seq1 = pF1KB9420.tfa, 1569 bp
seq2 = pF1KB9420/gi568815586r_96180807.tfa (gi568815586r:96180807_96434836), 254030 bp

>pF1KB9420 1569
>gi568815586r:96180807_96434836 (Chr12)

(complement)

1-118  (100001-100118)   100% ->
119-283  (110725-110889)   100% ->
284-417  (121383-121516)   100% ->
418-543  (123660-123785)   100% ->
544-600  (134477-134533)   100% ->
601-715  (135854-135968)   100% ->
716-810  (137116-137210)   100% ->
811-873  (137505-137567)   100% ->
874-997  (139715-139838)   100% ->
998-1118  (145550-145670)   100% ->
1119-1216  (148076-148173)   100% ->
1217-1322  (148689-148794)   100% ->
1323-1365  (151192-151234)   100% ->
1366-1456  (152238-152328)   100% ->
1457-1534  (153952-154029)   100% ->
1535-1569  (154558-154592)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAAAATTTAAGAGAAGGCTATCCCTCACACTCCGAGGAAGTCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAAAATTTAAGAGAAGGCTATCCCTCACACTCCGAGGAAGTCAGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATTGATGAATCATTGTCTGAATTGGCTGAACAAATGACTATTGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATTGATGAATCATTGTCTGAATTGGCTGAACAAATGACTATTGAAGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAGCAGCAAGGATAATG         AGCCTATTGTGAAGAATGGCAGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100101 ACAGCAGCAAGGATAATGGTA...CAGAGCCTATTGTGAAGAATGGCAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTCCAACGTCTCACAGTATGCATTCCTTCCTCCACCAGTACACAGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110748 CCTCCAACGTCTCACAGTATGCATTCCTTCCTCCACCAGTACACAGGATC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTTCAAGAAGCCCCCATTGCGGAGACCACACAGTGTTATTGGAGGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110798 TTTCAAGAAGCCCCCATTGCGGAGACCACACAGTGTTATTGGAGGGAGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTGGCTCCTTCATGGCAATGCCCAGAAATGGAAGCAGATTAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 110848 TTGGCTCCTTCATGGCAATGCCCAGAAATGGAAGCAGATTAGGTA...TA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    284  ATATTGTTCATGAAAATCTAAAAATGGGATCAGATGGTGAGAGTGACCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121382 GATATTGTTCATGAAAATCTAAAAATGGGATCAGATGGTGAGAGTGACCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGCTTCTGGGACATCATCTGATGAAGTCCAGTCACCTACAGGTGTTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121432 AGCTTCTGGGACATCATCTGATGAAGTCCAGTCACCTACAGGTGTTTGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCAGAAATCGTATACATAGACGGATCTCAATGGAG         GATTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 121482 TCAGAAATCGTATACATAGACGGATCTCAATGGAGGTA...AAGGATTTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AATAAGCGGTTATCACTGCCTGCAGACATCAGAATACCTGATGGATATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123666 AATAAGCGGTTATCACTGCCTGCAGACATCAGAATACCTGATGGATATCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGAAAAGTTGCAGATAAACAGTCCACCATTTGACCAACCAATGAGTCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123716 TGAAAAGTTGCAGATAAACAGTCCACCATTTGACCAACCAATGAGTCGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGTCTCGTAGAGCTTCCTTA         TCAGAAATTGGCTTTGGAAAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 123766 GGTCTCGTAGAGCTTCCTTAGTA...CAGTCAGAAATTGGCTTTGGAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATGGAAACCTACATCAAATTGGAAAAGCTTGGAGAG         GGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 134498 ATGGAAACCTACATCAAATTGGAAAAGCTTGGAGAGGTA...TAGGGTAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ATATGCAACAGTATATAAAGGAAGAAGTAAATTGACAGAGAATTTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135859 ATATGCAACAGTATATAAAGGAAGAAGTAAATTGACAGAGAATTTGGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CATTAAAAGAGATCCGATTGGAACATGAAGAAGGTGCACCCTGCACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135909 CATTAAAAGAGATCCGATTGGAACATGAAGAAGGTGCACCCTGCACAGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATAAGAGAAG         TTTCACTATTAAAGGATTTAAAACATGCAAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 135959 ATAAGAGAAGGTA...CAGTTTCACTATTAAAGGATTTAAAACATGCAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TATAGTAACCTTACATGACATTGTTCACACAGATAAATCCTTGACTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137147 TATAGTAACCTTACATGACATTGTTCACACAGATAAATCCTTGACTTTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGTTTGAGTATCTG         GATAAAGACCTGAAACAGTACATGGAT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 137197 TGTTTGAGTATCTGGTA...CAGGATAAAGACCTGAAACAGTACATGGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GACTGTGGAAACATCATGAGTATGCACAACGTAAAG         CTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 137532 GACTGTGGAAACATCATGAGTATGCACAACGTAAAGGTA...TAGCTGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TCTGTACCAAATTCTACGTGGTTTGGCATATTGCCATAGAAGAAAGGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139720 TCTGTACCAAATTCTACGTGGTTTGGCATATTGCCATAGAAGAAAGGTAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TGCATCGAGACTTGAAACCACAGAACCTCCTCATTAATGAGAAAGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139770 TGCATCGAGACTTGAAACCACAGAACCTCCTCATTAATGAGAAAGGAGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TTAAAGCTAGCAGATTTTG         GACTAGCCCGAGCCAAGTCAGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 139820 TTAAAGCTAGCAGATTTTGGTA...AAGGACTAGCCCGAGCCAAGTCAGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TCCCACAAAGACCTACTCAAATGAAGTTGTCACACTATGGTACCGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145572 TCCCACAAAGACCTACTCAAATGAAGTTGTCACACTATGGTACCGGCCAC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CTGATGTGCTTCTTGGTTCCTCGGAGTACTCAACACAGATTGACATGTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 145622 CTGATGTGCTTCTTGGTTCCTCGGAGTACTCAACACAGATTGACATGTGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1119         GGGTGTTGGTTGCATTTTCTTTGAAATGGCTTCTGGAAGACC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145672 TA...AAGGGGTGTTGGTTGCATTTTCTTTGAAATGGCTTCTGGAAGACC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TTTATTTCCAGGATCAACCGTGGAAGATGAACTGCACTTAATTTTCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148118 TTTATTTCCAGGATCAACCGTGGAAGATGAACTGCACTTAATTTTCCGAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TGCTAG         GAACTCCATCTCAGGAAACTTGGCCAGGTATTTCT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148168 TGCTAGGTA...CAGGAACTCCATCTCAGGAAACTTGGCCAGGTATTTCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 TCAAATGAGGAGTTCAAGAACTACAACTTTCCAAAATATAAACCACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148724 TCAAATGAGGAGTTCAAGAACTACAACTTTCCAAAATATAAACCACAGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 TCTAATTAACCACGCACCCAG         GTTAGACTCTGAAGGAATTG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 148774 TCTAATTAACCACGCACCCAGGTA...TAGGTTAGACTCTGAAGGAATTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 AGTTGATAACAAAATTTCTTCAG         TATGAATCTAAGAAAAGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 151212 AGTTGATAACAAAATTTCTTCAGGTA...CAGTATGAATCTAAGAAAAGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 GTTTCAGCTGAAGAGGCCATGAAACATGTGTACTTTCGAAGTCTGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152256 GTTTCAGCTGAAGAGGCCATGAAACATGTGTACTTTCGAAGTCTGGGACC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 AAGAATACATGCTTTACCAGAAA         GTGTATCAATATTCAGTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 152306 AAGAATACATGCTTTACCAGAAAGTA...TAGGTGTATCAATATTCAGTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 TGAAAGAGATTCAGTTGCAAAAGGACCCGGGTTTTCGAAATTCTTCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153970 TGAAAGAGATTCAGTTGCAAAAGGACCCGGGTTTTCGAAATTCTTCTTAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 CCAGAGACAG         GACATGGGAAGAACAGAAGACAGAGCATGCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 154020 CCAGAGACAGGTG...TAGGACATGGGAAGAACAGAAGACAGAGCATGCT

   1700 
   1566 CTTT
        ||||
 154589 CTTT