seq1 = pF1KB8793.tfa, 990 bp
seq2 = pF1KB8793/gi568815587r_18955413.tfa (gi568815587r:18955413_19156402), 200990 bp

>pF1KB8793 990
>gi568815587r:18955413_19156402 (Chr11)

(complement)

1-990  (100001-100990)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATCCAACCACCCCGGCCTGGGGAACAGAAAGTACAACAGTGAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATCCAACCACCCCGGCCTGGGGAACAGAAAGTACAACAGTGAATGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAATGACCAAGCCCTTCTTCTGCTTTGTGGCAAGGAGACCCTGATCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAATGACCAAGCCCTTCTTCTGCTTTGTGGCAAGGAGACCCTGATCCCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTTCCTGATCCTTTTCATTGCCCTGGTCGGGCTGGTAGGAAACGGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTTCCTGATCCTTTTCATTGCCCTGGTCGGGCTGGTAGGAAACGGGTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGCTCTGGCTCCTGGGCTTCCGCATGCGCAGGAACGCCTTCTCTGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGCTCTGGCTCCTGGGCTTCCGCATGCGCAGGAACGCCTTCTCTGTCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGTCCTCAGCCTGGCCGGGGCCGACTTCCTCTTCCTCTGCTTCCAGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGTCCTCAGCCTGGCCGGGGCCGACTTCCTCTTCCTCTGCTTCCAGATTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TAAATTGCCTGGTGTACCTCAGTAACTTCTTCTGTTCCATCTCCATCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TAAATTGCCTGGTGTACCTCAGTAACTTCTTCTGTTCCATCTCCATCAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCCCTAGCTTCTTCACCACTGTGATGACCTGTGCCTACCTTGCAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCCCTAGCTTCTTCACCACTGTGATGACCTGTGCCTACCTTGCAGGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAGCATGCTGAGCACCGTCAGCACCGAGCGCTGCCTGTCCGTCCTGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAGCATGCTGAGCACCGTCAGCACCGAGCGCTGCCTGTCCGTCCTGTGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCATCTGGTATCGCTGCCGCCGCCCCAGACACCTGTCAGCGGTCGTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCATCTGGTATCGCTGCCGCCGCCCCAGACACCTGTCAGCGGTCGTGTGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTCCTGCTCTGGGCCCTGTCCCTACTGCTGAGCATCTTGGAAGGGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTCCTGCTCTGGGCCCTGTCCCTACTGCTGAGCATCTTGGAAGGGAAGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGTGGCTTCTTATTTAGTGATGGTGACTCTGGTTGGTGTCAGACATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTGTGGCTTCTTATTTAGTGATGGTGACTCTGGTTGGTGTCAGACATTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATTTCATCACTGCAGCGTGGCTGATTTTTTTATTCATGGTTCTCTGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATTTCATCACTGCAGCGTGGCTGATTTTTTTATTCATGGTTCTCTGTGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCCAGTCTGGCCCTGCTGGTCAGGATCCTCTGTGGCTCCAGGGGTCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCCAGTCTGGCCCTGCTGGTCAGGATCCTCTGTGGCTCCAGGGGTCTGCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ACTGACCAGGCTGTACCTGACCATCCTGCTCACAGTGCTGGTGTTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ACTGACCAGGCTGTACCTGACCATCCTGCTCACAGTGCTGGTGTTCCTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCTGCGGCCTGCCCTTTGGCATTCAGTGGTTCCTAATATTATGGATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCTGCGGCCTGCCCTTTGGCATTCAGTGGTTCCTAATATTATGGATCTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAGGATTCTGATGTCTTATTTTGTCATATTCATCCAGTTTCAGTTGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAGGATTCTGATGTCTTATTTTGTCATATTCATCCAGTTTCAGTTGTCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GTCATCTCTTAACAGCAGTGCCAACCCCATCATTTACTTCTTCGTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GTCATCTCTTAACAGCAGTGCCAACCCCATCATTTACTTCTTCGTGGGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTTTTAGGAAGCAGTGGCGGCTGCAGCAGCCGATCCTCAAGCTGGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTTTTAGGAAGCAGTGGCGGCTGCAGCAGCCGATCCTCAAGCTGGCTCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CAGAGGGCTCTGCAGGACATTGCTGAGGTGGATCACAGTGAAGGATGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CAGAGGGCTCTGCAGGACATTGCTGAGGTGGATCACAGTGAAGGATGCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CCGTCAGGGCACCCCGGAGATGTCGAGAAGCAGTCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CCGTCAGGGCACCCCGGAGATGTCGAGAAGCAGTCTGGTG