seq1 = pF1KB8749.tfa, 1254 bp
seq2 = pF1KB8749/gi568815581f_70032088.tfa (gi568815581f:70032088_70233341), 201254 bp

>pF1KB8749 1254
>gi568815581f:70032088_70233341 (Chr17)

1-1254  (100001-101254)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCTATTACGGCAGCAGCTATCATATTATCAATGCGGACGCAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCTATTACGGCAGCAGCTATCATATTATCAATGCGGACGCAAAATA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCAGGCTACCCGCCAGAGCACATTATAGCTGAGAAGAGAAGAGCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCAGGCTACCCGCCAGAGCACATTATAGCTGAGAAGAGAAGAGCAAGAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GACGATTACTTCACAAAGATGGCAGCTGTAATGTCTACTTCAAGCACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GACGATTACTTCACAAAGATGGCAGCTGTAATGTCTACTTCAAGCACATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTGGAGAATGGGGAAGCTATGTGGTTGACATCTTCACCACTCTTGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTGGAGAATGGGGAAGCTATGTGGTTGACATCTTCACCACTCTTGTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACCAAGTGGCGCCATATGTTTGTGATATTTTCTTTATCTTATATTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACCAAGTGGCGCCATATGTTTGTGATATTTTCTTTATCTTATATTCTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGTGGTTGATATTTGGCTCTGTCTTTTGGCTCATAGCCTTTCATCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGTGGTTGATATTTGGCTCTGTCTTTTGGCTCATAGCCTTTCATCATGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GATCTATTAAATGATCCAGACATCACACCTTGTGTTGACAACGTCCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GATCTATTAAATGATCCAGACATCACACCTTGTGTTGACAACGTCCATTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTTCACAGGGGCCTTTTTGTTCTCCCTAGAGACCCAAACCACCATAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTTCACAGGGGCCTTTTTGTTCTCCCTAGAGACCCAAACCACCATAGGAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGGTTATCGCTGTGTTACTGAAGAATGTTCTGTGGCCGTGCTCATGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGGTTATCGCTGTGTTACTGAAGAATGTTCTGTGGCCGTGCTCATGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCCTCCAGTCCATCTTAAGTTGCATCATAAATACCTTTATCATTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCCTCCAGTCCATCTTAAGTTGCATCATAAATACCTTTATCATTGGAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGCCTTGGCCAAAATGGCAACTGCTCGAAAGAGAGCCCAAACCATTCGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGCCTTGGCCAAAATGGCAACTGCTCGAAAGAGAGCCCAAACCATTCGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCAGCTACTTTGCACTTATAGGTATGAGAGATGGGAAGCTTTGCCTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCAGCTACTTTGCACTTATAGGTATGAGAGATGGGAAGCTTTGCCTCATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TGGCGCATTGGTGATTTTCGGCCAAACCACGTGGTAGAAGGAACAGTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TGGCGCATTGGTGATTTTCGGCCAAACCACGTGGTAGAAGGAACAGTTAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGCCCAACTTCTCCGCTATACAGAAGACAGTGAAGGGAGGATGACGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGCCCAACTTCTCCGCTATACAGAAGACAGTGAAGGGAGGATGACGATGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CATTTAAAGACCTCAAATTAGTCAACGACCAAATCATCCTGGTCACCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CATTTAAAGACCTCAAATTAGTCAACGACCAAATCATCCTGGTCACCCCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTAACTATTGTCCATGAAATTGACCATGAGAGCCCTCTGTATGCCCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTAACTATTGTCCATGAAATTGACCATGAGAGCCCTCTGTATGCCCTTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCGCAAAGCAGTAGCCAAAGATAACTTTGAGATTTTGGTGACATTTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCGCAAAGCAGTAGCCAAAGATAACTTTGAGATTTTGGTGACATTTATCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATACTGGTGATTCCACTGGAACATCTCACCAATCTAGAAGCTCCTATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATACTGGTGATTCCACTGGAACATCTCACCAATCTAGAAGCTCCTATGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCCCGAGAAATTCTCTGGGGCCATAGGTTTAATGATGTCTTGGAAGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCCCGAGAAATTCTCTGGGGCCATAGGTTTAATGATGTCTTGGAAGTTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GAGGAAGTATTACAAAGTGAACTGCTTACAGTTTGAAGGAAGTGTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GAGGAAGTATTACAAAGTGAACTGCTTACAGTTTGAAGGAAGTGTGGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TATATGCCCCCTTTTGCAGTGCCAAGCAATTGGACTGGAAAGACCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TATATGCCCCCTTTTGCAGTGCCAAGCAATTGGACTGGAAAGACCAGCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CTCCACATAGAAAAAGCACCACCAGTTCGAGAATCCTGCACGTCGGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CTCCACATAGAAAAAGCACCACCAGTTCGAGAATCCTGCACGTCGGACAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CAAGGCGAGACGAAGGTCATTTAGTGCAGTTGCCATTGTCAGCAGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CAAGGCGAGACGAAGGTCATTTAGTGCAGTTGCCATTGTCAGCAGCTGTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AAAACCCTGAGGAGACCACCACTTCCGCCACACATGAATATAGGGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AAAACCCTGAGGAGACCACCACTTCCGCCACACATGAATATAGGGAAACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CCTTATCAGAAAGCTCTCCTGACTTTAAACAGAATCTCTGTAGAATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CCTTATCAGAAAGCTCTCCTGACTTTAAACAGAATCTCTGTAGAATCCCA

   1250 
   1251 AATG
        ||||
 101251 AATG