seq1 = pF1KB9099.tfa, 666 bp
seq2 = pF1KB9099/gi568815581f_66944661.tfa (gi568815581f:66944661_67156268), 211608 bp

>pF1KB9099 666
>gi568815581f:66944661_67156268 (Chr17)

1-229  (100001-100229)   100% ->
230-304  (109336-109410)   100% ->
305-442  (110443-110580)   100% ->
443-666  (111385-111608)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCAGACCAAAATGCTGAAGGTCCGCGTGACCCTCTTCTGCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCCAGACCAAAATGCTGAAGGTCCGCGTGACCCTCTTCTGCATCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCAGGCATCGTGCTGGCCATGACAGCCGTGGTAACCGACCACTGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCAGGCATCGTGCTGGCCATGACAGCCGTGGTAACCGACCACTGGGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTGAGCCCCCACATGGAGCACCACAACACTACCTGCGAGGCGGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCTGAGCCCCCACATGGAGCACCACAACACTACCTGCGAGGCGGCCCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCGGCCTCTGGCGGATTTGTACCAAGCGCATCCCCATGGACGACAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCGGCCTCTGGCGGATTTGTACCAAGCGCATCCCCATGGACGACAGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GACCTGCGGGCCCATCACCCTGCCCGGGG         AGAAGAACTGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100201 GACCTGCGGGCCCATCACCCTGCCCGGGGGTA...CAGAGAAGAACTGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTACTTCAGGCATTTTAACCCCGGCGAGAGCTCGGAGATCTTCGAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109348 CCTACTTCAGGCATTTTAACCCCGGCGAGAGCTCGGAGATCTTCGAATTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACCACTCAGAAGG         AGTACAGCATCTCGGCAGCCGCCATCGC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 109398 ACCACTCAGAAGGGTG...CAGAGTACAGCATCTCGGCAGCCGCCATCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATCTTCAGCCTTGGCTTCATCATCCTGGGCAGCCTCTGTGTCCTCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110471 CATCTTCAGCCTTGGCTTCATCATCCTGGGCAGCCTCTGTGTCCTCCTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCCTCGGGAAGAAGAGGGACTATCTGCTGCGACCCGCGTCCATGTTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110521 CCCTCGGGAAGAAGAGGGACTATCTGCTGCGACCCGCGTCCATGTTCTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCCTTTGCAG         GTCTCTGCATCCTCGTCTCGGTGGAGGTCAT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 110571 GCCTTTGCAGGTA...CAGGTCTCTGCATCCTCGTCTCGGTGGAGGTCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCGGCAGTCGGTGAAGCGCATGATTGACAGTGAGGACACCGTCTGGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111416 GCGGCAGTCGGTGAAGCGCATGATTGACAGTGAGGACACCGTCTGGATCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGTACTATTACTCCTGGTCCTTTGCCTGCGCCTGTGCCGCCTTCATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111466 AGTACTATTACTCCTGGTCCTTTGCCTGCGCCTGTGCCGCCTTCATCCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTCTTTCTCGGCGGTCTCGCCCTCCTGCTGTTCTCCCTGCCTCGAATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111516 CTCTTTCTCGGCGGTCTCGCCCTCCTGCTGTTCTCCCTGCCTCGAATGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCGGAACCCATGGGAGTCCTGCATGGATGCTGAGCCCGAGCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111566 CCGGAACCCATGGGAGTCCTGCATGGATGCTGAGCCCGAGCAC