seq1 = pF1KB8897.tfa, 672 bp
seq2 = pF1KB8897/gi568815581r_48496416.tfa (gi568815581r:48496416_48698150), 201735 bp

>pF1KB8897 672
>gi568815581r:48496416_48698150 (Chr17)

(complement)

1-415  (100001-100415)   100% ->
416-672  (101479-101735)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTTCCTATTTCGTGAACTCCACCTTCCCCGTCACTCTGGCCAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTTCCTATTTCGTGAACTCCACCTTCCCCGTCACTCTGGCCAGCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGGAGTCCTTCCTGGGCCAGCTACCGCTCTATTCGTCGGGCTATGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAGGAGTCCTTCCTGGGCCAGCTACCGCTCTATTCGTCGGGCTATGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCCGCTGAGACATTACCCCGCGCCCTACGGGCCAGGGCCGGGCCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCCGCTGAGACATTACCCCGCGCCCTACGGGCCAGGGCCGGGCCAGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGGGCTTTGCCACTTCCTCCTATTACCCGCCGGCGGGCGGTGGCTACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGGGCTTTGCCACTTCCTCCTATTACCCGCCGGCGGGCGGTGGCTACGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGAGCGGCGCCCTGCGACTACGGGCCGGCGCCGGCCTTCTACCGCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGAGCGGCGCCCTGCGACTACGGGCCGGCGCCGGCCTTCTACCGCGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAGAGTCGGCCTGCGCACTCTCCGGCGCCGACGAGCAGCCCCCGTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AAGAGTCGGCCTGCGCACTCTCCGGCGCCGACGAGCAGCCCCCGTTCCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCCGAGCCGCGGAAGTCGGACTGCGCGCAGGACAAGAGCGTGTTCGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCCGAGCCGCGGAAGTCGGACTGCGCGCAGGACAAGAGCGTGTTCGGCGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GACAGAAGAGCAGAAGTGCTCCACTCCGGTCTACCCGTGGATGCAGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GACAGAAGAGCAGAAGTGCTCCACTCCGGTCTACCCGTGGATGCAGCGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGAATTCGTGCAACA         GTTCCTCCTTTGGGCCCAGCGGCCGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGAATTCGTGCAACAGTG...CAGGTTCCTCCTTTGGGCCCAGCGGCCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CGAGGCCGCCAGACATACACACGTTACCAGACGCTGGAGCTGGAGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101505 CGAGGCCGCCAGACATACACACGTTACCAGACGCTGGAGCTGGAGAAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GTTTCACTACAATCGCTACCTGACGCGGCGGCGGCGCATCGAGATCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101555 GTTTCACTACAATCGCTACCTGACGCGGCGGCGGCGCATCGAGATCGCGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACGCCCTGTGCCTGACGGAGAGGCAGATCAAGATATGGTTCCAGAACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101605 ACGCCCTGTGCCTGACGGAGAGGCAGATCAAGATATGGTTCCAGAACCGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CGCATGAAGTGGAAAAAGGAGAGCAAACTGCTCAGCGCGTCTCAGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101655 CGCATGAAGTGGAAAAAGGAGAGCAAACTGCTCAGCGCGTCTCAGCTCAG

    650     .    :    .    :    .    :
    642 TGCCGAGGAGGAGGAAGAAAAACAGGCCGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 101705 TGCCGAGGAGGAGGAAGAAAAACAGGCCGAG