seq1 = pF1KB9261.tfa, 612 bp
seq2 = pF1KB9261/gi568815578f_37803351.tfa (gi568815578f:37803351_38044250), 240900 bp

>pF1KB9261 612
>gi568815578f:37803351_38044250 (Chr20)

1-121  (100001-100121)   100% ->
122-291  (128285-128454)   100% ->
292-342  (130189-130239)   100% ->
343-612  (140631-140900)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGCCCCGCTCGCCGTAGCGCTGGGCGCCCTCCACTACCTGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGCCCCGCTCGCCGTAGCGCTGGGCGCCCTCCACTACCTGGCACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTCCTGCAACTCGGCGGCGCCACGCGGCCCGCCGGCCACGCGCCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTCCTGCAACTCGGCGGCGCCACGCGGCCCGCCGGCCACGCGCCCTGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAACCACGTCTCCGGCCACG         CCCTGTTCACAGAGACACCC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100101 ACAACCACGTCTCCGGCCACGGTG...CAGCCCTGTTCACAGAGACACCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CATGACATGACAGCACGGACGGGCGAGGACGTGGAGATGGCCTGCTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128305 CATGACATGACAGCACGGACGGGCGAGGACGTGGAGATGGCCTGCTCCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCGCGGCAGCGGCTCCCCCTCCTACTCGCTGGAGATCCAGTGGTGGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128355 CCGCGGCAGCGGCTCCCCCTCCTACTCGCTGGAGATCCAGTGGTGGTATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TACGGAGCCACCGGGACTGGACCGACAAGCAGGCGTGGGCCTCGAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128405 TACGGAGCCACCGGGACTGGACCGACAAGCAGGCGTGGGCCTCGAACCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292          CTAAAAGCATCTCAGCAGGAAGACGCAGGGAAGGAGGCAAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128455 GTA...CAGCTAAAAGCATCTCAGCAGGAAGACGCAGGGAAGGAGGCAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAAAATAAGT         GTGGTCAAGGTGGTGGGCAGCAACATCTCCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 130230 CAAAATAAGTGTG...CAGGTGGTCAAGGTGGTGGGCAGCAACATCTCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACAAGCTGCGCCTGTCCCGGGTGAAGCCCACGGACGAAGGCACCTACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140662 ACAAGCTGCGCCTGTCCCGGGTGAAGCCCACGGACGAAGGCACCTACGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TGCCGCGTCATCGACTTCAGCGACGGCAAGGCCCGGCACCACAAGGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140712 TGCCGCGTCATCGACTTCAGCGACGGCAAGGCCCGGCACCACAAGGTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGCCTACCTGCGGGTGCAGCCAGGGGAGAACTCCGTCCTGCATCTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140762 GGCCTACCTGCGGGTGCAGCCAGGGGAGAACTCCGTCCTGCATCTGCCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAGCCCCTCCCGCCGCGCCCGCCCCGCCGCCCCCCAAGCCAGGCAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140812 AAGCCCCTCCCGCCGCGCCCGCCCCGCCGCCCCCCAAGCCAGGCAAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .
    574 CTGAGGAAGCGCTCGGTGGACCAGGAGGCCTGCAGCCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140862 CTGAGGAAGCGCTCGGTGGACCAGGAGGCCTGCAGCCTC