seq1 = pF1KB8935.tfa, 852 bp
seq2 = pF1KB8935/gi568815590r_53870392.tfa (gi568815590r:53870392_54122125), 251734 bp

>pF1KB8935 852
>gi568815590r:53870392_54122125 (Chr8)

(complement)

1-45  (100001-100045)   100% ==
71-181  (122071-122181)   100% ->
182-269  (128371-128458)   100% ->
270-415  (133867-134012)   99% ->
416-472  (135101-135157)   100% <-
473-627  (137609-137763)   100% ->
628-774  (142955-143101)   99% ->
775-852  (151663-151739)   94%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .
      1 ATGGAGGACGAAGTGGTCCGCTTTGCCAAGAAGATGGACAAGATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGACGAAGTGGTCCGCTTTGCCAAGAAGATGGACAAGATG

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     71 TGCAGTCCACAAGAATCGGAATGTCAGTTAATGCTATTCGCAAGCAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122071 TGCAGTCCACAAGAATCGGAATGTCAGTTAATGCTATTCGCAAGCAGAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    121 ACAGATGAGGAAGTTACATCTTTGGCAAAGTCTCTCATCAAATCCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122121 ACAGATGAGGAAGTTACATCTTTGGCAAAGTCTCTCATCAAATCCTGGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    171 AAAATTATTAG         ATGGGCCATCAACTGAGAAAGACCTTGACG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 122171 AAAATTATTAGGTA...CAGATGGGCCATCAACTGAGAAAGACCTTGACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    212 AAAAGAAGAAAGAACCTGCAATTACATCGCAGAACAGCCCTGAGGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128401 AAAAGAAGAAAGAACCTGCAATTACATCGCAGAACAGCCCTGAGGCAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    262 GAAGAAAG         TACTTCCAGCGGCAATGTAAGCAACAGAAAGGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 128451 GAAGAAAGGTA...CAGTACTTCCAGCGGCAATGTAAGCAACAGAAAGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    303 TGAGACAAATGCTCGAGATACTTATGTTTCATCCTTTCCTCGGGCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133900 TGAGACAAATGCTCGAGATACTTATGTTTCATCCTTTCCTCGGGCACCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    353 GCACTTCTGATTCTGTGCAGTTGAAGTGTAGGGAGATGCTTGCTGCAGCT
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 133950 GCACTTCTGATTCTGTGCGGTTGAAGTGTAGGGAGATGCTTGCTGCAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    403 CTTCGAACAGGGG         ATGACTACATTGCAATTGGAGCTGATGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 134000 CTTCGAACAGGGGGTA...TAGATGACTACATTGCAATTGGAGCTGATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    444 GGAAGAATTAGGATCTCAAATTGAAGAAG         CTATATATCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||<<<...<<<||||||||||||
 135129 GGAAGAATTAGGATCTCAAATTGAAGAAGATA...TACCTATATATCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    485 AAATAAGGAATACAGACATGAAATACAAAAATAGAGTACGAAGTAGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137621 AAATAAGGAATACAGACATGAAATACAAAAATAGAGTACGAAGTAGGATA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    535 TCAAATCTTAAAGATGCAAAAAATCCAAATTTAAGGAAAAATGTCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137671 TCAAATCTTAAAGATGCAAAAAATCCAAATTTAAGGAAAAATGTCCTCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    585 TGGGAATATTCCTCCTGACTTATTTGCTAGAATGACAGCAGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 137721 TGGGAATATTCCTCCTGACTTATTTGCTAGAATGACAGCAGAGGTG...T

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    628   GAAATGGCTAGTGATGAGCTGAAAGAGATGTGGAAAAACTTGACCAAA
        >>|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 142953 AGGAAATGGCTAGTGATGAGCTGAAAGAGATGCGGAAAAACTTGACCAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    676 GAAGCCATCAGAGAGCATCAGATGGCCAAGACTGGTGGGACCCAGACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143003 GAAGCCATCAGAGAGCATCAGATGGCCAAGACTGGTGGGACCCAGACTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    726 CTTGTTCACATGTGGCAAATGTAAAAAGAAGAATTGCACTTACACACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 143053 CTTGTTCACATGTGGCAAATGTAAAAAGAAGAATTGCACTTACACACAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    775         GTACAAACCCGTAGTGCTGATGAACCAGTGACAACATTTGTT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 143103 TT...CAGGTACAAACCCGTAGTGCTGATGAACCAATGACAACATTTGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .
    817 GTCTGTAATGAATGTGGAAATCGATGGAAGTTCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||| | ||-
 151705 GTCTGTAATGAATGTGGAAATCGATGGAAGGTATG