTCAGCCC
1000 . : . : . : . : . :
911 TGTCAGAACATATCAGCCCTGTGGTGGTGATCCCTGCAGAGGCCTCATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
275877 TGTCAGAACATATCAGCCCTGTGGTGGTGATCCCTGCAGAGGCCTCATCC
1050 . : . : . : . : . :
961 CCCGACAGCGAGCCAGTCCTAGAGAAGGATGACCTCATGGACATGGATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
275927 CCCGACAGCGAGCCAGTCCTAGAGAAGGATGACCTCATGGACATGGATGC
1100 . : . : . : . : . :
1011 CTCTCAGCAG AATTTATTTGACAACAAGTTTGATGACATCT
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
275977 CTCTCAGCAGGTG...CAGAATTTATTTGACAACAAGTTTGATGACATCT
1150 . : . : . : . : . :
1052 TTGGCAGTTCATTCAGCAGTGATCCCTTCAATTTCAACAGTCAAAATGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
276782 TTGGCAGTTCATTCAGCAGTGATCCCTTCAATTTCAACAGTCAAAATGGT
1200 . : . : . : . : . :
1102 GTGAACAAGGATGAGAA GGACCACTTAATTGAGCGACTATA
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
276832 GTGAACAAGGATGAGAAGTG...CAGGGACCACTTAATTGAGCGACTATA
1250 . : . : . : . : . :
1143 CAGAGAGATCAGTGGATTGAAGGCACAGCTAGAAAACATGAAGACTGAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
277544 CAGAGAGATCAGTGGATTGAAGGCACAGCTAGAAAACATGAAGACTGAGG
1300 . : . : . : . : . :
1192 AGCCAGCGGGTTGTGCTGCAGCTGAAGGGCCACGTCAGCGAG
>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
277594 TA...CAGAGCCAGCGGGTTGTGCTGCAGCTGAAGGGCCACGTCAGCGAG
1350 . : . : . : . : . :
1234 CTGGAAGCAGATCTGGCCGAGCAGCAGCACCTGCGGCAGCAGGCGGCCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
279048 CTGGAAGCAGATCTGGCCGAGCAGCAGCACCTGCGGCAGCAGGCGGCCGA
1400 . : . : . : . : . :
1284 CGACTGTGAATTCCTGCGGGCAGAACTGGACGAGCTCAGGAGGCAGCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
279098 CGACTGTGAATTCCTGCGGGCAGAACTGGACGAGCTCAGGAGGCAGCGGG
1450 . : . : . : . : . :
1334 AGGACACCGAGAAGGCTCAGCGGAGCCTGTCTGAGATAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
279148 AGGACACCGAGAAGGCTCAGCGGAGCCTGTCTGAGATAGAAAGTG...CA
1500 . : . : . : . : . :
1376 GGAAAGCTCAAGCCAATGAACAGCGATATAGCAAGCTAAAGGAGAAGTA
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280665 GGGAAAGCTCAAGCCAATGAACAGCGATATAGCAAGCTAAAGGAGAAGTA
1550 . : . : . : . : . :
1425 CAGCGAGCTGGTTCAGAACCACGCTGACCTGCTGCGGAAG A
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
280715 CAGCGAGCTGGTTCAGAACCACGCTGACCTGCTGCGGAAGGTA...CAGA
1600 . : . : . : . : . :
1466 ATGCAGAGGTGACCAAACAGGTGTCCATGGCCAGACAAGCCCAGGTAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
281152 ATGCAGAGGTGACCAAACAGGTGTCCATGGCCAGACAAGCCCAGGTAGAT
1650 . : . : . : . : . :
1516 TTGGAACGAGAGAAAAAAGAGCTGGAGGATTCGTTGGAGCGCATCAGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
281202 TTGGAACGAGAGAAAAAAGAGCTGGAGGATTCGTTGGAGCGCATCAGTGA
1700 . : . : . : . : . :
1566 CCAGGGCCAGCGGAAG ACTCAAGAACAGCTGGAAGTTCTAG
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
281252 CCAGGGCCAGCGGAAGGTG...CAGACTCAAGAACAGCTGGAAGTTCTAG
1750 . : . : . : . : . :
1607 AGAGCTTGAAGCAGGAACTTGCCACAAGCCAACGGGAGCTTCAGGTTCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
282135 AGAGCTTGAAGCAGGAACTTGCCACAAGCCAACGGGAGCTTCAGGTTCTG
1800 . : . : . : . : . :
1657 CAAGGCAGCCTGGAAACTTCTGCCCAG TCAGAAGCAAACTG
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
282185 CAAGGCAGCCTGGAAACTTCTGCCCAGGTA...CAGTCAGAAGCAAACTG
1850 . : . : . : . : . :
1698 GGCAGCCGAGTTCGCCGAGCTAGAGAAGGAGCGGGACAGCCTGGTGAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
282766 GGCAGCCGAGTTCGCCGAGCTAGAGAAGGAGCGGGACAGCCTGGTGAGTG
1900 . : . : . : . : . :
1748 GCGCAGCTCATAGGGAGGAGGAATTATCTGCTCTTCGGAAAGAACTGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
282816 GCGCAGCTCATAGGGAGGAGGAATTATCTGCTCTTCGGAAAGAACTGCAG
1950 . : . : . : . : . :
1798 GACACTCAGCTCAAACTGGCCAGCACAGAG GAATCTATGTG
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
282866 GACACTCAGCTCAAACTGGCCAGCACAGAGGCA...TAGGAATCTATGTG
2000 . : . : . : . : . :
1839 CCAGCTTGCCAAAGACCAACGAAAAATGCTTCTGGTGGGGTCCAGGAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
283381 CCAGCTTGCCAAAGACCAACGAAAAATGCTTCTGGTGGGGTCCAGGAAGG
2050 . : . : . : . : . :
1889 CTGCGGAGCAGGTGATACAAGACGCCCTGAACCAGCTTGAAGAACCTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
283431 CTGCGGAGCAGGTGATACAAGACGCCCTGAACCAGCTTGAAGAACCTCCT
2100 . : . : . : . : . :
1939 CTCATCAGCTGCGCTGGGTCTGCAG ATCACCTCCTCTCCAC
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
283481 CTCATCAGCTGCGCTGGGTCTGCAGGTA...CAGATCACCTCCTCTCCAC
2150 . : . : . : . : . :
1980 GGTCACATCCATTTCCAGCTGCATCGAGCAACTGGAGAAAAGCTGGAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
284411 GGTCACATCCATTTCCAGCTGCATCGAGCAACTGGAGAAAAGCTGGAGCC
2200 . : . : . : . : . :
2030 AGTATCTGGCCTGCCCAGAAG ACATCAGTGGACTTCTCCAT
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
284461 AGTATCTGGCCTGCCCAGAAGGTA...CAGACATCAGTGGACTTCTCCAT
2250 . : . : . : . : . :
2071 TCCATAACCCTGCTGGCCCACTTGACCAGCGACGCCATTGCTCATGGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
284721 TCCATAACCCTGCTGGCCCACTTGACCAGCGACGCCATTGCTCATGGTGC
2300 . : . : . : . : . :
2121 CACCACCTGCCTCAGAGCCCCACCTGAGCCTGCCGACT CAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
284771 CACCACCTGCCTCAGAGCCCCACCTGAGCCTGCCGACTGTG...CAGCAC
2350 . : . : . : . : . :
2162 TGACCGAGGCCTGTAAGCAGTATGGCAGGGAAACCCTCGCCTACCTGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285335 TGACCGAGGCCTGTAAGCAGTATGGCAGGGAAACCCTCGCCTACCTGGCC
2400 . : . : . : . : . :
2212 TCCCTGGAGGAAGAGGGAAGCCTTGAGAATGCCGACAGCACAGCCATGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285385 TCCCTGGAGGAAGAGGGAAGCCTTGAGAATGCCGACAGCACAGCCATGAG
2450 . : . : . : . : . :
2262 GAACTGCCTGAGCAAGATCAAGGCCATCGGCGAG GAGCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
285435 GAACTGCCTGAGCAAGATCAAGGCCATCGGCGAGGTA...CAGGAGCTCC
2500 . : . : . : . : . :
2303 TGCCCAGGGGACTGGACATCAAGCAGGAGGAGCTGGGGGACCTGGTGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289927 TGCCCAGGGGACTGGACATCAAGCAGGAGGAGCTGGGGGACCTGGTGGAC
2550 . : . : . : . : . :
2353 AAGGAGATGGCGGCCACTTCAGCTGCTATTGAAACTGCCACGGCCAGAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
289977 AAGGAGATGGCGGCCACTTCAGCTGCTATTGAAACTGCCACGGCCAGAAT
2600 . : . : . : . : . :
2403 AGAG GAGATGCTCAGCAAATCCCGAGCAGGAGACACAGGAG
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
290027 AGAGGTA...CAGGAGATGCTCAGCAAATCCCGAGCAGGAGACACAGGAG
2650 . : . : . : . : . :
2444 TCAAATTGGAGGTGAATGAAAG GATCCTTGGTTGCTGTACC
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
291145 TCAAATTGGAGGTGAATGAAAGGTC...CAGGATCCTTGGTTGCTGTACC
2700 . : . : . : . : . :
2485 AGCCTCATGCAGGCTATTCAGGTGCTCATCGTGGCCTCTAAGGACCTCCA
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
291908 AGCCTCATGCAAGCTATTCAGGTGCTCATCGTGGCCTCTAAGGACCTCCA
2750 . : . : . : . : . :
2535 GAGAGAGATTGTGGAGAGCGGCAGG GGTACAGCATCCCCTA
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
291958 GAGAGAGATTGTGGAGAGCGGCAGGGTG...TAGGGTACAGCATCCCCTA
2800 . : . : . : . : . :
2576 AAGAGTTTTATGCCAAGAACTCTCGATGGACAGAAGGACTTATCTCAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
293749 AAGAGTTTTATGCCAAGAACTCTCGATGGACAGAAGGACTTATCTCAGCC
2850 . : . : . : . : . :
2626 TCCAAGGCTGTGGGCTGGGGAGCCACTGTCATGGT GGATGC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
293799 TCCAAGGCTGTGGGCTGGGGAGCCACTGTCATGGTGTA...CAGGGATGC
2900 . : . : . : . : . :
2667 AGCTGATCTGGTGGTACAAGGCAGAGGGAAATTTGAGGAGCTAATGGTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294127 AGCTGATCTGGTGGTACAAGGCAGAGGGAAATTTGAGGAGCTAATGGTGT
2950 . : . : . : . : . :
2717 GTTCTCATGAAATTGCTGCTAGCACAGCCCAGCTTGTGGCTGCATCCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294177 GTTCTCATGAAATTGCTGCTAGCACAGCCCAGCTTGTGGCTGCATCCAAG
3000 . : . : . : . : . :
2767 GTGAAAGCTGATAAGGACAGCCCTAACCTAGCCCAGCTGCA
>>>...>>>||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
294227 GTA...TAGGTGAAAGCTGATAAGGACAGCCCCAACCTAGCCCAGCTGCA
3050 . : . : . : . : . :
2808 GCAGGCCTCTCGGGGAGTGAACCAGGCCACTGCCGGCGTTGTGGCCTCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
295988 GCAGGCCTCTCGGGGAGTGAACCAGGCCACTGCCGGCGTTGTGGCCTCAA
3100 . : . : . : . : . :
2858 CCATTTCCGGCAAATCACAGATCGAAGAGACAG ACAACATG
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
296038 CCATTTCCGGCAAATCACAGATCGAAGAGACAGGTA...CAGACAACATG
3150 . : . : . : . : . :
2899 GACTTCTCAAGCATGACGCTGACACAGATCAAACGCCAAGAGATGGATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
296949 GACTTCTCAAGCATGACGCTGACACAGATCAAACGCCAAGAGATGGATTC
3200 . : . : . : . : . :
2949 TCAG GTTAGGGTGCTAGAGCTAGAAAATGAATTGCAGAAGG
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
296999 TCAGGTG...CAGGTTAGGGTGCTAGAGCTAGAAAATGAATTGCAGAAGG
3250 . : . : . : . : . :
2990 AGCGTCAAAAACTGGGAGAGCTTCGGAAAAAGCACTACGAGCTTGCTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
299527 AGCGTCAAAAACTGGGAGAGCTTCGGAAAAAGCACTACGAGCTTGCTGGT
3300 . : . : . : . : . :
3040 GTTGCTGAGGGCTGGGAAGAAG GAACAGAGGCATCTCCACC
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
299577 GTTGCTGAGGGCTGGGAAGAAGGTA...TAGGAACAGAGGCATCTCCACC
3350 . : . : . :
3081 TACACTGCAAGAAGTGGTAACCGAAAAAGAA
|||||||||||||||||||||||||||||||
300716 TACACTGCAAGAAGTGGTAACCGAAAAAGAA