seq1 = pF1KB8730.tfa, 1179 bp
seq2 = pF1KB8730/gi568815581r_7569612.tfa (gi568815581r:7569612_7776594), 206983 bp

>pF1KB8730 1179
>gi568815581r:7569612_7776594 (Chr17)

(complement)

1-74  (100001-100074)   100% ->
75-96  (100192-100213)   100% ->
97-375  (100323-100601)   99% ->
376-559  (101359-101542)   100% ->
560-672  (101624-101736)   100% ->
673-782  (102305-102414)   100% ->
783-919  (102758-102894)   100% ->
920-993  (102987-103060)   100% ->
994-1100  (105880-105986)   100% ->
1101-1179  (106905-106983)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGAGCCGCAGTCAGATCCTAGCGTCGAGCCCCCTCTGAGTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGAGCCGCAGTCAGATCCTAGCGTCGAGCCCCCTCTGAGTCAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AACATTTTCAGACCTATGGAAACT         ACTTCCTGAAAACAACG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100051 AACATTTTCAGACCTATGGAAACTGTG...CAGACTTCCTGAAAACAACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTCTG         TCCCCCTTGCCGTCCCAAGCAATGGATGATTTGATG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100209 TTCTGGTA...CAGTCCCCCTTGCCGTCCCAAGCAATGGATGATTTGATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CTGTCCCCGGACGATATTGAACAATGGTTCACTGAAGACCCAGGTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100359 CTGTCCCCGGACGATATTGAACAATGGTTCACTGAAGACCCAGGTCCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGAAGCTCCCAGAATGCCAGAGGCTGCTCCCCGCGTGGCCCCTGCACCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 100409 TGAAGCTCCCAGAATGCCAGAGGCTGCTCCCCCCGTGGCCCCTGCACCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAGCTCCTACACCGGCGGCCCCTGCACCAGCCCCCTCCTGGCCCCTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100459 CAGCTCCTACACCGGCGGCCCCTGCACCAGCCCCCTCCTGGCCCCTGTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCTTCTGTCCCTTCCCAGAAAACCTACCAGGGCAGCTACGGTTTCCGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100509 TCTTCTGTCCCTTCCCAGAAAACCTACCAGGGCAGCTACGGTTTCCGTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGGCTTCTTGCATTCTGGGACAGCCAAGTCTGTGACTTGCACG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100559 GGGCTTCTTGCATTCTGGGACAGCCAAGTCTGTGACTTGCACGGTC...C

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    376   TACTCCCCTGCCCTCAACAAGATGTTTTGCCAACTGGCCAAGACCTGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101357 AGTACTCCCCTGCCCTCAACAAGATGTTTTGCCAACTGGCCAAGACCTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCTGTGCAGCTGTGGGTTGATTCCACACCCCCGCCCGGCACCCGCGTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101407 CCTGTGCAGCTGTGGGTTGATTCCACACCCCCGCCCGGCACCCGCGTCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CGCCATGGCCATCTACAAGCAGTCACAGCACATGACGGAGGTTGTGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101457 CGCCATGGCCATCTACAAGCAGTCACAGCACATGACGGAGGTTGTGAGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCTGCCCCCACCATGAGCGCTGCTCAGATAGCGATG         GTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101507 GCTGCCCCCACCATGAGCGCTGCTCAGATAGCGATGGTG...TAGGTCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCCCCTCCTCAGCATCTTATCCGAGTGGAAGGAAATTTGCGTGTGGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101629 GCCCCTCCTCAGCATCTTATCCGAGTGGAAGGAAATTTGCGTGTGGAGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTTGGATGACAGAAACACTTTTCGACATAGTGTGGTGGTGCCCTATGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101679 TTTGGATGACAGAAACACTTTTCGACATAGTGTGGTGGTGCCCTATGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CGCCTGAG         GTTGGCTCTGACTGTACCACCATCCACTACAAC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 101729 CGCCTGAGGTC...TAGGTTGGCTCTGACTGTACCACCATCCACTACAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TACATGTGTAACAGTTCCTGCATGGGCGGCATGAACCGGAGGCCCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102338 TACATGTGTAACAGTTCCTGCATGGGCGGCATGAACCGGAGGCCCATCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CACCATCATCACACTGGAAGACTCCAG         TGGTAATCTACTGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102388 CACCATCATCACACTGGAAGACTCCAGGTC...TAGTGGTAATCTACTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GACGGAACAGCTTTGAGGTGCGTGTTTGTGCCTGTCCTGGGAGAGACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102772 GACGGAACAGCTTTGAGGTGCGTGTTTGTGCCTGTCCTGGGAGAGACCGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CGCACAGAGGAAGAGAATCTCCGCAAGAAAGGGGAGCCTCACCACGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102822 CGCACAGAGGAAGAGAATCTCCGCAAGAAAGGGGAGCCTCACCACGAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GCCCCCAGGGAGCACTAAGCGAG         CACTGCCCAACAACACCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 102872 GCCCCCAGGGAGCACTAAGCGAGGTA...TAGCACTGCCCAACAACACCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GCTCCTCTCCCCAGCCAAAGAAGAAACCACTGGATGGAGAATATTTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103005 GCTCCTCTCCCCAGCCAAAGAAGAAACCACTGGATGGAGAATATTTCACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CTTCAG         ATCCGTGGGCGTGAGCGCTTCGAGATGTTCCGAGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103055 CTTCAGGTA...CAGATCCGTGGGCGTGAGCGCTTCGAGATGTTCCGAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GCTGAATGAGGCCTTGGAACTCAAGGATGCCCAGGCTGGGAAGGAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105915 GCTGAATGAGGCCTTGGAACTCAAGGATGCCCAGGCTGGGAAGGAGCCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GGGGGAGCAGGGCTCACTCCAG         CCACCTGAAGTCCAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 105965 GGGGGAGCAGGGCTCACTCCAGGTG...CAGCCACCTGAAGTCCAAAAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 GGTCAGTCTACCTCCCGCCATAAAAAACTCATGTTCAAGACAGAAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106924 GGTCAGTCTACCTCCCGCCATAAAAAACTCATGTTCAAGACAGAAGGGCC

   1250     .    :
   1170 TGACTCAGAC
        ||||||||||
 106974 TGACTCAGAC