seq1 = pF1KB8640.tfa, 609 bp
seq2 = pF1KB8640/gi568815576r_29213304.tfa (gi568815576r:29213304_29415246), 201943 bp

>pF1KB8640 609
>gi568815576r:29213304_29415246 (Chr22)

(complement)

1-219  (100001-100219)   99% ->
220-344  (101260-101384)   100% ->
345-609  (101679-101943)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGGTAGCCTGCGGGTGGCCGTTCTAGGCGCCCCGGGCGTGGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGGTAGCCTGCGGGTGGCCGTTCTAGGCGCCCCGGGCGTGGGCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACGGCCATCATCCGCCAGTTCGTGTTCGGTGACTACCCCGAGCGCCACC
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACGGCCATCATCCGCCAGTTCCTGTTCGGTGACTACCCCGAGCGCCACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCCCACGGACGGGCCGCGCCTCTACCGACCCGCGGTGCTGCTCGACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCCCACGGACGGGCCGCGCCTCTACCGACCCGCGGTGCTGCTCGACGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCGTCTACGACTTGAGCATCCGCGACGGCGACGTCGCTGGCCCCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCGTCTACGACTTGAGCATCCGCGACGGCGACGTCGCTGGCCCCGGCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAGCCCCGGGGGTCCGGAG         GAGTGGCCAGACGCTAAGGACT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100201 GAGCCCCGGGGGTCCGGAGGTA...CAGGAGTGGCCAGACGCTAAGGACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGAGCTTGCAGGACACGGACGCCTTCGTGCTCGTCTACGACATCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101282 GGAGCTTGCAGGACACGGACGCCTTCGTGCTCGTCTACGACATCTGCAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCGGACAGTTTCGACTACGTGAAGGCCCTGCGGCAGCGCATCGCGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101332 CCGGACAGTTTCGACTACGTGAAGGCCCTGCGGCAGCGCATCGCGGAGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAG         GCCGGCGGGCGCGCCCGAAGCGCCCATCCTCGTGGTAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101382 CAGGTA...CAGGCCGGCGGGCGCGCCCGAAGCGCCCATCCTCGTGGTAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCAACAAGCGGGACAGGCAGCGGCTGCGCTTCGGACCGCGGCGCGCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101717 GCAACAAGCGGGACAGGCAGCGGCTGCGCTTCGGACCGCGGCGCGCGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCCGCCCTAGTGCGCAGGGGCTGGCGCTGCGGCTACCTCGAGTGCTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101767 GCCGCCCTAGTGCGCAGGGGCTGGCGCTGCGGCTACCTCGAGTGCTCCGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CAAGTACAACTGGCACGTGCTGCGTCTCTTCCGCGAGCTGCTGCGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101817 CAAGTACAACTGGCACGTGCTGCGTCTCTTCCGCGAGCTGCTGCGCTGCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTCTGGTGCGCGCGCGCCCTGCACACCCGGCCCTGCGCCTGCAGGGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101867 CTCTGGTGCGCGCGCGCCCTGCACACCCGGCCCTGCGCCTGCAGGGGGCG

    600     .    :    .    :    .
    583 CTGCATCCCGCGCGCTGCAGCCTCATG
        |||||||||||||||||||||||||||
 101917 CTGCATCCCGCGCGCTGCAGCCTCATG