seq1 = pF1KB8635.tfa, 723 bp
seq2 = pF1KB8635/gi568815583f_63497411.tfa (gi568815583f:63497411_63701683), 204273 bp

>pF1KB8635 723
>gi568815583f:63497411_63701683 (Chr15)

1-335  (100001-100335)   100% ->
336-723  (103886-104273)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACATAACCCAGCTCAACCGGGAGTGCCTGCTGCACCTCTTCTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACATAACCCAGCTCAACCGGGAGTGCCTGCTGCACCTCTTCTCCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTAGACAAGGACAGCAGGAAGAGCCTTGCCAGGACCTGCTCCCAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTAGACAAGGACAGCAGGAAGAGCCTTGCCAGGACCTGCTCCCAGCTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGACGTGTTTGAGGACCCCGCACTCTGGTCCCTGCTGCACTTCCGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGACGTGTTTGAGGACCCCGCACTCTGGTCCCTGCTGCACTTCCGTTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCACTGAACTCCAGAAGGACAACTTCCTCCTGGGCCCGGCACTCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCACTGAACTCCAGAAGGACAACTTCCTCCTGGGCCCGGCACTCCGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCTCCATCTGCTGGCACTCCAGCCGCGTGCAGGTGTGCAGCATTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCTCCATCTGCTGGCACTCCAGCCGCGTGCAGGTGTGCAGCATTGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACTGGCTCAAGAGTGCCTTCCAGAGAAGCATCTGCAGCCGGCACGAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACTGGCTCAAGAGTGCCTTCCAGAGAAGCATCTGCAGCCGGCACGAGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGTCAATGATTTCCTCCTCCGGGTGTGCGACAG         GCTTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100301 CTGGTCAATGATTTCCTCCTCCGGGTGTGCGACAGGTA...CAGGCTTTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGCTGTGCGCTCCCCACGGAGGCGGGAGGCGCCTGCACCGTCCTCGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103892 TGCTGTGCGCTCCCCACGGAGGCGGGAGGCGCCTGCACCGTCCTCGGGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTCCGATCGCCGTTGGACCGAAATCACCTCGGTGGGGAGGACCTGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103942 CTCCGATCGCCGTTGGACCGAAATCACCTCGGTGGGGAGGACCTGACCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCGGAGTTCGCCGACTTGCGCTCGGGGGTGACGGGGGCCAGGGCTGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103992 TCGGAGTTCGCCGACTTGCGCTCGGGGGTGACGGGGGCCAGGGCTGCCGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCGCAGGGGTCTGGGGAGCCTCCGGGCGGAGCGACCCAGCGAGACCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104042 GCGCAGGGGTCTGGGGAGCCTCCGGGCGGAGCGACCCAGCGAGACCCCGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CGGCTCCCGGAGTGTCCTGGGGACCGCCACCTCCAGGAGCCCTGGTGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 104092 CGGCTCCCGGAGTGTCCTGGGGACCGCCACCTCCAGGAGCCCCGGTGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ATCTCGGTGAAGCAGGAGGAGGGGAAGCAGGGGCGCACGGGCAGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104142 ATCTCGGTGAAGCAGGAGGAGGGGAAGCAGGGGCGCACGGGCAGAAGGAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCACCGAGCCGCTCCTCCTTGCGGTTTTGCCCGCACGCGCGTCTGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104192 CCACCGAGCCGCTCCTCCTTGCGGTTTTGCCCGCACGCGCGTCTGCCCGC

    700     .    :    .    :    .    :
    692 CCACCTTTCCTGGGGCGGATGCGTTCCCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 104242 CCACCTTTCCTGGGGCGGATGCGTTCCCGCAG