seq1 = pF1KB8984.tfa, 1158 bp
seq2 = pF1KB8984/gi568815579r_46521283.tfa (gi568815579r:46521283_46724225), 202943 bp

>pF1KB8984 1158
>gi568815579r:46521283_46724225 (Chr19)

(complement)

1-768  (100001-100768)   99% ->
769-1158  (102554-102943)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGATTCGTGCAGGAACCTCACCTACGTGCGGGGCTCGGTGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGATTCGTGCAGGAACCTCACCTACGTGCGGGGCTCGGTGGGGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCACCAGCACCCTGATGTTCGTGGCCGGTGTGGTGGGCAACGGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCACCAGCACCCTGATGTTCGTGGCCGGTGTGGTGGGCAACGGGCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCTGGGCATCCTGAGCGCACGGCGACCGGCGCGCCCCTCGGCCTTCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCTGGGCATCCTGAGCGCACGGCGACCGGCGCGCCCCTCGGCCTTCGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGCTGGTCACCGGACTGGCGGCCACCGACCTGCTGGGCACCAGCTTCCT
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGCTGGTGACCGGACTGGCGGCCACCGACCTGCTGGGCACCAGCTTCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAGCCCGGCCGTGTTCGTGGCCTATGCGCGCAACAGCTCCCTGCTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAGCCCGGCCGTGTTCGTGGCCTATGCGCGCAACAGCTCCCTGCTGGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCCCGAGGCGGCCCCGCCCTGTGCGATGCCTTCGCCTTCGCCATGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGCCCGAGGCGGCCCCGCCCTGTGCGATGCCTTCGCCTTCGCCATGACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCTTCGGCCTGGCGTCCATGCTCATCCTCTTTGCCATGGCCGTGGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCTTCGGCCTGGCGTCCATGCTCATCCTCTTTGCCATGGCCGTGGAGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTGCCTGGCGCTGAGCCACCCCTACCTCTACGCGCAGCTGGACGGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTGCCTGGCGCTGAGCCACCCCTACCTCTACGCGCAGCTGGACGGGCCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCTGCGCCCGCCTGGCGCTGCCAGCCATCTACGCCTTCTGCGTCCTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCTGCGCCCGCCTGGCGCTGCCAGCCATCTACGCCTTCTGCGTCCTCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGCGCGCTGCCCCTGCTGGGCCTGGGCCAACACCAGCAGTACTGCCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGCGCGCTGCCCCTGCTGGGCCTGGGCCAACACCAGCAGTACTGCCCCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CAGCTGGTGCTTCCTCCGCATGCGCTGGGCCCAGCCGGGCGGCGCCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CAGCTGGTGCTTCCTCCGCATGCGCTGGGCCCAGCCGGGCGGCGCCGCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCTCGCTGGCCTACGCCGGCCTGGTGGCCCTGCTGGTGGCTGCCATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCTCGCTGGCCTACGCCGGCCTGGTGGCCCTGCTGGTGGCTGCCATCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTCTGCAACGGCTCGGTCACCCTCAGCCTCTGCCGCATGTACCGCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTCTGCAACGGCTCGGTCACCCTCAGCCTCTGCCGCATGTACCGCCAGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GAAGCGCCACCAGGGCTCTCTGGGTCCACGGCCGCGCACCGGAGAGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GAAGCGCCACCAGGGCTCTCTGGGTCCACGGCCGCGCACCGGAGAGGACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGTGGACCACCTGATCCTGCTGGCCCTCATGACAGTGGTCATGGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGGTGGACCACCTGATCCTGCTGGCCCTCATGACAGTGGTCATGGCCGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TGCTCCCTGCCTCTCACG         ATCCGCTGCTTCACCCAGGCTGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100751 TGCTCCCTGCCTCTCACGGTG...CAGATCCGCTGCTTCACCCAGGCTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CGCCCCTGACAGCAGCAGTGAGATGGGGGACCTCCTTGCCTTCCGCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102577 CGCCCCTGACAGCAGCAGTGAGATGGGGGACCTCCTTGCCTTCCGCTTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ACGCCTTCAACCCCATCCTGGACCCCTGGGTCTTCATCCTTTTCCGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102627 ACGCCTTCAACCCCATCCTGGACCCCTGGGTCTTCATCCTTTTCCGCAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GCTGTCTTCCAGCGACTCAAGCTCTGGGTCTGCTGCCTGTGCCTCGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102677 GCTGTCTTCCAGCGACTCAAGCTCTGGGTCTGCTGCCTGTGCCTCGGGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TGCCCACGGAGACTCGCAGACACCCCTTTCCCAGCTCGCCTCCGGGAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 102727 TGCCCACGGAGACTCGCAGACACCCCTTTCCCAGCTCGCCTCAGGGAGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GGGACCCAAGGGCCCCCTCTGCTCCTGTGGGAAAGGAGGGGAGCTGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102777 GGGACCCAAGGGCCCCCTCTGCTCCTGTGGGAAAGGAGGGGAGCTGCGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CCTTTGTCGGCTTGGGGCGAGGGGCAGGTGGAGCCCTTGCCTCCCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102827 CCTTTGTCGGCTTGGGGCGAGGGGCAGGTGGAGCCCTTGCCTCCCACACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GCAGTCCAGCGGCAGCGCCGTGGGAACGTCGTCCAAAGCAGAAGCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102877 GCAGTCCAGCGGCAGCGCCGTGGGAACGTCGTCCAAAGCAGAAGCCAGCG

   1150     .    :    .
   1142 TCGCCTGCTCCCTCTGC
        |||||||||||||||||
 102927 TCGCCTGCTCCCTCTGC