seq1 = pF1KB8900.tfa, 699 bp
seq2 = pF1KB8900/gi568815581r_7488381.tfa (gi568815581r:7488381_7689676), 201296 bp

>pF1KB8900 699
>gi568815581r:7488381_7689676 (Chr17)

(complement)

1-533  (100001-100533)   100% ->
534-699  (101131-101296)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGCTACCAGGCTCCTCACAGGACCAGGCCTGGAGCCTGGAGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGCTACCAGGCTCCTCACAGGACCAGGCCTGGAGCCTGGAGCCTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGCCACGGCTGCTGCCTCCTCATCTTCGGGACCCCAGGAGCGGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTGCCACGGCTGCTGCCTCCTCATCTTCGGGACCCCAGGAGCGGGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGCTGGGAGCCCCGCGGCCCCCGGGACGCTGCCCCTGGAGAAGGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGCTGGGAGCCCCGCGGCCCCCGGGACGCTGCCCCTGGAGAAGGTGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGCCGATGAACGCGTTCATGGTGTGGAGCTCCGCTCAGCGCCGCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGGCCGATGAACGCGTTCATGGTGTGGAGCTCCGCTCAGCGCCGCCAGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCGCAGCAGAACCCCAAGATGCACAACTCCGAGATCTCCAAGCGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCGCAGCAGAACCCCAAGATGCACAACTCCGAGATCTCCAAGCGCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGCGCAGTGGAAGCTGCTGGACGAGGACGAGAAGCGGCCCTTCGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGCGCAGTGGAAGCTGCTGGACGAGGACGAGAAGCGGCCCTTCGTGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGCCAAGCGGCTCCGCGCCCGACACCTGCGCGACTACCCCGACTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGGCCAAGCGGCTCCGCGCCCGACACCTGCGCGACTACCCCGACTACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTACCGGCCTCGGCGCAAGGCCAAGAGCTCGGGCGCCGGACCTTCCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTACCGGCCTCGGCGCAAGGCCAAGAGCTCGGGCGCCGGACCTTCCCGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCGGACAGGGAAGAGGCAACCTGGCCAGCGGCGGCCCGCTCTGGGGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCGGACAGGGAAGAGGCAACCTGGCCAGCGGCGGCCCGCTCTGGGGGCCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGGTACGCGACCACCCAACCGAGCAGAGGCTTTGGGTACAGACCCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGGTACGCGACCACCCAACCGAGCAGAGGCTTTGGGTACAGACCCCCCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTACTCGACAGCCTACCTGCCTGGCAGCTATGG         CTCTTCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100501 CTACTCGACAGCCTACCTGCCTGGCAGCTATGGGTG...CAGCTCTTCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACTGCAAACTGGAAGCCCCCTCACCGTGCTCCCTCCCTCAGAGTGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101139 ACTGCAAACTGGAAGCCCCCTCACCGTGCTCCCTCCCTCAGAGTGACCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AGGCTCCAGGGGGAACTGCTGCCCACCTATACCCACTACCTGCCCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101189 AGGCTCCAGGGGGAACTGCTGCCCACCTATACCCACTACCTGCCCCCTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CTCTCCCACTCCATACAACCCTCCCCTTGCTGGTGCCCCCATGCCCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101239 CTCTCCCACTCCATACAACCCTCCCCTTGCTGGTGCCCCCATGCCCCTAA

    700     .
    692 CCCACCTC
        ||||||||
 101289 CCCACCTC