seq1 = pF1KB8915.tfa, 771 bp
seq2 = pF1KB8915/gi568815597r_26811848.tfa (gi568815597r:26811848_27013940), 202093 bp

>pF1KB8915 771
>gi568815597r:26811848_27013940 (Chr1)

(complement)

1-532  (100001-100532)   100% ->
533-771  (101855-102093)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCACCAGCCAACCAGGGGCCTGCCCATGCCAGGGAGCTGCAAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCACCAGCCAACCAGGGGCCTGCCCATGCCAGGGAGCTGCAAGCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCGCCATTCTCTACGCACTTCTGAGCTCCAGCCTCAAGGCTGTCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCGCCATTCTCTACGCACTTCTGAGCTCCAGCCTCAAGGCTGTCCCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GACCCCGTAGCCGCTGCCTATGTAGGCAGCACCGGCCCGTCCAGCTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GACCCCGTAGCCGCTGCCTATGTAGGCAGCACCGGCCCGTCCAGCTATGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCACCTCATCGCACCTGCCGGGAGGCCTTGGATGTTCTGGCCAAGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCACCTCATCGCACCTGCCGGGAGGCCTTGGATGTTCTGGCCAAGACAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCCTTCCTCAGGAACCTGCCATCCTTCTGGCAGCTGCCTCCCCAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCCTTCCTCAGGAACCTGCCATCCTTCTGGCAGCTGCCTCCCCAGGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCGGCGGCTGCTGCAGGGTTGCTGGGGCCCCCTCTTCCTGCTTGGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCGGCGGCTGCTGCAGGGTTGCTGGGGCCCCCTCTTCCTGCTTGGGTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCCAAGATGCTGTGACCTTTGAGGTGGCTGAGGCCCCGGTGCCCAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCCAAGATGCTGTGACCTTTGAGGTGGCTGAGGCCCCGGTGCCCAGCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACTCAAGAAGATTCTGCTGGAGGAGCCCAGCAGCAGTGGAGGCAGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACTCAAGAAGATTCTGCTGGAGGAGCCCAGCAGCAGTGGAGGCAGTGGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AACTGCCAGACAGACCCCAGCCCTCCCTGGCTGCGGTGCAGTGGCTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AACTGCCAGACAGACCCCAGCCCTCCCTGGCTGCGGTGCAGTGGCTTCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGCTGTCTGGAGTCCTTCTGGAGCCTGGAGCTTAGCCCCAAGGAATATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGCTGTCTGGAGTCCTTCTGGAGCCTGGAGCTTAGCCCCAAGGAATATGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGCCTGAAAGGGACCATCCTCTTCAACCCCG         ATGTGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100501 CTGCCTGAAAGGGACCATCCTCTTCAACCCCGGTG...CAGATGTGCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GCCTCCAAGCCGCCTCCCACATTGGGCACCTGCAGCAGGAGGCTCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101864 GCCTCCAAGCCGCCTCCCACATTGGGCACCTGCAGCAGGAGGCTCACTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GTGCTGTGTGAAGTCCTGGAACCCTGGTGCCCAGCAGCCCAAGGCCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101914 GTGCTGTGTGAAGTCCTGGAACCCTGGTGCCCAGCAGCCCAAGGCCGCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GACCCGTGTCCTCCTCACGGCCTCCACCCTCAAGTCCATTCCGACCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101964 GACCCGTGTCCTCCTCACGGCCTCCACCCTCAAGTCCATTCCGACCAGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGCTTGGGGACCTCTTCTTTCGCCCTATCATTGGAGATGTTGACATCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102014 TGCTTGGGGACCTCTTCTTTCGCCCTATCATTGGAGATGTTGACATCGCT

    750     .    :    .    :    .    :
    742 GGCCTTCTTGGGGACATGCTTTTGCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 102064 GGCCTTCTTGGGGACATGCTTTTGCTCAGG