seq1 = pF1KB9027.tfa, 717 bp
seq2 = pF1KB9027/gi568815581r_5374687.tfa (gi568815581r:5374687_5586161), 211475 bp

>pF1KB9027 717
>gi568815581r:5374687_5586161 (Chr17)

(complement)

1-93  (100001-100093)   100% ->
94-159  (100946-101011)   100% ->
160-233  (103280-103353)   100% ->
234-327  (104773-104866)   100% ->
328-523  (105580-105775)   100% ->
524-614  (106018-106108)   100% ->
615-717  (111373-111475)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTACCAGAGCTTGCGGCTGGAGTACCTGCAGATCCCACCGGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTACCAGAGCTTGCGGCTGGAGTACCTGCAGATCCCACCGGTCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCGCCTACACCACTGCCTGCGTCCTCACCACCGCCGCCGTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100051 CCGCGCCTACACCACTGCCTGCGTCCTCACCACCGCCGCCGTGGTG...C

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     94   CAGTTGGAATTGATCACACCTTTTCAGTTGTACTTCAATCCTGAATTA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100944 AGCAGTTGGAATTGATCACACCTTTTCAGTTGTACTTCAATCCTGAATTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCTTTAAACACTTTCAA         ATATGGAGATTAATCACCAACTT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100994 ATCTTTAAACACTTTCAAGTA...CAGATATGGAGATTAATCACCAACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTTATTTTTTGGGCCAGTTGGATTCAATTTTTTATTTAACATGATTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103303 CTTATTTTTTGGGCCAGTTGGATTCAATTTTTTATTTAACATGATTTTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 T         ATATCGTTACTGTCGAATGCTAGAAGAAGGCTCTTTCCGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103353 TGTA...AAGATATCGTTACTGTCGAATGCTAGAAGAAGGCTCTTTCCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GGTCGGACAGCAGACTTTGTATTTATGTTCCTTTTTGGTGGATTCTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104813 GGTCGGACAGCAGACTTTGTATTTATGTTCCTTTTTGGTGGATTCTTAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GACC         CTTTTTGGTCTGTTTGTGAGCTTAGTTTTCTTGGGCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104863 GACCGTA...TAGCTTTTTGGTCTGTTTGTGAGCTTAGTTTTCTTGGGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGGCCTTTACAATAATGCTCGTCTATGTGTGGAGCCGAAGGAACCCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105617 AGGCCTTTACAATAATGCTCGTCTATGTGTGGAGCCGAAGGAACCCCTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GTCCGCATGAACTTCTTCGGCCTTCTCAACTTCCAGGCCCCCTTTCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105667 GTCCGCATGAACTTCTTCGGCCTTCTCAACTTCCAGGCCCCCTTTCTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTGGGTGCTCATGGGATTTTCCTTGTTGTTGGGGAACTCAATCATTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105717 CTGGGTGCTCATGGGATTTTCCTTGTTGTTGGGGAACTCAATCATTGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACCTTTTGG         GTATTGCAGTTGGACACATATATTTTTTCTTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 105767 ACCTTTTGGGTA...TAGGTATTGCAGTTGGACACATATATTTTTTCTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAAGATGTATTTCCCAATCAACCTGGTGGAATAAGAATTCTGAAAACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106050 GAAGATGTATTTCCCAATCAACCTGGTGGAATAAGAATTCTGAAAACACC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ATCTATTTT         GAAAGCTATTTTTGATACACCAGATGAGGATC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 106100 ATCTATTTTGTG...TAGGAAAGCTATTTTTGATACACCAGATGAGGATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CAAATTACAATCCACTACCTGAGGAACGGCCAGGAGGCTTCGCCTGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111405 CAAATTACAATCCACTACCTGAGGAACGGCCAGGAGGCTTCGCCTGGGGT

    750     .    :    .    :
    697 GAGGGCCAGCGGCTTGGAGGT
        |||||||||||||||||||||
 111455 GAGGGCCAGCGGCTTGGAGGT