seq1 = pF1KB8695.tfa, 2160 bp
seq2 = pF1KB8695/gi568815591r_108372404.tfa (gi568815591r:108372404_108615491), 243088 bp

>pF1KB8695 2160
>gi568815591r:108372404_108615491 (Chr7)

(complement)

1-1056  (100001-101056)   100% ->
1057-1206  (101199-101348)   100% ->
1207-1358  (112850-113001)   100% ->
1359-1453  (117915-118009)   100% ->
1454-1625  (118737-118908)   100% ->
1626-1692  (124025-124093)   92% ->
1693-1888  (136113-136308)   100% ->
1889-2160  (142817-143088)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTATTAATCTGACTGTAGATATATATATTTACCTCCTTAGTAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTATTAATCTGACTGTAGATATATATATTTACCTCCTTAGTAATGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAGAAGTGTTTGTGGGAAGCAGAGAAGCAAGCAACTGTATTTCTTGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAGAAGTGTTTGTGGGAAGCAGAGAAGCAAGCAACTGTATTTCTTGTTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CACCTAAGCATTACTGGAGGATAAGCCACATCAGTCTACAAAGAGGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CACCTAAGCATTACTGGAGGATAAGCCACATCAGTCTACAAAGAGGTTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CATACAAACATAATAAGATGTAAATGGACCAAAAGTGAAGCACATTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CATACAAACATAATAAGATGTAAATGGACCAAAAGTGAAGCACATTCTTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGTAAGCACTGTTACTCTCCAAGCAACCATGGTTTACATATTGGGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGTAAGCACTGTTACTCTCCAAGCAACCATGGTTTACATATTGGGATTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGAAACTTAGCACTTCTGCTCCCAAGGGACTTACAAAAGTGAACATTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGAAACTTAGCACTTCTGCTCCCAAGGGACTTACAAAAGTGAACATTTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTCCCGTATTAAAAGTACTTTGAACTCTGTTTCAAAGGCTGTTTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTCCCGTATTAAAAGTACTTTGAACTCTGTTTCAAAGGCTGTTTTTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAATCAAAATGAAATGATTTCACGTTTAGCTCAATTTAAGCCAAGTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAATCAAAATGAAATGATTTCACGTTTAGCTCAATTTAAGCCAAGTTCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAATTTTAAGAAAAGTATCGGATAGTGGCTGGTTAAAACAGAAAAACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAATTTTAAGAAAAGTATCGGATAGTGGCTGGTTAAAACAGAAAAACATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAACAAGCCATCAAATCTCTGAAAAAATATAGTGACAAATCAGCAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAACAAGCCATCAAATCTCTGAAAAAATATAGTGACAAATCAGCAGAAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAGTCCTTTTCCAGAAGAGAAAAGTCACATTATAGACAAAGAAGAAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAGTCCTTTTCCAGAAGAGAAAAGTCACATTATAGACAAAGAAGAAGATA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TAGGTAAACGCAGTCTTTTTCATTACACAAGTTCTATAACCACAAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TAGGTAAACGCAGTCTTTTTCATTACACAAGTTCTATAACCACAAAATTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGAGACTCATTCTACTTTTTATCAAATCATATTAATTCATATTTCAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGAGACTCATTCTACTTTTTATCAAATCATATTAATTCATATTTCAAACG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TAAGGAAAAAATGTCTCAACAAAAGGAAAATGAACATTTCCGGGACAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TAAGGAAAAAATGTCTCAACAAAAGGAAAATGAACATTTCCGGGACAAAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CAGAACTTGAAGATAAAAAGGTAGAAGAGGGGAAATTAAGATCTCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CAGAACTTGAAGATAAAAAGGTAGAAGAGGGGAAATTAAGATCTCCAGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCTGGCATCCTGGCTTATAAGCCAGGCTCAGAATCTGTACATACGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCTGGCATCCTGGCTTATAAGCCAGGCTCAGAATCTGTACATACGGTGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAAGCCTACAAGTCCTTCTGCGATACCTGATGTTCTTCAAGTTTCAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAAGCCTACAAGTCCTTCTGCGATACCTGATGTTCTTCAAGTTTCAACTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AACAAAGTATTGCTAACTTTCTTTCTCGTCCCACGGAAGGTGTACAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AACAAAGTATTGCTAACTTTCTTTCTCGTCCCACGGAAGGTGTACAAGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTAGTAGGTGGTTATATTGGTGGACTTGTCCCCAAATTAAAGTATGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTAGTAGGTGGTTATATTGGTGGACTTGTCCCCAAATTAAAGTATGATTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AAAGAGTCAGTCAGAAGAACAGGAAGAGCCTGCTAAAACTGATCAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AAAGAGTCAGTCAGAAGAACAGGAAGAGCCTGCTAAAACTGATCAGGCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TCAGCAAAGACAGAAATGCAGAGGAGAAAAAGCGTTTATCTCTTCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCAGCAAAGACAGAAATGCAGAGGAGAAAAAGCGTTTATCTCTTCAGCGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAAAAG         ATTATCGCAAGGGTGAGTATTGATAACAGGACCCG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAAAAGGCA...TAGATTATCGCAAGGGTGAGTATTGATAACAGGACCCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GGCATTAGTTCAGGCATTAAGAAGAACAACTGACCCAAAGCTCTGCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101234 GGCATTAGTTCAGGCATTAAGAAGAACAACTGACCCAAAGCTCTGCATTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 CTAGGGTTGAAGAACTGACTTTTCATCTTCTAGAATTTCCTGAAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101284 CTAGGGTTGAAGAACTGACTTTTCATCTTCTAGAATTTCCTGAAGGAAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 GGAGTGGCTGTCAAG         GAAAGAATTATTCCATATTTATTACG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101334 GGAGTGGCTGTCAAGGTA...TAGGAAAGAATTATTCCATATTTATTACG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 ACTGAGACAAATTAAGGATGAAACTCTTCAGGCTGCAGTTAGAGAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112876 ACTGAGACAAATTAAGGATGAAACTCTTCAGGCTGCAGTTAGAGAAATTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 TGGCCCTAATTGGCTATGTGGATCCAGTGAAAGGGAGAGGAATCCGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112926 TGGCCCTAATTGGCTATGTGGATCCAGTGAAAGGGAGAGGAATCCGAATT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 CTCTCAATTGATGGTGGAGGAACAAG         GGGCGTGGTTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 112976 CTCTCAATTGATGGTGGAGGAACAAGGTA...TAGGGGCGTGGTTGCTCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 CCAGACCCTACGAAAATTAGTTGAACTTACTCAGAAGCCAGTTCATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117930 CCAGACCCTACGAAAATTAGTTGAACTTACTCAGAAGCCAGTTCATCAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 TCTTTGATTACATTTGTGGTGTAAGCACAG         GTGCCATATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 117980 TCTTTGATTACATTTGTGGTGTAAGCACAGGTA...CAGGTGCCATATTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 GCTTTCATGTTGGGGTTGTTTCATATGCCCTTGGATGAATGTGAGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118748 GCTTTCATGTTGGGGTTGTTTCATATGCCCTTGGATGAATGTGAGGAACT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 TTATCGAAAATTAGGATCAGATGTATTTTCACAAAATGTCATTGTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118798 TTATCGAAAATTAGGATCAGATGTATTTTCACAAAATGTCATTGTTGGAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1565 CAGTAAAAATGAGTTGGAGCCATGCATTTTATGACAGTCAAACATGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118848 CAGTAAAAATGAGTTGGAGCCATGCATTTTATGACAGTCAAACATGGGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 AACATTCTTAA         GGATAGGATGGGATCTGCACTGATGATTGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 118898 AACATTCTTAAGTA...AAGGGATAGGATGGGATCTGCACTGATGATTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 AACAGCAAGAAACCCCACATGTCCTAAGGTA GCT  GCT         G
        |||||||||||||||||||||||||||||||-|||--| ->>>...>>>|
 124055 AACAGCAAGAAACCCCACATGTCCTAAGGTAAGCTTAGA GTC...CAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1694 ATGGAGGTTTGCTTCTGAATAACCCTTCGGCATTAGCTATGCATGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136114 ATGGAGGTTTGCTTCTGAATAACCCTTCGGCATTAGCTATGCATGAGTGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1744 AAATGTCTTTGGCCAGATGTGCCGTTAGAGTGCATAGTATCCCTGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136164 AAATGTCTTTGGCCAGATGTGCCGTTAGAGTGCATAGTATCCCTGGGCAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1794 TGGACGTTATGAGAGTGATGTGAGAAACACGGTAACATACACAAGCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136214 TGGACGTTATGAGAGTGATGTGAGAAACACGGTAACATACACAAGCTTGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1844 AAACTAAACTTTCTAATGTTATCAACAGTGCTACAGATACAGAAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 136264 AAACTAAACTTTCTAATGTTATCAACAGTGCTACAGATACAGAAGGTT..

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1889     AAGTCCATATAATGCTTGATGGCCTGTTACCTCCTGACACCTATTT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136314 .CAGAAGTCCATATAATGCTTGATGGCCTGTTACCTCCTGACACCTATTT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1935 TAGATTCAATCCTGTAATGTGTGAAAACATACCTCTAGATGAAAGTCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142863 TAGATTCAATCCTGTAATGTGTGAAAACATACCTCTAGATGAAAGTCGAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1985 ATGAAAAGCTGGATCAGCTGCAGTTGGAAGGGTTGAAATACATAGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142913 ATGAAAAGCTGGATCAGCTGCAGTTGGAAGGGTTGAAATACATAGAAAGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2035 AATGAACAAAAAATGAAAAAAGTTGCAAAAATATTAAGTCAAGAAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142963 AATGAACAAAAAATGAAAAAAGTTGCAAAAATATTAAGTCAAGAAAAAAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2085 AACTCTGCAGAAAATTAATGATTGGATAAAATTAAAAACTGATATGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143013 AACTCTGCAGAAAATTAATGATTGGATAAAATTAAAAACTGATATGTATG

   2200     .    :    .    :    .
   2135 AAGGACTTCCATTCTTTTCAAAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||
 143063 AAGGACTTCCATTCTTTTCAAAATTG