seq1 = pF1KB8685.tfa, 2151 bp
seq2 = pF1KB8685/gi568815579r_45695923.tfa (gi568815579r:45695923_45915176), 219254 bp

>pF1KB8685 2151
>gi568815579r:45695923_45915176 (Chr19)

(complement)

1-650  (100001-100650)   100% ->
651-888  (104337-104574)   99% ->
889-1653  (110161-110925)   100% ->
1654-1798  (112913-113057)   100% ->
1799-1916  (114614-114731)   100% ->
1917-2151  (119071-119305)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGAGACCTGCCGCCCTACCCTGAGCGCCCTGCCCAGCAGCCTCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGAGACCTGCCGCCCTACCCTGAGCGCCCTGCCCAGCAGCCTCCGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGAGGACTTCTCAGGCCTCCCAGAGGCGGCACAGTCGGGACCAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGAGGACTTCTCAGGCCTCCCAGAGGCGGCACAGTCGGGACCAAGCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCCCTGGCAGCGGACCCCGAGGAGAGGCAGCAGATACCTCCAGACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGCCCTGGCAGCGGACCCCGAGGAGAGGCAGCAGATACCTCCAGACGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGCGAAACGCCCCTGGTTGGTCACAGAGGGGCAGCCTGTCCCAACAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGCGAAACGCCCCTGGTTGGTCACAGAGGGGCAGCCTGTCCCAACAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAACTTGCTGATGCCCCAGGTCTTCCAGGCTGAGGAAGCCCGGCTGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAACTTGCTGATGCCCCAGGTCTTCCAGGCTGAGGAAGCCCGGCTGGGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCATGGAGTACCCATCTGTGAACACGGGCTTTCCCTCAGAGTTCCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCATGGAGTACCCATCTGTGAACACGGGCTTTCCCTCAGAGTTCCAGCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGCCTTACTCTGATGAAAGCAGGATGCAGGTCGCCGAGCTCACCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGCCTTACTCTGATGAAAGCAGGATGCAGGTCGCCGAGCTCACCACCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTAATGCTGCAGCGGCTCCAGCAGGGCCAAAGCAGCCTGTTCCAGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTAATGCTGCAGCGGCTCCAGCAGGGCCAAAGCAGCCTGTTCCAGCAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGACCCCACCTTCCAGGAGCCCCCAGTCAACCCCTTGGGCCAGTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGACCCCACCTTCCAGGAGCCCCCAGTCAACCCCTTGGGCCAGTTCAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTCTACCAGACAGACCAGTTCTCTGAAGGTGCCCAGCACGGGCCTTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTCTACCAGACAGACCAGTTCTCTGAAGGTGCCCAGCACGGGCCTTACAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AAGGGATGACCCTGCCCTTCAGTTCTTGCCCTCTGAGCTGGGCTTCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AAGGGATGACCCTGCCCTTCAGTTCTTGCCCTCTGAGCTGGGCTTCCCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTACAGTGCCCAGGTGCCTGAGCCCGAGCCTCTGGAGCTGGCCGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTACAGTGCCCAGGTGCCTGAGCCCGAGCCTCTGGAGCTGGCCGTGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AACGCCAAGGCCTACCTGCTGCAGACCAGCATCAATTGCGACCTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AACGCCAAGGCCTACCTGCTGCAGACCAGCATCAATTGCGACCTCAGCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651          GTACGAGCACCTGGTAAATCTGCTGACCAAGATCCTGAACC
        >>>...>>>||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 100651 GTG...CAGGTACGAGCACCTGGTGAATCTGCTGACCAAGATCCTGAACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 AGCGGCCTGAGGACCCCTTGTCTGTCCTGGAGTCTCTGAACCGCACCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104378 AGCGGCCTGAGGACCCCTTGTCTGTCCTGGAGTCTCTGAACCGCACCACG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CAGTGGGAGTGGTTCCACCCCAAGCTGGACACGCTGCGGGACGACCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104428 CAGTGGGAGTGGTTCCACCCCAAGCTGGACACGCTGCGGGACGACCCCGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GATGCAGCCCACCTACAAGATGGCGGAGAAACAGAAGGCGCTGTTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104478 GATGCAGCCCACCTACAAGATGGCGGAGAAACAGAAGGCGCTGTTCACCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GGAGTGGAGGCGGCACTGAAGGCGAACAGGAGATGGAGGAGGAGGTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 104528 GGAGTGGAGGCGGCACTGAAGGCGAACAGGAGATGGAGGAGGAGGTGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    889       GGGGAGACACCAGTGCCCAACATCATGGAGACTGCCTTCTACTT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104578 ...CAGGGGGAGACACCAGTGCCCAACATCATGGAGACTGCCTTCTACTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CGAGCAGGCCGGCGTCGGCCTGAGCTCGGACGAGAGCTTCCGCATTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110205 CGAGCAGGCCGGCGTCGGCCTGAGCTCGGACGAGAGCTTCCGCATTTTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TGGCCATGAAACAGCTGGTGGAGCAGCAGCCCATCCACACCTGTCGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110255 TGGCCATGAAACAGCTGGTGGAGCAGCAGCCCATCCACACCTGTCGCTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 TGGGGCAAGATCCTGGGAATCAAACGCAGCTACCTGGTGGCCGAGGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110305 TGGGGCAAGATCCTGGGAATCAAACGCAGCTACCTGGTGGCCGAGGTGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 ATTCCGGGAGGGCGAGGAGGAGGCAGAGGAGGAGGAGGTGGAGGAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110355 ATTCCGGGAGGGCGAGGAGGAGGCAGAGGAGGAGGAGGTGGAGGAGATGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CGGAAGGTGGCGAGGTCATGGAGGCGCACGGCGAGGAGGAGGGCGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110405 CGGAAGGTGGCGAGGTCATGGAGGCGCACGGCGAGGAGGAGGGCGAGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 GACGAGGAGAAGGCCGTGGACATCGTCCCTAAGTCCGTATGGAAGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110455 GACGAGGAGAAGGCCGTGGACATCGTCCCTAAGTCCGTATGGAAGCCGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 GCCCGTGATCCCCAAGGAGGAGAGCCGCTCAGGCGCCAACAAGTACCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110505 GCCCGTGATCCCCAAGGAGGAGAGCCGCTCAGGCGCCAACAAGTACCTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 ACTTTGTGTGCAACGAGCCGGGCCTGCCATGGACGCGGCTGCCCCACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110555 ACTTTGTGTGCAACGAGCCGGGCCTGCCATGGACGCGGCTGCCCCACGTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 ACTCCAGCCCAGATCGTGAACGCCCGAAAGATCAAGAAGTTCTTCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110605 ACTCCAGCCCAGATCGTGAACGCCCGAAAGATCAAGAAGTTCTTCACAGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 CTACCTGGACACGCCAGTCGTCAGCTACCCACCCTTCCCGGGCAACGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110655 CTACCTGGACACGCCAGTCGTCAGCTACCCACCCTTCCCGGGCAACGAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 CCAACTACCTGCGGGCCCAGATAGCCCGCATCTCGGCCGCCACGCAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110705 CCAACTACCTGCGGGCCCAGATAGCCCGCATCTCGGCCGCCACGCAGGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 AGCCCGCTGGGCTTCTACCAGTTTAGTGAGGAGGAGGGCGACGAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110755 AGCCCGCTGGGCTTCTACCAGTTTAGTGAGGAGGAGGGCGACGAGGAGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 GGAAGGTGGTGCTGGGCGCGACTCCTACGAGGAGAACCCGGACTTCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110805 GGAAGGTGGTGCTGGGCGCGACTCCTACGAGGAGAACCCGGACTTCGAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 GCATCCCCGTGCTGGAGCTGGTCGACTCCATGGCCAACTGGGTGCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110855 GCATCCCCGTGCTGGAGCTGGTCGACTCCATGGCCAACTGGGTGCATCAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 ACACAGCACATCCTGCCGCAG         GGCCGCTGCACTTGGGTGAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 110905 ACACAGCACATCCTGCCGCAGGTG...CAGGGCCGCTGCACTTGGGTGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 CCCTTTGCAGAAGACAGAGGAGGAGGAGGACCTGGGGGAGGAGGAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112933 CCCTTTGCAGAAGACAGAGGAGGAGGAGGACCTGGGGGAGGAGGAAGAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 AGGCAGATGAGGGGCCAGAGGAGGTGGAGCAGGAGGTTGGCCCCCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112983 AGGCAGATGAGGGGCCAGAGGAGGTGGAGCAGGAGGTTGGCCCCCCACTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 CTAACGCCACTTTCAGAAGATGCAG         AAATCATGCACCTGGC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 113033 CTAACGCCACTTTCAGAAGATGCAGGTA...CAGAAATCATGCACCTGGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1815 ACCCTGGACCACCCGCCTGTCCTGCAGCCTCTGCCCGCAGTACTCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114630 ACCCTGGACCACCCGCCTGTCCTGCAGCCTCTGCCCGCAGTACTCAGTGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1865 CCGTTGTGCGCTCCAACCTCTGGCCCGGGGCCTATGCCTATGCCAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114680 CCGTTGTGCGCTCCAACCTCTGGCCCGGGGCCTATGCCTATGCCAGTGGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1915 AA         AAAGTTTGAGAACATCTACATCGGCTGGGGTCACAAGTA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114730 AAGTA...CAGAAAGTTTGAGAACATCTACATCGGCTGGGGTCACAAGTA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 CAGCCCCGAGAGCTTCAACCCGGCCCTGCCAGCCCCCATTCAACAAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119110 CAGCCCCGAGAGCTTCAACCCGGCCCTGCCAGCCCCCATTCAACAAGAGT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006 ACCCCAGTGGCCCAGAGATCATGGAGATGAGTGACCCCACAGTGGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119160 ACCCCAGTGGCCCAGAGATCATGGAGATGAGTGACCCCACAGTGGAAGAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2056 GAGCAGGCTCTGAAAGCAGCCCAGGAACAAGCCCTGGGAGCCACAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119210 GAGCAGGCTCTGAAAGCAGCCCAGGAACAAGCCCTGGGAGCCACAGAGGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2106 GGAGGAGGAGGGCGAGGAGGAGGAGGAGGGCGAGGAGACAGATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119260 GGAGGAGGAGGGCGAGGAGGAGGAGGAGGGCGAGGAGACAGATGAC