seq1 = pF1KB8870.tfa, 402 bp
seq2 = pF1KB8870/gi568815596f_8582166.tfa (gi568815596f:8582166_8782896), 200731 bp

>pF1KB8870 402
>gi568815596f:8582166_8782896 (Chr2)

1-348  (100001-100348)   100% ->
349-402  (100678-100731)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAGCCTTCAGTCCCGTGAGGTCCGTTAGGAAAAACAGCCTGTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAGCCTTCAGTCCCGTGAGGTCCGTTAGGAAAAACAGCCTGTCGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCACAGCCTGGGCATCTCCCGGAGCAAAACCCCTGTGGACGACCCGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCACAGCCTGGGCATCTCCCGGAGCAAAACCCCTGTGGACGACCCGATGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTGCTATACAACATGAACGACTGCTACTCCAAGCTCAAGGAGCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCTGCTATACAACATGAACGACTGCTACTCCAAGCTCAAGGAGCTGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCAGCATCCCCCAGAACAAGAAGGTGAGCAAGATGGAAATCCTGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCAGCATCCCCCAGAACAAGAAGGTGAGCAAGATGGAAATCCTGCAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGTCATCGACTACATCTTGGACCTGCAGATCGCCCTGGACTCGCATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGTCATCGACTACATCTTGGACCTGCAGATCGCCCTGGACTCGCATCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTATTGTCAGCCTGCATCACCAGAGACCCGGGCAGAACCAGGCGTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTATTGTCAGCCTGCATCACCAGAGACCCGGGCAGAACCAGGCGTCCAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACGCCGCTGACCACCCTCAACACGGATATCAGCATCCTGTCCTTGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100301 ACGCCGCTGACCACCCTCAACACGGATATCAGCATCCTGTCCTTGCAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    349        GCTTCTGAATTCCCTTCTGAGTTAATGTCAAATGACAGCAAAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 A...CAGGCTTCTGAATTCCCTTCTGAGTTAATGTCAAATGACAGCAAAG

    400     .    :
    392 CACTGTGTGGC
        |||||||||||
 100721 CACTGTGTGGC