seq1 = pF1KB8648.tfa, 1020 bp
seq2 = pF1KB8648/gi568815576r_38420023.tfa (gi568815576r:38420023_38668256), 248234 bp

>pF1KB8648 1020
>gi568815576r:38420023_38668256 (Chr22)

(complement)

1-51  (100001-100051)   100% ->
52-96  (100630-100674)   100% ->
97-243  (101521-101667)   100% ->
244-326  (105888-105970)   100% ->
327-379  (112848-112900)   100% ->
380-421  (115550-115591)   100% ->
422-494  (118260-118332)   100% ->
495-586  (128845-128936)   100% ->
587-660  (129645-129718)   100% ->
661-775  (129848-129962)   100% ->
776-836  (130605-130665)   100% ->
837-953  (146533-146649)   100% ->
954-1020  (148168-148234)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGAGGATCAAGTTGTGGCGGAAGAACCAGGATTCCAAGATGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGAGGATCAAGTTGTGGCGGAAGAACCAGGATTCCAAGATGAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 G         GAATCTTTGTTTCAAGATATTGACCTGTTACAGAAACATG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTA...TAGGAATCTTTGTTTCAAGATATTGACCTGTTACAGAAACATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAATT         AACGTGGCTGACATTAAGAAACTGAAATCAGTAGGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100670 GAATTGTA...CAGAACGTGGCTGACATTAAGAAACTGAAATCAGTAGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 ATCTGTACCATCAAAGGTATACAGATGACAACAAGAAGAGCTCTATGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101557 ATCTGTACCATCAAAGGTATACAGATGACAACAAGAAGAGCTCTATGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGTCAAAGGACTCTCAGAAGCCAAAGTAGACAAGATTAAAGAGGCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101607 TGTCAAAGGACTCTCAGAAGCCAAAGTAGACAAGATTAAAGAGGCAGCGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACAAACTAATT         GAACCAGGATTCTTGACTGCATTTGAGTAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 101657 ACAAACTAATTGTA...TAGGAACCAGGATTCTTGACTGCATTTGAGTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AGTGAAAAGAGGAAAATGGTTTTCCATATCACCACCGGGAGCCAGGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105918 AGTGAAAAGAGGAAAATGGTTTTCCATATCACCACCGGGAGCCAGGAATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGA         TAAGTTACTAGGAGGTGGAATTGAAAGTATGGCAATTA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105968 TGAGTA...CAGTAAGTTACTAGGAGGTGGAATTGAAAGTATGGCAATTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CAGAAGCTTTTGGAG         AATTTCGTACTGGAAAAACCCAGCTT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 112886 CAGAAGCTTTTGGAGGTA...CAGAATTTCGTACTGGAAAAACCCAGCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TCTCATACCCTCTGTG         TGACAGCTCAACTTCCAGGAGCTGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 115576 TCTCATACCCTCTGTGGTA...TAGTGACAGCTCAACTTCCAGGAGCTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 TGGCTACCCAGGAGGAAAGATTATCTTCATTGATACAGAAAATACTTT  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 118285 TGGCTACCCAGGAGGAAAGATTATCTTCATTGATACAGAAAATACTTTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    495        CCGTCCAGATCGCCTTAGGGACATTGCTGATCGCTTTAATGTA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118335 A...CAGCCGTCCAGATCGCCTTAGGGACATTGCTGATCGCTTTAATGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 GACCATGATGCAGTACTGGACAACGTACTTTATGCACGTGCATATACTA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 128888 GACCATGATGCAGTACTGGACAACGTACTTTATGCACGTGCATATACTAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    587         GTGAACATCAGATGGAGCTACTTGATTATGTAGCAGCAAAGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128938 TA...CAGGTGAACATCAGATGGAGCTACTTGATTATGTAGCAGCAAAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 TCCATGAAGAAGCTGGCATCTTCAAGCTATTG         ATTATCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 129687 TCCATGAAGAAGCTGGCATCTTCAAGCTATTGGTA...TAGATTATCGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    670 TCAATAATGGCACTTTTTCGAGTGGATTTCAGTGGCCGTGGGGAGTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129857 TCAATAATGGCACTTTTTCGAGTGGATTTCAGTGGCCGTGGGGAGTTGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 CGAACGGCAGCAAAAATTGGCCCAGATGTTGTCACGACTCCAAAAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129907 CGAACGGCAGCAAAAATTGGCCCAGATGTTGTCACGACTCCAAAAAATCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 CAGAAG         AATATAACGTGGCTGTTTTTGTGACCAATCAAATG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129957 CAGAAGGTA...CAGAATATAACGTGGCTGTTTTTGTGACCAATCAAATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    811 ACTGCCGATCCAGGAGCAACTATGAC         CTTTCAGGCAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 130640 ACTGCCGATCCAGGAGCAACTATGACGTA...CAGCTTTCAGGCAGATCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    852 CAAAAAACCCATTGGGGGACACATTCTGGCTCATGCTTCAACAACAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146548 CAAAAAACCCATTGGGGGACACATTCTGGCTCATGCTTCAACAACAAGAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    902 TAAGCTTGCGAAAGGGAAGAGGAGAGCTCAGAATTGCCAAGATTTATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146598 TAAGCTTGCGAAAGGGAAGAGGAGAGCTCAGAATTGCCAAGATTTATGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 AG         TCCTGAGATGCCTGAAAATGAAGCCACCTTCGCAATAAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146648 AGGTA...TAGTCCTGAGATGCCTGAAAATGAAGCCACCTTCGCAATAAC

   1100     .    :    .    :    .
    993 TGCTGGAGGAATTGGGGATGCCAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 148207 TGCTGGAGGAATTGGGGATGCCAAGGAG