seq1 = pF1KB8620.tfa, 552 bp
seq2 = pF1KB8620/gi568815593r_76073632.tfa (gi568815593r:76073632_76274183), 200552 bp

>pF1KB8620 552
>gi568815593r:76073632_76274183 (Chr5)

(complement)

1-552  (100001-100552)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGTGAGTATAAGCTAGTCGTTCTTGGCTCAGGAGGCGTTGGAAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 100001 ATGCGTGAGTATAAGCTAGTCGTTCTTGGCTCACGAGGCGTTGGAAAGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCTTTGACTGTACAATTTGTTCAAGGAATTTTTGTAGAAAAATACGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCTTTGACTGTACAATTTGTTCAAGGAATTTTTGTAGAAAAATACGATC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTACGATAGAAGATTCTTATAGAAAGCAAGTTGAAGTAGATGCACAACAG
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTACGATAGAAGATTCTTATAGAGAGCAAGTTGAAGTAGATGCACAACAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGTATGCTTGAAATCTTGGATACTGCAGGAACGGAGCAATTTACAGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGTATGCTTGAAATCTTGGATACTGCAGGAACGGAGCAATTTACAGCAAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAGGGATTTATACATGAAAAATGGACAAGGATTTGCATTAGTTTATTCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 100201 GAGGGATTTATACATGAAAAATGGACAAGGGTTTGCATTAGTTTATTCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCACAGCACAGTCCACATTTAACGATTTACAAGACCTGAGAGAACAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCACAGCACAGTCCACATTTAACGATTTACAAGACCTGAGAGAACAGATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTTCGAGTTAAAGACACTGATGATGTTCCAATGATTCTTGTTGGTAATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTTCGAGTTAAAGACACTGATGATGTTCCAATGATTCTTGTTGGTAATAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTGTGACTTGGAAGATGAAAGAGTTGTAGGGAAGGAACAAGGTCAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTGTGACTTGGAAGATGAAAGAGTTGTAGGGAAGGAACAAGGTCAAAATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TAGCAAGACAATGGAACAACTGTGCATTCTTAGAATCTTCTGCAAAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TAGCAAGACAATGGAACAACTGTGCATTCTTAGAATCTTCTGCAAAATCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AAAATAAATGTTAATGAGATCTTTTATGACCTAGTGCGGCAAATTAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAAATAAATGTTAATGAGATCTTTTATGACCTAGTGCGGCAAATTAACAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AAAAACTCCAGTGCCTGGGAAGGCTCGCAAAAAGTCATCATGTCAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AAAAACTCCAGTGCCTGGGAAGGCTCGCAAAAAGTCATCATGTCAGCTGC

    550 
    551 TT
        ||
 100551 TT