seq1 = pF1KB8819.tfa, 1146 bp
seq2 = pF1KB8819/gi568815575f_91335578.tfa (gi568815575f:91335578_91536723), 201146 bp

>pF1KB8819 1146
>gi568815575f:91335578_91536723 (ChrX)

1-1146  (100001-101146)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGAGCGGGGAGCCTAATCCTGCTGGCAAGAAAAAGAAGTATCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGAGCGGGGAGCCTAATCCTGCTGGCAAGAAAAAGAAGTATCTCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCGCTCTGTACGTGGGTGACTTGGACCCAGATGTCACCGAGGACATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCGCTCTGTACGTGGGTGACTTGGACCCAGATGTCACCGAGGACATGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTATAAGAAGTTCAGGCCTGCTGGCCCTCTGCGATTCACCCGAATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTATAAGAAGTTCAGGCCTGCTGGCCCTCTGCGATTCACCCGAATCTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGTGATCCGGTGACCCGCAGCCCCCTGGGCTATGGGTATGTTAACTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGTGATCCGGTGACCCGCAGCCCCCTGGGCTATGGGTATGTTAACTTCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTTCCCGCGGATGCAGAGTGGGCCTTGAACACCATGAATTTTGATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTTCCCGCGGATGCAGAGTGGGCCTTGAACACCATGAATTTTGATTTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTAATGGAAAACCATTCCGCCTTATGTGGTCTCAGCCAGATGACCGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTAATGGAAAACCATTCCGCCTTATGTGGTCTCAGCCAGATGACCGCTTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGAAAGTCTGGAGTGGGAAATATATTCATCAAAAACCTGGACAAATCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGAAAGTCTGGAGTGGGAAATATATTCATCAAAAACCTGGACAAATCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGACAATAGGGCCCTGTTTTACTTATTTTCTGCTTTTGGGAACATTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGACAATAGGGCCCTGTTTTACTTATTTTCTGCTTTTGGGAACATTCTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTGCAAAGTCGTATGCGATGACAACGGCTCTAAGGGTTATGCCTATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTGCAAAGTCGTATGCGATGACAACGGCTCTAAGGGTTATGCCTATGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CACTTTGACAGCCTGGCCGCTGCCAATAGAGCCATCTGGCACATGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CACTTTGACAGCCTGGCCGCTGCCAATAGAGCCATCTGGCACATGAATGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGTGCGGCTCAACAACCGCCAGGTGTATGTTGGCAGATTCAAATTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGTGCGGCTCAACAACCGCCAGGTGTATGTTGGCAGATTCAAATTCCCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAGAGCGGGCGGCTGAGGTCAGAACCAGGGATAGAGCAACTTTCACCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AAGAGCGGGCGGCTGAGGTCAGAACCAGGGATAGAGCAACTTTCACCAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTTTTCGTTAAAAACATTGGAGACGACATAGATGACGAAAAACTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTTTTCGTTAAAAACATTGGAGACGACATAGATGACGAAAAACTGAAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ACTTTTCTGTGAATATGGGCCAACTGAGAGTGTTAAAGTAATAAGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ACTTTTCTGTGAATATGGGCCAACTGAGAGTGTTAAAGTAATAAGAGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCAGTGGGAAATCTAAAGGCTTTGGATTTGTGAGATATGAGACACACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCAGTGGGAAATCTAAAGGCTTTGGATTTGTGAGATATGAGACACACGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCTGCCCAAAAGGCTGTGCTAGACTTGCATGGAAAGTCCATCGATGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCTGCCCAAAAGGCTGTGCTAGACTTGCATGGAAAGTCCATCGATGGAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGTCCTCTATGTAGGGCGAGCACAGAAGAAAATTGAACGCCTGGCTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGTCCTCTATGTAGGGCGAGCACAGAAGAAAATTGAACGCCTGGCTGAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGAGGCGGAGATTTGAACGGCTGAGGTTAAAAGAAAAAAGTCGGCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGAGGCGGAGATTTGAACGGCTGAGGTTAAAAGAAAAAAGTCGGCCCCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GGGGTGCCTATCTATATTAAGAACTTGGATGAGACAATCAATGATGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GGGGTGCCTATCTATATTAAGAACTTGGATGAGACAATCAATGATGAAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 ACTGAAGGAGGAATTTTCTTCCTTTGGGTCAATTAGTCGGGCCAAAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 ACTGAAGGAGGAATTTTCTTCCTTTGGGTCAATTAGTCGGGCCAAAGTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TGATGGAAGTGGGGCAAGGCAAAGGATTTGGTGTGGTCTGCTTTTCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TGATGGAAGTGGGGCAAGGCAAAGGATTTGGTGTGGTCTGCTTTTCCTCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TTTGAAGAGGCTACCAAAGCAGTGGATGAGATGAATGGCCGCATAGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TTTGAAGAGGCTACCAAAGCAGTGGATGAGATGAATGGCCGCATAGTGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1101 CTCCAAGCCCCTGCATGTCACCCTGGGCCAGGCCAGGCGCAGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CTCCAAGCCCCTGCATGTCACCCTGGGCCAGGCCAGGCGCAGGTGC