seq1 = pF1KB8692.tfa, 1437 bp
seq2 = pF1KB8692/gi568815594f_70588678.tfa (gi568815594f:70588678_70790114), 201437 bp

>pF1KB8692 1437
>gi568815594f:70588678_70790114 (Chr4)

1-1437  (100001-101437)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGGGGAGATCCCGGCGGCGCGGAGCAGCTAAGTGGGCAGCTGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGGGGAGATCCCGGCGGCGCGGAGCAGCTAAGTGGGCAGCTGTGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCCAAGGCAGGTCCCACGCTCACCGACGAAAATGGAGATGATTTAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCCAAGGCAGGTCCCACGCTCACCGACGAAAATGGAGATGATTTAGGAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCACCCTCACCAGGGGACACCAGCTACTACCAAGATCAGGTAGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCCACCCTCACCAGGGGACACCAGCTACTACCAAGATCAGGTAGATGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTCATGAGGCACGATCCCGGGCCGCCTTAGCTAAGGGCTGGAATGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTCATGAGGCACGATCCCGGGCCGCCTTAGCTAAGGGCTGGAATGAAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACAGAGTGGAGACGAGGAGGATGGCGAGGAGGAGGAGGAGGAGGTGCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACAGAGTGGAGACGAGGAGGATGGCGAGGAGGAGGAGGAGGAGGTGCTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCCTAGATATGGACGATGAGGACGACGAAGATGGAGGGAATGCGGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCCTAGATATGGACGATGAGGACGACGAAGATGGAGGGAATGCGGGGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGAGGAGGAGGAGAATGCCGATGATGATGGTGGGAGCTCCGTGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGGAGGAGGAGGAGAATGCCGATGATGATGGTGGGAGCTCCGTGCAAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGAAGCTGAGGCCTCTGTGGATCCCAGTTTGTCGTGGGGTCAGAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGAAGCTGAGGCCTCTGTGGATCCCAGTTTGTCGTGGGGTCAGAGGAAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AACTTTACTATGACACGGACTATGGTTCCAAGTCCCGAGGCCGGCAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AACTTTACTATGACACGGACTATGGTTCCAAGTCCCGAGGCCGGCAGAGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAACAGGAGGCAGAGGAGGAGGAAAGAGAGGAGGAGGAGGAGGCACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAACAGGAGGCAGAGGAGGAGGAAAGAGAGGAGGAGGAGGAGGCACAGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATTCAGCGGCGCCTAGCCCAAGCGCTGCAAGAGGATGATTTTGGTGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATTCAGCGGCGCCTAGCCCAAGCGCTGCAAGAGGATGATTTTGGTGTCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCTGGGTTGAGGCCTTTGCAAAACCAGTGCCTCAGGTAGATGAGGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCTGGGTTGAGGCCTTTGCAAAACCAGTGCCTCAGGTAGATGAGGCTGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACACGGGTCGTGAAGGATTTGGCTAAAGTTTCAGTGAAAGAGAAGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACACGGGTCGTGAAGGATTTGGCTAAAGTTTCAGTGAAAGAGAAGCTGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AATGTTGCGAAAGGAATCACCAGAACTCTTGGAGCTGATAGAAGACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AATGTTGCGAAAGGAATCACCAGAACTCTTGGAGCTGATAGAAGACCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AAGTCAAGTTGACAGAGGTTAAGGATGAGCTGGAGCCATTGTTAGAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AAGTCAAGTTGACAGAGGTTAAGGATGAGCTGGAGCCATTGTTAGAGTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTGGAACAAGGGATCATTCCACCCGGAAAAGGAAGCCAATACTTGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTGGAACAAGGGATCATTCCACCCGGAAAAGGAAGCCAATACTTGAGGAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAAGTACAACCTCTACTTGAATTATTGCTCGAACATCAGTTTTTATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAAGTACAACCTCTACTTGAATTATTGCTCGAACATCAGTTTTTATTTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCCTGAAAGCTAGGAGAGTCCCAGCACATGGACATCCTGTCATAGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCCTGAAAGCTAGGAGAGTCCCAGCACATGGACATCCTGTCATAGAAAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTTGTTACCTACCGAAATTTGATCAACAAGCTGTCCGTTGTGGATCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTTGTTACCTACCGAAATTTGATCAACAAGCTGTCCGTTGTGGATCAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCTGTCCTCAGAAGTTCGTCATCTGTTGACACTTAAGGATGATGCTGTAA
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCTGTCCTCAGAAATTCGTCATCTGTTGACACTTAAGGATGATGCTGTAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGAAAGAACTGATTCCAAAAGCAAAATCCACCAAGCCCAAACCAAAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGAAAGAACTGATTCCAAAAGCAAAATCCACCAAGCCCAAACCAAAGTCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GTTTCAAAGACTTCTGCTGCTGCCTGTGCTGTTACAGATCTTTCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GTTTCAAAGACTTCTGCTGCTGCCTGTGCTGTTACAGATCTTTCTGATGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TTCTGATTTTGATGAAAAAGCAAAACTGAAGTACTATAAAGAAATAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TTCTGATTTTGATGAAAAAGCAAAACTGAAGTACTATAAAGAAATAGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ACAGGCAAAAGCTAAAGAGAAAGAAAGAAGAAAATAGCACTGAAGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 ACAGGCAAAAGCTAAAGAGAAAGAAAGAAGAAAATAGCACTGAAGAACAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GCTCTTGAAGATCAAAATGCAAAGAGAGCTATTACCTATCAAATTGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GCTCTTGAAGATCAAAATGCAAAGAGAGCTATTACCTATCAAATTGCTAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 AAATAGGGGACTTACTCCTAGGAGAAAGAAGATTGATCGCAATCCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 AAATAGGGGACTTACTCCTAGGAGAAAGAAGATTGATCGCAATCCCAGAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TGAAACACAGAGAGAAGTTCAGAAGAGCCAAAATTAGAAGAAGAGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 TGAAACACAGAGAGAAGTTCAGAAGAGCCAAAATTAGAAGAAGAGGCCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GTTCGTGAAGTTCGTAAAGAAGAGCAACGTTATAGTGGTGAATTATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GTTCGTGAAGTTCGTAAAGAAGAGCAACGTTATAGTGGTGAATTATCTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .
   1401 CATTCGTGCAGGAGTTAAAAAGAGCATTAAGCTTAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CATTCGTGCAGGAGTTAAAAAGAGCATTAAGCTTAAA