seq1 = pF1KB8798.tfa, 1008 bp
seq2 = pF1KB8798/gi568815575f_41627027.tfa (gi568815575f:41627027_41828034), 201008 bp

>pF1KB8798 1008
>gi568815575f:41627027_41828034 (ChrX)

1-1008  (100001-101008)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACAACAATACAACATGTATTCAACCATCTATGATCTCTTCCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACAACAATACAACATGTATTCAACCATCTATGATCTCTTCCATGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTACCAATCATTTACATCCTCCTTTGTATTGTTGGTGTTTTTGGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTACCAATCATTTACATCCTCCTTTGTATTGTTGGTGTTTTTGGAAACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCTCTCTCAATGGATATTTTTAACAAAAATAGGTAAAAAAACATCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTCTCTCTCAATGGATATTTTTAACAAAAATAGGTAAAAAAACATCAACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACATCTACCTGTCACACCTTGTGACTGCAAACTTACTTGTGTGCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CACATCTACCTGTCACACCTTGTGACTGCAAACTTACTTGTGTGCAGTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATGCCTTTCATGAGTATCTATTTCCTGAAAGGTTTCCAATGGGAATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATGCCTTTCATGAGTATCTATTTCCTGAAAGGTTTCCAATGGGAATATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AATCTGCTCAATGCAGAGTGGTCAATTTTCTGGGAACTCTATCCATGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AATCTGCTCAATGCAGAGTGGTCAATTTTCTGGGAACTCTATCCATGCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCAAGTATGTTTGTCAGTCTCTTAATTTTAAGTTGGATTGCCATAAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCAAGTATGTTTGTCAGTCTCTTAATTTTAAGTTGGATTGCCATAAGCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTATGCTACCTTAATGCAAAAGGATTCCTCGCAAGAGACTACTTCATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTATGCTACCTTAATGCAAAAGGATTCCTCGCAAGAGACTACTTCATGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGAGAAAATATTTTATGGCCATTTACTGAAAAAATTTCGCCAGCCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGAGAAAATATTTTATGGCCATTTACTGAAAAAATTTCGCCAGCCCAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTGCTAGAAAACTATGCATTTACATATGGGGAGTTGTACTGGGCATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTTGCTAGAAAACTATGCATTTACATATGGGGAGTTGTACTGGGCATAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATTCCAGTTACCGTATACTACTCAGTCATAGAGGCTACAGAAGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATTCCAGTTACCGTATACTACTCAGTCATAGAGGCTACAGAAGGAGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGAGCCTATGCTACAATCGGCAGATGGAACTAGGAGCCATGATCTCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGAGCCTATGCTACAATCGGCAGATGGAACTAGGAGCCATGATCTCTCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATTGCAGGTCTCATTGGAACCACATTTATTGGATTTTCCTTTTTAGTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATTGCAGGTCTCATTGGAACCACATTTATTGGATTTTCCTTTTTAGTAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ACTAACATCATACTACTCTTTTGTAAGCCATCTGAGAAAAATAAGAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ACTAACATCATACTACTCTTTTGTAAGCCATCTGAGAAAAATAAGAACCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTACGTCCATTATGGAGAAAGATTTGACTTACAGTTCTGTGAAAAGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTACGTCCATTATGGAGAAAGATTTGACTTACAGTTCTGTGAAAAGACAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTTTTGGTCATCCAGATTCTACTAATAGTTTGCTTCCTTCCTTATAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTTTTGGTCATCCAGATTCTACTAATAGTTTGCTTCCTTCCTTATAGTAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTTTAAACCCATTTTTTATGTTCTACACCAAAGAGATAACTGTCAGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTTTAAACCCATTTTTTATGTTCTACACCAAAGAGATAACTGTCAGCAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGAATTATTTAATAGAAACAAAAAACATTCTCACCTGTCTTGCTTCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGAATTATTTAATAGAAACAAAAAACATTCTCACCTGTCTTGCTTCGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGAAGTAGCACAGACCCCATTATATTTCTTTTATTAGATAAAACATTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGAAGTAGCACAGACCCCATTATATTTCTTTTATTAGATAAAACATTCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GAAGACACTATATAATCTCTTTACAAAGTCTAATTCAGCACATATGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GAAGACACTATATAATCTCTTTACAAAGTCTAATTCAGCACATATGCAAT

   1000     .
   1001 CATATGGT
        ||||||||
 101001 CATATGGT