seq1 = pF1KB8620.tfa, 552 bp
seq2 = pF1KB8620/gi568815586f_68548725.tfa (gi568815586f:68548725_68757184), 208460 bp

>pF1KB8620 552
>gi568815586f:68548725_68757184 (Chr12)

1-57  (100001-100057)   100% ->
58-126  (101676-101744)   100% ->
127-183  (103271-103327)   100% ->
184-324  (105388-105528)   100% ->
325-468  (107582-107725)   100% ->
469-552  (108377-108460)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGTGAGTATAAGCTAGTCGTTCTTGGCTCAGGAGGCGTTGGAAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGTGAGTATAAGCTAGTCGTTCTTGGCTCAGGAGGCGTTGGAAAGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCTTTG         ACTGTACAATTTGTTCAAGGAATTTTTGTAGAAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGCTTTGGTA...CAGACTGTACAATTTGTTCAAGGAATTTTTGTAGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AATACGATCCTACGATAGAAGATTCTTATAGAAAG         CAAGTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 101710 AATACGATCCTACGATAGAAGATTCTTATAGAAAGGTA...CAGCAAGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GAAGTAGATGCACAACAGTGTATGCTTGAAATCTTGGATACTGCAGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103277 GAAGTAGATGCACAACAGTGTATGCTTGAAATCTTGGATACTGCAGGAAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 G         GAGCAATTTACAGCAATGAGGGATTTATACATGAAAAATG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103327 GGTA...TAGGAGCAATTTACAGCAATGAGGGATTTATACATGAAAAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GACAAGGATTTGCATTAGTTTATTCCATCACAGCACAGTCCACATTTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105428 GACAAGGATTTGCATTAGTTTATTCCATCACAGCACAGTCCACATTTAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GATTTACAAGACCTGAGAGAACAGATTCTTCGAGTTAAAGACACTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105478 GATTTACAAGACCTGAGAGAACAGATTCTTCGAGTTAAAGACACTGATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 T         GTTCCAATGATTCTTGTTGGTAATAAGTGTGACTTGGAAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105528 TGTA...TAGGTTCCAATGATTCTTGTTGGTAATAAGTGTGACTTGGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATGAAAGAGTTGTAGGGAAGGAACAAGGTCAAAATCTAGCAAGACAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107622 ATGAAAGAGTTGTAGGGAAGGAACAAGGTCAAAATCTAGCAAGACAATGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AACAACTGTGCATTCTTAGAATCTTCTGCAAAATCAAAAATAAATGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107672 AACAACTGTGCATTCTTAGAATCTTCTGCAAAATCAAAAATAAATGTTAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGAG         ATCTTTTATGACCTAGTGCGGCAAATTAACAGAAAAA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107722 TGAGGTA...CAGATCTTTTATGACCTAGTGCGGCAAATTAACAGAAAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    506 CTCCAGTGCCTGGGAAGGCTCGCAAAAAGTCATCATGTCAGCTGCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108414 CTCCAGTGCCTGGGAAGGCTCGCAAAAAGTCATCATGTCAGCTGCTT