seq1 = pF1KB8753.tfa, 588 bp
seq2 = pF1KB8753/gi568815585f_49530448.tfa (gi568815585f:49530448_49731035), 200588 bp

>pF1KB8753 588
>gi568815585f:49530448_49731035 (Chr13)

1-588  (100001-100588)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTTCTGTGAATTCCAGAGGTCACAAGGCGGAAGCCCAGGTGGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGTTCTGTGAATTCCAGAGGTCACAAGGCGGAAGCCCAGGTGGTGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATGGGCCTGGACTCGGCGGGCAAGACCACGCTCCTTTACAAGCTGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATGGGCCTGGACTCGGCGGGCAAGACCACGCTCCTTTACAAGCTGAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCACCAGCTGGTGGAGACCCTGCCCACTGTTGGTTTCAACGTGGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCACCAGCTGGTGGAGACCCTGCCCACTGTTGGTTTCAACGTGGAGCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGAAAGCTCCTGGGCACGTGTCACTGACTCTCTGGGACGTTGGGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGAAAGCTCCTGGGCACGTGTCACTGACTCTCTGGGACGTTGGGGGGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCCCCGCTCAGAGCCAGCTGGAAGGACTATCTGGAAGGCACAGATATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCCCCGCTCAGAGCCAGCTGGAAGGACTATCTGGAAGGCACAGATATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCGTGTACGTGCTGGACAGCACAGATGAAGCCCGCTTACCCGAGTCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCGTGTACGTGCTGGACAGCACAGATGAAGCCCGCTTACCCGAGTCGGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCTGAGCTCACAGAAGTCCTGAACGACCCCAACATGGCTGGCGTCCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCTGAGCTCACAGAAGTCCTGAACGACCCCAACATGGCTGGCGTCCCCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTTGGTGCTGGCCAACAAGCAGGAGGCACCTGATGCACTTCCGCTGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTTGGTGCTGGCCAACAAGCAGGAGGCACCTGATGCACTTCCGCTGCTTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGATCAGAAACAGGCTGAGTCTAGAGAGATTCCAGGACCACCGCTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100401 AGATCAGAAACAGGCTGAGTCTAGAGAGATTCCAGGACCACTGCTGGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCCGGGGCTGCAGTGCCCTCACTGGGGAGGGGCTGCCCGAGGCCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCCGGGGCTGCAGTGCCCTCACTGGGGAGGGGCTGCCCGAGGCCCTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAGCCTGTGGAGCCTCCTGAAATCTCGCAGCTGCATGTGTCTGCAGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAGCCTGTGGAGCCTCCTGAAATCTCGCAGCTGCATGTGTCTGCAGGCGA

    550     .    :    .    :    .    :    .
    551 GAGCCCATGGGGCTGAGCGCGGAGACAGCAAGAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GAGCCCATGGGGCTGAGCGCGGAGACAGCAAGAGATCT