seq1 = pF1KB8803.tfa, 1047 bp
seq2 = pF1KB8803/gi568815592r_32028734.tfa (gi568815592r:32028734_32229780), 201047 bp

>pF1KB8803 1047
>gi568815592r:32028734_32229780 (Chr6)

(complement)

1-1047  (100001-101047)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGACGCCACCAGTCAATACAATTGGAGAAAAGGACACCTCTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGACGCCACCAGTCAATACAATTGGAGAAAAGGACACCTCTCAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAACAAGAGTGGGAAAAGAACCTTCGGGAGAACCTTGATTCAGTTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAACAAGAGTGGGAAAAGAACCTTCGGGAGAACCTTGATTCAGTTATTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGATTAGGCAGCAGCCCCGAGACCCTCCTACCGAAACGCTTGAGCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGATTAGGCAGCAGCCCCGAGACCCTCCTACCGAAACGCTTGAGCTGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTAAGCCCAGATCCAGCCAGCCAAATTCTAGAGCATACTCAAGGAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTAAGCCCAGATCCAGCCAGCCAAATTCTAGAGCATACTCAAGGAGCTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AAAACTGGTTGCTGAACTTGAAGGAGACTCTCATAAGTCTCATGGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AAAACTGGTTGCTGAACTTGAAGGAGACTCTCATAAGTCTCATGGATCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCAGTCAGATGCCAGAGACCCTTCAAGCTTCTGATCTCTGGTACTGCCCC
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCAGTCAGATGCCAGAGGCCCTTCAAGCTTCTGATCTCTGGTACTGCCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GATGGGAGCTTTGTCAAGAAGATCGTAATCCGTGGCCATGGCTTGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GATGGGAGCTTTGTCAAGAAGATCGTAATCCGTGGCCATGGCTTGGACAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACCCAAACTAGGCTCCTGCTGCCGGGTACTGGCTTTGGGGTTTCCTTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACCCAAACTAGGCTCCTGCTGCCGGGTACTGGCTTTGGGGTTTCCTTTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GATCAGGGCCGCCAGAGGGCTGGACAGAGCTAACTATGGGCGTAGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GATCAGGGCCGCCAGAGGGCTGGACAGAGCTAACTATGGGCGTAGGGCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGGAGGGAGGAAACTTGGGGGGAGCTCATAGAGAAATGCTTGGAGTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGGAGGGAGGAAACTTGGGGGGAGCTCATAGAGAAATGCTTGGAGTCCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTGTCAAGGTGAGGAAGCAGAGCTTCAGCTGCCTGGGCACTCTGGACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTGTCAAGGTGAGGAAGCAGAGCTTCAGCTGCCTGGGCACTCTGGACCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGTCAGGCTCACACTGGCATCCTTCACTCAAGGCCGAGACTCCTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTGTCAGGCTCACACTGGCATCCTTCACTCAAGGCCGAGACTCCTGGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGGAGACTAGCGAGAAGGAAGCCCTGGCCAGGGAAGAACGTGCAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTGGAGACTAGCGAGAAGGAAGCCCTGGCCAGGGAAGAACGTGCAAGGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CACAGAACTATTTCGAGCTGGGAACCCTGAAGGAGCTGCCCGATGCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CACAGAACTATTTCGAGCTGGGAACCCTGAAGGAGCTGCCCGATGCTATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GACGGGCTCTTCGGCTGCTCCTGACTTTACCCCCACCTGGTCCTCCAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100701 GACGGGCTCTTCGGCTGCTCCTGACTTTACCCCCACCTGGCCCTCCAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CGAACTGTCCTTCATGCCAATCTGGCTGCCTGTCAGTTGTTGCTAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CGAACTGTCCTTCATGCCAATCTGGCTGCCTGTCAGTTGTTGCTAGGGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCCTCAGTTGGCAGCCCAGAGCTGTGACCGGGTGTTGGAGCGGGAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCCTCAGTTGGCAGCCCAGAGCTGTGACCGGGTGTTGGAGCGGGAGCCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCCATTTAAAGGCCTTATACCGAAGGGGGGTTGCCCAGGCTGCCCTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCCATTTAAAGGCCTTATACCGAAGGGGGGTTGCCCAGGCTGCCCTTGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AACCTGGAAAAAGCAACTGCTGACCTCAAGAAGGTGCTGGCGATAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AACCTGGAAAAAGCAACTGCTGACCTCAAGAAGGTGCTGGCGATAGATCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAAAAACCGGGCAGCCCAGGAGGAACTGGGGAAGGTGGTCATTCAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAAAAACCGGGCAGCCCAGGAGGAACTGGGGAAGGTGGTCATTCAGGGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1001 AGAACCAGGATGCAGGGCTGGCTCAGGGTCTGCGCAAGATGTTTGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGAACCAGGATGCAGGGCTGGCTCAGGGTCTGCGCAAGATGTTTGGC