seq1 = pF1KB8785.tfa, 879 bp
seq2 = pF1KB8785/gi568815597r_12747411.tfa (gi568815597r:12747411_12948289), 200879 bp

>pF1KB8785 879
>gi568815597r:12747411_12948289 (Chr1)

(complement)

1-879  (100001-100879)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGCAACGTTACCAACAAGATGGATCCTCACTCCATGAACTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAGCAACGTTACCAACAAGATGGATCCTCACTCCATGAACTCCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTGTTCATTGGGAATCTCAACACTCTTGTTGTCAAGAAATCGGATGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTGTTCATTGGGAATCTCAACACTCTTGTTGTCAAGAAATCGGATGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCGATCTTTTCCAAGTATGGCAAAATTGCGGGCTGCTCTGTTCATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGCGATCTTTTCCAAGTATGGCAAAATTGCGGGCTGCTCTGTTCATAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCTTTGCCTTCGTTCAATATGATAAGGAGAAAAATGCCCGGGCTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCTTTGCCTTCGTTCAATATGATAAGGAGAAAAATGCCCGGGCTGCTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCAGGAGAGGATGGCAGAATGATTGCTAGCCAGGTTGTAGATATTAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGCAGGAGAGGATGGCAGAATGATTGCTAGCCAGGTTGTAGATATTAACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCTGCGGAGCCAAAAGTGAACCGAGGAAACGCAGGTGTGAAACGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGCTGCGGAGCCAAAAGTGAACCGAGGAAACGCAGGTGTGAAACGATCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCAGCGGAGATGTACGGCTCCTCTTTTGACTTGGACTATGGCTTTCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCAGCGGAGATGTACGGCTCCTCTTTTGACTTGGACTATGGCTTTCAACG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGATTATTATGATGGAATGTACAGTTTCCCAGCACGTGTACCTCCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGATTATTATGATGGAATGTACAGTTTCCCAGCACGTGTACCTCCTCCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTCCCATTGCTCTGGCTGTAGTGCCCTCGAAACGTCAACGTCTATCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTCCCATTGCTCTGGCTGTAGTGCCCTCGAAACGTCAACGTCTATCAGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AACACCTCACGAAGGGGCAAAAGTGGCTTCAATTCTAAGAGTGGAAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AACACCTCACGAAGGGGCAAAAGTGGCTTCAATTCTAAGAGTGGAAAGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGGATCTTCCAAGTCTGGAAAGTTGAAAGGTGATGACCTTCAGGCCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGGATCTTCCAAGTCTGGAAAGTTGAAAGGTGATGACCTTCAGGCCATTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGCAGGAGTTGACCCAGATAAAACAGAAAGTGGATTCTCTCCTGGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGCAGGAGTTGACCCAGATAAAACAGAAAGTGGATTCTCTCCTGGAAAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGGAAAAAATTGAAAAGGAACAGAGCAAACAAGAGGTAGAGGTGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTGGAAAAAATTGAAAAGGAACAGAGCAAACAAGAGGTAGAGGTGAAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGCTAAGTCAGAAGAGGAGCAGAGCAGTAGCTCCATGAAGAAAGATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGCTAAGTCAGAAGAGGAGCAGAGCAGTAGCTCCATGAAGAAAGATGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTCATGTGAAGATGGAGTCTGAGGGGGGTGCAGAAGACTCTGCTGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTCATGTGAAGATGGAGTCTGAGGGGGGTGCAGAAGACTCTGCTGAGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGGGACCCACTGGATGATGATGTTAATGAAGATCAGGGGGATGACCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGGGACCCACTGGATGATGATGTTAATGAAGATCAGGGGGATGACCAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGAGTTGATCAAGGATGATGAAAAAGAGGCTGAGGAAGGAGAGGATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGAGTTGATCAAGGATGATGAAAAAGAGGCTGAGGAAGGAGAGGATGACA

    850     .    :    .    :    .
    851 GAGACAGCACCAATGGCCAGGATGACTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GAGACAGCACCAATGGCCAGGATGACTCT