seq1 = pF1KB9116.tfa, 2316 bp
seq2 = pF1KB9116/gi568815581r_33937624.tfa (gi568815581r:33937624_34139872), 202249 bp

>pF1KB9116 2316
>gi568815581r:33937624_34139872 (Chr17)

(complement)

1-1122  (100001-101121)   98% ==
1200-2316  (101133-102249)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGAAGAATTGCATAGCCTGGACCCACGACGGCAGGAATTATTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 100001 ATGATGGAAGAATTGCATAGCCTGGACCCACGACGGCAGAAATTATTGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCAGGTTTACTGGAGTAGGTGTTAGTAAGGGACCACTTAATAGTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCAGGTTTACTGGAGTAGGTGTTAGTAAGGGACCACTTAATAGTGAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTCCAACCAGAGCTTGTGCAGCGTCGGATCCTTGAGTGATAAAGAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTTCCAACCAGAGCTTGTGCAGCGTCGGATCCTTGAGTGATAAAGAAGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGACTCCCGAGAAAAAGCAGAATGACCAGCGAAATCGGAAAAGAAAAGC
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGACTCCCAAGAAAAAGCAGAATGACCAGCGAAATCGGAAAAGAAAAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGAACCATATGAAACTAGCCAAGGGAAAGGCACTCCTAGGGGACATAAAA
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGAACCATATGAAAGTAGCCAAGGGAAAGGCACTCCTAGGGGACATAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTAGTGATTACTTTGAGTTTGCTGGGGGAAGCGCGCCAGGAACCAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||
 100251 TTAGTGATTACTTTGAGTTTGCTGGGGGAAGCGGGCCGGGAACCAGCCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCAGAAGTGTTCCACCAGTTGCACGATCCTCACCGCAACATTCCTTATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 100301 GGCAGAAGTGTTCCACCAGTTGCACGATCCTCACTGCAACATTCCTTATC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAATCCCTTACCGCGACGAGTAGAACAGCCCCTCTATGGTTTAGATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAATCCCTTACCGCGACGAGTAGAACAGCCCCTCTATGGTTTAGATGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGCTGCAAAGGAGGCAACGGAGGAGCAGTCTGCTCTGCCAACCCTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTGCTGCAAAGGAGGCAACGGAGGAGCAGTCTGCTCTGCCAACCCTCATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCAGTGATGCTAGCAAAACCTCGGCTTGACACAGAGCAGCTGGCGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCAGTGATGCTAGCAAAACCTCGGCTTGACACAGAGCAGCTGGCGCAAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGGAGCTGGCCTCTGCTTCACTTTTGTTTCAGCTCAGCAAAACAGTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGGAGCTGGCCTCTGCTTCACTTTTGTTTCAGCTCAGCAAAACAGTCCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CATCTACGGGATCTGGCAACACAGAGCATTCCTGCAGCTCCCAAAAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CATCTACGGGATCTGGCAACACAGAGCATTCCTGCAGCTCCCAAAAACAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCTCCATCCAGCACAGACAGACCCAGTCCGACCTCACAATAGAAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCTCCATCCAGCACAGACAGACCCAGTCCGACCTCACAATAGAAAAAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ATCTGCACTAGAAAACAGTAAGAATTCTGACTTAGAGAAGAAGGAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ATCTGCACTAGAAAACAGTAAGAATTCTGACTTAGAGAAGAAGGAGGGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GAATAGATGATTTATTAAGAGCCAACTGTGATTTGAGACGGCAGATTGAT
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 100701 GAATAGATGATTTATTAAGAGCCATCTGTGATTTGAGACGGCAGATTGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAACAGCAAAAGATGCTAGAGAAATACAAGGAACGATTAAATAGATGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAACAGCAAAAGATGCTAGAGAAATACAAGGAACGATTAAATAGATGTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GACAATGAGCAAGAAACTCCTTATAGAAAAGTCAAAACAAGAGAAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GACAATGAGCAAGAAACTCCTTATAGAAAAGTCAAAACAAGAGAAGATGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CGTGTAGAGATAAGAGCATGCAAGACCGCTTGAGACTGGGCCACTTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100851 CGTGTAGAGATAAGAGCATGCAAGACCGCTTGAGACTGGGCTACTTTACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACTGTCCGACACGGAGCCTCATTTACTGAACAGTGGACAGATGGTTATGC
        ||-|||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||
 100901 AC GTCCGACACGGAGCCAAATTTACTGAGCAGTGGACAGATGGTTATGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TTTTCAGAATCTTATCAAGCAACAGGAAAGGATAAATTCACAGAGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100950 TTTTCAGAATCTTATCAAGCAACAGGAAAGGATAAATTCACAGAGGGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGATAGAAAGACAACGGAAAATGTTAGCAAAGCGGAAACCTCCTGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101000 AGATAGAAAGACAACGGAAAATGTTAGCAAAGCGGAAACCTCCTGCCATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GGTCAGGCCCCTCCTGCAACCAATGAGCAGAAACAGCGGAAAAGCAAGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 101050 GGTCAGGCCCCTCCTGCAACCAATGAGCAGAAACAGTGGAAAAGCAAGAC

   1100     .    :    .    :
   1101 CAATGGAGCTGAAAATGAAACG
        ||||||||||||||||||||||
 101100 CAATGGAGCTGAAAATGAAACG

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1200 AGAATACCATGAACAAGAAGAAATCTTCAAACTCAGATTAGGTCATCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101133 AGAATACCATGAACAAGAAGAAATCTTCAAACTCAGATTAGGTCATCTTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1250 AAAAGGAGGAAGCAGAGATCCAGGCAGAGCTGGAGAGACTAGAAAGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 101183 AAAAGGAGGAAGCAGAGATCCAGGCAGAGCTGGAGAGGCTAGAAAGGGTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1300 AGAAATCTACATATCAGGGAACTAAAAAGGATACATAATGAAGATAATTC
        ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 101233 AGAAAACTACATATCAGGGAAGTAAAAAGGATACATAATGAAGATAATTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1350 ACAATTTAAAGATCATCCAACGCTAAATGACAGATATTTGTTGTTACATC
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101283 ACAATTTAAATATCATCCAACGCTAAATGACAGATATTTGTTGTTACATC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1400 TTTTGGGTAGAGGAGGTTTCAGTGAAGTTTACAAGGCATTTGATCTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101333 TTTTGGGTAGAGGAGGTTTCAGTGAAGTTTACAAGGCATTTGATCTAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1450 GAGCAAAGATACGTAGCTGTGAAAATTCACCAGTTAAATAAAAACTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101383 GAGCAAAGATACGTAGCTGTGAAAATTCACCAGTTAAATAAAAACTGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1500 AGATGAGAAAAAGGAGAATTACCACAAGCATGCATGTAGGGAATACCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101433 AGATGAGAAAAAGGAGAATTACCACAAGCATGCATGTAGGGAATACCGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1550 TTCATAAAGAGCTGGATCATCCCAGAATAGTTAAGCTGTATGATTACTTT
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 101483 TTCATAAAGAGCTGGACCATCCCAGAATAGTTAAGCTGTATGATTACTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1600 TCACTGGATACTGACTCGTTTTGTACAGTATTAGAATACTGTGAGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101533 TCACTGGATACTGACTCGTTTTGTACAGTATTAGAATACTGTGAGGGAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1650 TGATCTGGACTTCTACCTGAAACAGCACAAATTAATGTCGGAGAAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 101583 TGATCTGGACTTCTACCTGAAACAGCACAAATTAATGTCAGAGAAAGAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1700 CCCGGTCCATTATCATGCAGATTGTGAATGCTTTAAAGTACTTAAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101633 CCCGGTCCATTATCATGCAGATTGTGAATGCTTTAAAGTACTTAAATGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1750 ATAAAACCTCCCATCATACACTATGACCTCAAACCAGGTAATATTCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101683 ATAAAACCTCCCATCATACACTATGACCTCAAACCAGGTAATATTCTTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1800 AGTAAATGGTACAGCGTGTGGAGAGATAAAAATTACAGATTTTGGTCTTT
        || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101733 AGAAAATGGTACAGGGTGTGGAGAGATAAAAATTACAGATTTTGGTCTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1850 CGAAGATCATGGATGATGATAGCTACAATTCAGTGGATGGCATGGAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101783 CGAAGATCATGGATGATGATAGCTACAATTCAGTGGATGGCATGGAGCTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1900 ACATCACAAGGTGCTGGTACTTATTGGTATTTACCACCGGAGTGTTTTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 101833 ACATCACAAGGTGCTGGTACTTATTGGTATTTACCACCAGAGTGTTTTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1950 GGTTGGGAAAGAACCACCAAAGATCTCAAATAAAGTTGATGTGTGGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101883 GGTTGGGAAAGAACCACCAAAGATCTCAAATAAAGTTGATGTGTGGTCGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2000 TGGGTGTGATCTTCTATCAGTGTCTTTATGGAAGGAAGCCTTTTGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101933 TGGGTGTGATCTTCTATCAGTGTCTTTATGGAAGGAAGCCTTTTGGCCAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2050 AACCAGTCTCAGCAAGACATCCTACAAGAGAATACGATTCTTAAAGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101983 AACCAGTCTCAGCAAGACATCCTACAAGAGAATACGATTCTTAAAGCTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2100 TGAAGTGCAGTTCCCGCCAAAGCCAGTAGTAACACCTGAAGCAAAGGCGT
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 102033 TGAAGTGCAGTTCCCGCCAAAGCCGGTAGTAACACCTGAAGCAAAGGCGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2150 TTATTCGACGATGCTTGGCCTACCGAAAGGAGGACCGCATTGATGTCCAG
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102083 TGATTCGACGATGCTTGGCCTACCGAAAGGAGGACCGCATTGATGTCCAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2200 CAGCTGGCCTGTGATCCCTACTTGTTGCCTCACATCCGAAAGTCAGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 102133 CAGCTGGCCTGTGATCCCTACTTGTTGCCTCACATCCAAAAGTCAGTCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2250 TACAAGTAGCCCTGCTGGAGCTGCTATTGCATCAACCTCTGGGGCGTCCA
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102183 TACGAGTAGCCCTGCTGGAGCTGCTATTGCATCAACCTCTGGGGCGTCCA

   1100     .    :    .
   2300 ATAACAGTTCTTCTAAT
        |||||||||||||||||
 102233 ATAACAGTTCTTCTAAT