seq1 = pF1KB8715.tfa, 1158 bp
seq2 = pF1KB8715/gi568815576r_29160063.tfa (gi568815576r:29160063_29365626), 205564 bp

>pF1KB8715 1158
>gi568815576r:29160063_29365626 (Chr22)

(complement)

1-148  (100001-100148)   100% ->
149-532  (101409-101792)   100% ->
533-695  (104763-104925)   100% ->
696-983  (105014-105301)   100% ->
984-1158  (105390-105564)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCATGCCAGGGGCCCCCATGGCCAACTGTCCCCAGCACTGCCTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCATGCCAGGGGCCCCCATGGCCAACTGTCCCCAGCACTGCCTCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCTCAGTCCTGATGCTGCTGATGAGCACCCTGTGGCTGGTGGGGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCTCAGTCCTGATGCTGCTGATGAGCACCCTGTGGCTGGTGGGGGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCCCGGCCTGGTCCTGGCCCCGGAGCTGTTGCTGGACCCCTGGCAGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100101 GCCCCGGCCTGGTCCTGGCCCCGGAGCTGTTGCTGGACCCCTGGCAGGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    149        TGCACCGGCTGCTGACCCATGCCCTGGGCCACACGGCCCTGCC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 G...CAGTGCACCGGCTGCTGACCCATGCCCTGGGCCACACGGCCCTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGGCCTGCTCCTGAGCCTGCTGCTCCTGCCCACTGTGGGCTGGCAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101452 AGGCCTGCTCCTGAGCCTGCTGCTCCTGCCCACTGTGGGCTGGCAGCAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGTGCCACCTGGGCACGCTGAGATTCCTGCATGCCTCAGCCCTGCTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101502 AGTGCCACCTGGGCACGCTGAGATTCCTGCATGCCTCAGCCCTGCTCGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGGCTTCTGGGCTGCTGGCAGTGCTGCTGGCAGGCCTTGGGCTGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101552 CTGGCTTCTGGGCTGCTGGCAGTGCTGCTGGCAGGCCTTGGGCTGTCCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGCAGCCGGCAGCTGTGGATACATGCCTGTCCACCTGGCCATGCTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101602 TGCAGCCGGCAGCTGTGGATACATGCCTGTCCACCTGGCCATGCTGGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGGAGGGACACCGCCCTAGACGGCCCCGTGGGGCACTGCCACCGTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101652 GGGAGGGACACCGCCCTAGACGGCCCCGTGGGGCACTGCCACCGTGGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCGCCGTGGCTGCTGCTTGCCCTGACCCCACTGCTCAGCTCTGAGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101702 TCGCCGTGGCTGCTGCTTGCCCTGACCCCACTGCTCAGCTCTGAGCCACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CTTCCTGCAGCTCCTTTGCGGCCTCCTTGCCGGCCTGGCCT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 101752 CTTCCTGCAGCTCCTTTGCGGCCTCCTTGCCGGCCTGGCCTGTA...CAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATGCAGCTGGGGCCTTCCGGTGGCTGGAACCCTCAGAGCGACGGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104763 ATGCAGCTGGGGCCTTCCGGTGGCTGGAACCCTCAGAGCGACGGCTGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GTGCTGCAGGAGGGCGTCTTGTGCAGGACCTTGGCGGGGTGCTGGCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104813 GTGCTGCAGGAGGGCGTCTTGTGCAGGACCTTGGCGGGGTGCTGGCCCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GAGGCTCCTTGCCACCCCGGGTAGCCTGGCGGAGCTGCCTGTCACCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104863 GAGGCTCCTTGCCACCCCGGGTAGCCTGGCGGAGCTGCCTGTCACCCATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CTGCCGGAGTGAG         GCCTCCCATCCCTGGACCGCCTTATGTG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 104913 CTGCCGGAGTGAGGTG...CAGGCCTCCCATCCCTGGACCGCCTTATGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GCCTCCCCTGACCTCTGGTCCCACTGGGAAGACTCAGCCCTGCCCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105042 GCCTCCCCTGACCTCTGGTCCCACTGGGAAGACTCAGCCCTGCCCCCACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AAGCCTGAGGCCTGTGCAGCCCACCTGGGAGGGCTCCTCAGAGGCAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105092 AAGCCTGAGGCCTGTGCAGCCCACCTGGGAGGGCTCCTCAGAGGCAGGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TGGACTGGGCTGGGGCCAGCTTCTCCCCAGGGACTCCGATGTGGGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105142 TGGACTGGGCTGGGGCCAGCTTCTCCCCAGGGACTCCGATGTGGGCGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TTGGATGAGCAGATGCTGCAGGAGGGCATCCAGGCCTCGCTTCTTGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105192 TTGGATGAGCAGATGCTGCAGGAGGGCATCCAGGCCTCGCTTCTTGACGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GCCAGCCCAGGAACCCCAGAGCGCACCATGGCTGTCCAAGTCCTCTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105242 GCCAGCCCAGGAACCCCAGAGCGCACCATGGCTGTCCAAGTCCTCTGTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CCTCTCTGCG         GCTGCAGCAGCTGGAGCGCATGGGCTTCCCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 105292 CCTCTCTGCGGTA...CAGGCTGCAGCAGCTGGAGCGCATGGGCTTCCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 ACGGAGCAGGCGGTGGTGGCACTGGCAGCCACAGGCCGTGTGGAGGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105421 ACGGAGCAGGCGGTGGTGGCACTGGCAGCCACAGGCCGTGTGGAGGGTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CGTGTCACTGTTGGTTGGAGGACAAGTGGGCACTGAGACCCTGGTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105471 CGTGTCACTGTTGGTTGGAGGACAAGTGGGCACTGAGACCCTGGTGACCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 ATGGAAAGGGTGGGCCTGCCCACTCCGAGGGTCCTGGGCCTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105521 ATGGAAAGGGTGGGCCTGCCCACTCCGAGGGTCCTGGGCCTCCC