Result of SIM4 for pF1KB8968

seq1 = pF1KB8968.tfa, 1071 bp
seq2 = pF1KB8968/gi568815588f_123036051.tfa (gi568815588f:123036051_123237728), 201678 bp

>pF1KB8968 1071
>gi568815588f:123036051_123237728 (Chr10)

1-400  (100001-100400)   100% ->
401-1071  (101008-101678)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGGAACCCGGGCCGGACGCTGCCGGCACCGCCAGCGCACAGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGGAACCCGGGCCGGACGCTGCCGGCACCGCCAGCGCACAGCCCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCGCCGCCGCCCCCCCCACCCGCTCCCAAGGAGTCCCCGTTCTCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACCGCCGCCGCCCCCCCCACCCGCTCCCAAGGAGTCCCCGTTCTCCATCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAACCTGCTCAACGGAGACCACCACCGGCCGCCCCCTAAGCCTCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAACCTGCTCAACGGAGACCACCACCGGCCGCCCCCTAAGCCTCAGCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCCCACGGACGCTCTTCGCGCCAGCCTCGGCTGCCGCCGCCGCCGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCCCACGGACGCTCTTCGCGCCAGCCTCGGCTGCCGCCGCCGCCGCCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCCGCTGCCGCGGCGGCCAAGGGGGCCCTGGAGGGCGCCGCGGGCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGCCGCTGCCGCGGCGGCCAAGGGGGCCCTGGAGGGCGCCGCGGGCTTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGCTCTCGCAGGTGGGCGACCTGGCTTTCCCTCGCTTTGAGATCCCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGCTCTCGCAGGTGGGCGACCTGGCTTTCCCTCGCTTTGAGATCCCGGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGAGGTTTGCCCTGCCCGCGCACTACCTGGAGCGCTCCCCAGCCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGAGGTTTGCCCTGCCCGCGCACTACCTGGAGCGCTCCCCAGCCTGGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTACCCCTACACCCTGACCCCCGCCGGCGGCCACCTCCCGCGACCTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTACCCCTACACCCTGACCCCCGCCGGCGGCCACCTCCCGCGACCTGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401          CCTCGGAGAAGGCCTTGCTGAGAGACTCCTCCCCCGCCTCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTA...CAGCCTCGGAGAAGGCCTTGCTGAGAGACTCCTCCCCCGCCTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GGCACAGACCGCGACTCTCCGGAGCCACTGCTCAAGGCCGACCCCGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101049 GGCACAGACCGCGACTCTCCGGAGCCACTGCTCAAGGCCGACCCCGATCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CAAGGAGCTGGACTCCAAGAGCCCGGACGAGATCATTCTGGAGGAGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101099 CAAGGAGCTGGACTCCAAGAGCCCGGACGAGATCATTCTGGAGGAGAGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACTCCGAGGAAAGCAAAAAGGAAGGCGAAGCGGCGCCAGGCGCGGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101149 ACTCCGAGGAAAGCAAAAAGGAAGGCGAAGCGGCGCCAGGCGCGGCCGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCGAGCGTAGGGGCGGCGGCGGCCACTCCGGGCGCAGAAGACTGGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101199 GCGAGCGTAGGGGCGGCGGCGGCCACTCCGGGCGCAGAAGACTGGAAGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGGCGCTGAAAGTCCAGAGAAGAAGCCGGCGTGCCGCAAGAAGAAGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101249 GGGCGCTGAAAGTCCAGAGAAGAAGCCGGCGTGCCGCAAGAAGAAGACGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GCACAGTCTTCTCGCGCAGCCAGGTCTTCCAGCTCGAGTCCACCTTCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101299 GCACAGTCTTCTCGCGCAGCCAGGTCTTCCAGCTCGAGTCCACCTTCGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ATGAAGCGCTATCTGAGCAGCTCGGAGCGAGCCGGCCTGGCCGCGTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101349 ATGAAGCGCTATCTGAGCAGCTCGGAGCGAGCCGGCCTGGCCGCGTCCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GCACCTCACCGAGACGCAGGTCAAGATCTGGTTCCAGAACCGCCGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101399 GCACCTCACCGAGACGCAGGTCAAGATCTGGTTCCAGAACCGCCGCAACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AGTGGAAGCGGCAGCTGGCGGCGGAGCTGGAGGCGGCCAACCTGAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101449 AGTGGAAGCGGCAGCTGGCGGCGGAGCTGGAGGCGGCCAACCTGAGCCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GCCGCGGCGCAGCGCATCGTGCGGGTGCCCATCCTCTACCACGAGAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101499 GCCGCGGCGCAGCGCATCGTGCGGGTGCCCATCCTCTACCACGAGAACTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GGCGGCCGAGGGCGCGGCGGCTGCAGCCGCGGGGGCCCCGGTGCCAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101549 GGCGGCCGAGGGCGCGGCGGCTGCAGCCGCGGGGGCCCCGGTGCCAGTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 GCCAGCCGCTGCTCACCTTCCCGCACCCCGTCTACTACTCGCACCCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101599 GCCAGCCGCTGCTCACCTTCCCGCACCCCGTCTACTACTCGCACCCGGTG

   1050     .    :    .    :    .    :
   1042 GTCTCTTCCGTGCCGCTGCTACGGCCGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 101649 GTCTCTTCCGTGCCGCTGCTACGGCCGGTC

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