seq1 = pF1KB8702.tfa, 1113 bp
seq2 = pF1KB8702/gi568815575f_154786375.tfa (gi568815575f:154786375_154913754), 127380 bp

>pF1KB8702 1113
>gi568815575f:154786375_154913754 (ChrX)

1-1113  (100001-101113)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCAGCGGCTGCAGGCCTGGGCGGCGGCGGCGCCGGCCCGGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCAGCGGCTGCAGGCCTGGGCGGCGGCGGCGCCGGCCCGGGACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGGCCGGGGACTTCCTGGCCCGCTACCGGCTGGTATCGAACAAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGGCCGGGGACTTCCTGGCCCGCTACCGGCTGGTATCGAACAAGCTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAAGCGGTTCCTGCGGAAGCCGAACGTGGCGGAGGCCGGCGAGCAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAAGCGGTTCCTGCGGAAGCCGAACGTGGCGGAGGCCGGCGAGCAGTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGACAGCTGGGCCGGGAGCTGCGCGCCCAGGAGTGTCTGCCCTACGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGACAGCTGGGCCGGGAGCTGCGCGCCCAGGAGTGTCTGCCCTACGCGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTGGTGCCAGCTGGCGGTGGCGCGCTGCCAGCAGGCGCTCTTCCACGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTGGTGCCAGCTGGCGGTGGCGCGCTGCCAGCAGGCGCTCTTCCACGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGGGGAGGCGCTGGCCCTCACCGAGGCCGCCCGCCTCTTCCTGCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCGGGGAGGCGCTGGCCCTCACCGAGGCCGCCCGCCTCTTCCTGCGGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGCGCGACGCGCGCCAGCGCCTGGTCTGCCCCGCCGCCTACGGGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGCGCGACGCGCGCCAGCGCCTGGTCTGCCCCGCCGCCTACGGGGAGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTGCAGGCCGCCGCCAGCGCCCTGGGCGCCGCGGTGCGTCTGCACCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTGCAGGCCGCCGCCAGCGCCCTGGGCGCCGCGGTGCGTCTGCACCTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCTGGGCCAGCCGGCCGCCGCCGCCGCCCTCTGCCTCGAGCTGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCTGGGCCAGCCGGCCGCCGCCGCCGCCCTCTGCCTCGAGCTGGCCGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCCTGCGCGACCTGGGCCAGCCGGCCGCCGCCGCCGGTCACTTCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCCTGCGCGACCTGGGCCAGCCGGCCGCCGCCGCCGGTCACTTCCAGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGCCGCCCAGCTCCAGCTGCCCCAGCTGCCCCTGGCCGCGCTGCAGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGCCGCCCAGCTCCAGCTGCCCCAGCTGCCCCTGGCCGCGCTGCAGGCGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTGGCGAGGCCGCCTCCTGCCAGCTGCTGGCGCGCGACTACACCGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTGGCGAGGCCGCCTCCTGCCAGCTGCTGGCGCGCGACTACACCGGCGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGGCGGTCTTCACGCGCATGCAGCGCCTGGCGCGGGAGCACGGCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTGGCGGTCTTCACGCGCATGCAGCGCCTGGCGCGGGAGCACGGCAGCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCCGGTGCAGTCACTGCCGCCGCCCCCGCCGCCGGCACCCCAGCCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCCGGTGCAGTCACTGCCGCCGCCCCCGCCGCCGGCACCCCAGCCCGGGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCGGGGCGACGCCCGCCCTACCGGCCGCGCTGCTTCCTCCGAACTCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCGGGGCGACGCCCGCCCTACCGGCCGCGCTGCTTCCTCCGAACTCCGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCGGCGGCGCCCTCTCCCGCCGCCCTGGGCGCCTTCTCGGACGTGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCGGCGGCGCCCTCTCCCGCCGCCCTGGGCGCCTTCTCGGACGTGCTGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCGCTGCGAGGTGTCCCGCGTGCTGCTGCTGCTCCTCCTGCAACCACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCGCTGCGAGGTGTCCCGCGTGCTGCTGCTGCTCCTCCTGCAACCACCGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCGCCAAGCTGCTGCCGGAGCACGCCCAGACCCTGGAGAAGTACTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCGCCAAGCTGCTGCCGGAGCACGCCCAGACCCTGGAGAAGTACTCCTGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GAGGCTTTTGACAGCCACGGGCAGGAGAGCAGCGGCCAGCTTCCCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GAGGCTTTTGACAGCCACGGGCAGGAGAGCAGCGGCCAGCTTCCCGAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCTCTTTCTGCTGCTCCAGTCTTTGGTCATGGCTACCCACGAAAAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCTCTTTCTGCTGCTCCAGTCTTTGGTCATGGCTACCCACGAAAAGGACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CGGAAGCCATCAAGTCGCTGCAGGTGGAGATGTGGCCACTGTTGACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CGGAAGCCATCAAGTCGCTGCAGGTGGAGATGTGGCCACTGTTGACTGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGCAGAACCACCTCCTTCACCTCGTTCTGCAAGAAACCATCTCCCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGCAGAACCACCTCCTTCACCTCGTTCTGCAAGAAACCATCTCCCCCTC

   1100     .    :
   1101 AGGACAGGGAGTC
        |||||||||||||
 101101 AGGACAGGGAGTC