seq1 = pF1KB9104.tfa, 1623 bp
seq2 = pF1KB9104/gi568815581r_43777810.tfa (gi568815581r:43777810_43998378), 220569 bp

>pF1KB9104 1623
>gi568815581r:43777810_43998378 (Chr17)

(complement)

1-117  (100001-100117)   100% ->
118-270  (115024-115176)   100% ->
271-420  (115327-115476)   99% ->
421-648  (115868-116095)   99% ->
649-780  (116790-116921)   100% ->
781-886  (117030-117135)   100% ->
887-955  (117221-117289)   100% ->
956-1117  (117527-117688)   100% ->
1118-1320  (118395-118597)   100% ->
1321-1449  (118976-119104)   100% ->
1450-1623  (120396-120569)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCAAGTCCTGGACAACTTGGGATCCCTCCCCAGTGCCACGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCAAGTCCTGGACAACTTGGGATCCCTCCCCAGTGCCACGGGGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCAGAGCTGGACCTGATCTTCCTTCGAGGCATTATGGAAAGTCCCATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCAGAGCTGGACCTGATCTTCCTTCGAGGCATTATGGAAAGTCCCATAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAAGATCCCTGGCCAAG         GCCCATGAGAGGCTGGAGGAGACG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100101 TAAGATCCCTGGCCAAGGTA...CAGGCCCATGAGAGGCTGGAGGAGACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGCTGGAGGCCGTGAGAGACAACAACCTGGAGCTGGTGCAGGAGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115048 AAGCTGGAGGCCGTGAGAGACAACAACCTGGAGCTGGTGCAGGAGATCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCGGGACCTGGCGCAGCTGGCTGAGCAGAGCAGCACAGCCGCCGAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115098 GCGGGACCTGGCGCAGCTGGCTGAGCAGAGCAGCACAGCCGCCGAGCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCCACATCCTCCAGGAGCCCCACTTCCAG         TCCCTCCTGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 115148 CCCACATCCTCCAGGAGCCCCACTTCCAGGTT...CAGTCCCTCCTGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACGCACGACTCTGTGGCCTCAAAGACCTATGAGACACCACCCCCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115339 ACGCACGACTCTGTGGCCTCAAAGACCTATGAGACACCACCCCCCAGCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGCCTGGACCCTACGTTCAGCAACCAGCCTGTACCTCCCGATGCTGTGC
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115389 TGGCCTGGACCCTACATTCAGCAACCAGCCTGTACCTCCCGATGCTGTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCATGGTGGGCATCCGCAAGACAGCCGGAGAACATCTG         GGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 115439 GCATGGTGGGCATCCGCAAGACAGCCGGAGAACATCTGGTG...CAGGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTAACGTTCCGCGTGGAGGGCGGCGAGCTGGTGATCGCGCGCATTCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115871 GTAACGTTCCGCGTGGAGGGCGGCGAGCTGGTGATCGCGCGCATTCTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGGGGGCATGGTGGCTCAGCAAGGCCTGCTGCATGTGGGTGACATCATCA
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 115921 TGGGGGCATGGTGGCTCAACAAGGCCTGCTGCATGTGGGTGACATCATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGAGGTGAACGGGCAGCCAGTGGGCAGTGACCCCCGCGCACTGCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115971 AGGAGGTGAACGGGCAGCCAGTGGGCAGTGACCCCCGCGCACTGCAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTCCTGCGCAATGCCAGTGGCAGTGTCATCCTCAAGATCCTGCCCAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116021 CTCCTGCGCAATGCCAGTGGCAGTGTCATCCTCAAGATCCTGCCCAGCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCAGGAGCCCCATCTGCCCCGCCAG         GTATTTGTGAAATGTC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 116071 CCAGGAGCCCCATCTGCCCCGCCAGGTG...CAGGTATTTGTGAAATGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACTTTGACTATGACCCGGCCCGAGACAGCCTCATCCCCTGCAAGGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116806 ACTTTGACTATGACCCGGCCCGAGACAGCCTCATCCCCTGCAAGGAAGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGCCTGCGCTTCAACGCCGGGGACTTGCTCCAGATCGTAAACCAGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116856 GGCCTGCGCTTCAACGCCGGGGACTTGCTCCAGATCGTAAACCAGGATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGCCAACTGGTGGCAG         GCATGCCATGTCGAAGGGGGCAGTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 116906 TGCCAACTGGTGGCAGGTG...TAGGCATGCCATGTCGAAGGGGGCAGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CTGGGCTCATTCCCAGCCAGCTGCTGGAGGAGAAGCGGAAAGCATTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117055 CTGGGCTCATTCCCAGCCAGCTGCTGGAGGAGAAGCGGAAAGCATTTGTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AAGAGGGACCTGGAGCTGACACCAAACTCAG         GGACCCTATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 117105 AAGAGGGACCTGGAGCTGACACCAAACTCAGGTA...CAGGGACCCTATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CGGCAGCCTTTCAGGAAAGAAAAAGAAGCGAATGATGTATTTGACCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117231 CGGCAGCCTTTCAGGAAAGAAAAAGAAGCGAATGATGTATTTGACCACCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AGAATGCAG         AGTTTGACCGTCATGAGCTGCTCATTTATGAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 117281 AGAATGCAGGTG...CAGAGTTTGACCGTCATGAGCTGCTCATTTATGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GAGGTGGCCCGCATGCCCCCGTTCCGCCGGAAAACCCTGGTACTGATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117559 GAGGTGGCCCGCATGCCCCCGTTCCGCCGGAAAACCCTGGTACTGATTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GGCTCAGGGCGTGGGACGGCGCAGCCTGAAGAACAAGCTCATCATGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117609 GGCTCAGGGCGTGGGACGGCGCAGCCTGAAGAACAAGCTCATCATGTGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ATCCAGATCGCTATGGCACCACGGTGCCCT         ACACCTCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 117659 ATCCAGATCGCTATGGCACCACGGTGCCCTGTG...TAGACACCTCCCGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 CGGCCGAAAGACTCAGAGCGGGAAGGTCAGGGTTACAGCTTTGTGTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118406 CGGCCGAAAGACTCAGAGCGGGAAGGTCAGGGTTACAGCTTTGTGTCCCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGGGGAGATGGAGGCTGACGTCCGTGCTGGGCGCTACCTGGAGCATGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118456 TGGGGAGATGGAGGCTGACGTCCGTGCTGGGCGCTACCTGGAGCATGGCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AATACGAGGGCAACCTGTATGGCACACGTATTGACTCCATCCGGGGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118506 AATACGAGGGCAACCTGTATGGCACACGTATTGACTCCATCCGGGGCGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GTCGCTGCTGGGAAGGTGTGCGTGCTGGATGTCAACCCCCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 118556 GTCGCTGCTGGGAAGGTGTGCGTGCTGGATGTCAACCCCCAGGTA...CA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1321  GCGGTGAAGGTGCTACGAACGGCCGAGTTTGTCCCTTACGTGGTGTTCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118975 GGCGGTGAAGGTGCTACGAACGGCCGAGTTTGTCCCTTACGTGGTGTTCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TCGAGGCCCCAGACTTCGAGACCCTGCGGGCCATGAACAGGGCTGCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119025 TCGAGGCCCCAGACTTCGAGACCCTGCGGGCCATGAACAGGGCTGCGCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GAGAGTGGAATATCCACCAAGCAGCTCACG         GAGGCGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 119075 GAGAGTGGAATATCCACCAAGCAGCTCACGGTG...CAGGAGGCGGACCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GAGACGGACAGTGGAGGAGAGCAGCCGCATCCAGCGGGGCTACGGGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120407 GAGACGGACAGTGGAGGAGAGCAGCCGCATCCAGCGGGGCTACGGGCACT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 ACTTTGACCTCTGCCTGGTCAATAGCAACCTGGAGAGGACCTTCCGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120457 ACTTTGACCTCTGCCTGGTCAATAGCAACCTGGAGAGGACCTTCCGCGAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 CTCCAGACAGCCATGGAGAAGCTACGGACAGAGCCCCAGTGGGTGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120507 CTCCAGACAGCCATGGAGAAGCTACGGACAGAGCCCCAGTGGGTGCCTGT

   1700     .    :
   1611 CAGCTGGGTGTAC
        |||||||||||||
 120557 CAGCTGGGTGTAC