seq1 = pF1KB8596.tfa, 2694 bp
seq2 = pF1KB8596/gi568815587r_27921203.tfa (gi568815587r:27921203_28197947), 276745 bp

>pF1KB8596 2694
>gi568815587r:27921203_28197947 (Chr11)

(complement)

1-325  (100001-100325)   100% ->
326-483  (103148-103305)   100% ->
484-588  (106435-106539)   100% ->
589-699  (107221-107331)   100% ->
700-897  (109227-109424)   100% ->
898-1074  (113140-113316)   100% ->
1075-1149  (114705-114779)   100% ->
1150-1262  (114980-115092)   100% ->
1263-1425  (120779-120941)   100% ->
1426-1590  (128525-128689)   100% ->
1591-1712  (135432-135553)   100% ->
1713-1948  (138787-139022)   100% ->
1949-2396  (161284-161731)   100% ->
2397-2504  (162454-162561)   100% ->
2505-2614  (174098-174207)   100% ->
2615-2694  (176666-176745)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGTCACTGAGGAAGACCTGTGCCACCATATGAAAGTAGTAGTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGTCACTGAGGAAGACCTGTGCCACCATATGAAAGTAGTAGTTCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTACGTCCGGAAAACACTAAAGAAAAAGCAGCTGGATTTCATAAAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTACGTCCGGAAAACACTAAAGAAAAAGCAGCTGGATTTCATAAAGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCATGTTGTGGATAAACATATCCTAGTTTTTGATCCCAAACAAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTCATGTTGTGGATAAACATATCCTAGTTTTTGATCCCAAACAAGAAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCAGTTTTTTCCATGGAAAGAAAACTACAAATCAAAATGTTATAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCAGTTTTTTCCATGGAAAGAAAACTACAAATCAAAATGTTATAAAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACAAAATAAGGATCTTAAATTTGTATTTGATGCTGTTTTTGATGAAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACAAAATAAGGATCTTAAATTTGTATTTGATGCTGTTTTTGATGAAACGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAACTCAGTCAGAAGTTTTTGAACACACTACTAAGCCAATTCTTCGTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAACTCAGTCAGAAGTTTTTGAACACACTACTAAGCCAATTCTTCGTAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTTTGAATGGATATAATTGCACAG         TACTTGCCTATGGTGC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100301 TTTTTGAATGGATATAATTGCACAGGTA...CAGTACTTGCCTATGGTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CACTGGTGCTGGGAAGACCCACACTATGCTAGGATCAGCTGATGAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103164 CACTGGTGCTGGGAAGACCCACACTATGCTAGGATCAGCTGATGAACCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GAGTGATGTATCTAACAATGTTACACCTTTACAAATGCATGGATGAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103214 GAGTGATGTATCTAACAATGTTACACCTTTACAAATGCATGGATGAGATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAAGAAGAGAAAATATGTAGTACTGCAGTTTCATATCTGGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 103264 AAAGAAGAGAAAATATGTAGTACTGCAGTTTCATATCTGGAGGTA...AA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    484  GTATATAATGAACAGATTCGTGATCTCTTAGTAAATTCAGGGCCACTTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106434 GGTATATAATGAACAGATTCGTGATCTCTTAGTAAATTCAGGGCCACTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTGTCCGGGAAGATACCCAAAAAGGGGTGGTCGTTCATGGACTTACTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106484 CTGTCCGGGAAGATACCCAAAAAGGGGTGGTCGTTCATGGACTTACTTTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CACCAG         CCCAAATCCTCAGAAGAAATTTTACATTTATTGGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106534 CACCAGGTA...CAGCCCAAATCCTCAGAAGAAATTTTACATTTATTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TAATGGAAACAAAAACAGGACACAACATCCCACTGATATGAATGCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107256 TAATGGAAACAAAAACAGGACACAACATCCCACTGATATGAATGCCACAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CTTCTCGTTCTCATGCTGTTTTCCAA         ATTTACTTGCGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 107306 CTTCTCGTTCTCATGCTGTTTTCCAAGTA...AAGATTTACTTGCGACAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CAAGACAAAACAGCAAGTATCAATCAAAATGTCCGTATTGCCAAGATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109242 CAAGACAAAACAGCAAGTATCAATCAAAATGTCCGTATTGCCAAGATGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 ACTCATTGACCTGGCAGGATCTGAGCGAGCAAGTACTTCCGGTGCTAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109292 ACTCATTGACCTGGCAGGATCTGAGCGAGCAAGTACTTCCGGTGCTAAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GGACCCGATTTGTAGAAGGCACAAATATTAATAGATCACTTTTAGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109342 GGACCCGATTTGTAGAAGGCACAAATATTAATAGATCACTTTTAGCTCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GGGAATGTCATCAATGCCTTAGCAGATTCAAAG         AGAAAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 109392 GGGAATGTCATCAATGCCTTAGCAGATTCAAAGGTA...CAGAGAAAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TCAGCATATCCCTTACAGAAATAGTAAGCTTACTCGCTTGTTAAAGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113148 TCAGCATATCCCTTACAGAAATAGTAAGCTTACTCGCTTGTTAAAGGATT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CTCTTGGAGGAAACTGTCAAACTATAATGATAGCTGCTGTTAGTCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113198 CTCTTGGAGGAAACTGTCAAACTATAATGATAGCTGCTGTTAGTCCTTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 TCTGTATTCTACGATGACACATATAACACTCTTAAGTATGCTAACCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113248 TCTGTATTCTACGATGACACATATAACACTCTTAAGTATGCTAACCGGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 AAAGGACATTAAATCTTCT         TTGAAGAGCAATGTTCTTAATG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 113298 AAAGGACATTAAATCTTCTGTA...CAGTTGAAGAGCAATGTTCTTAATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TCAATAATCATATAACTCAATATGTAAAGATCTGTAATGAGCAGAAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114727 TCAATAATCATATAACTCAATATGTAAAGATCTGTAATGAGCAGAAGGCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GAG         ATTTTATTGTTAAAAGAAAAACTAAAAGCCTATGAAGA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114777 GAGGTA...TAGATTTTATTGTTAAAAGAAAAACTAAAAGCCTATGAAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 ACAGAAAGCCTTCACTAATGAAAATGACCAAGCAAAGTTAATGATTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115018 ACAGAAAGCCTTCACTAATGAAAATGACCAAGCAAAGTTAATGATTTCAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 ACCCTCAGGAAAAAGAAATCGAAAG         GTTTCAAGAAATCCTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 115068 ACCCTCAGGAAAAAGAAATCGAAAGGTA...TAGGTTTCAAGAAATCCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 AACTGCTTGTTCCAGAATCGAGAAGAAATTAGACAAGAATATCTGAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120795 AACTGCTTGTTCCAGAATCGAGAAGAAATTAGACAAGAATATCTGAAGTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGAAATGTTACTTAAAGAAAATGAACTTAAATCATTCTACCAACAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120845 GGAAATGTTACTTAAAGAAAATGAACTTAAATCATTCTACCAACAACAGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 GCCATAAACAAATAGAAATGATGTGTTCTGAAGACAAAGTAGAAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 120895 GCCATAAACAAATAGAAATGATGTGTTCTGAAGACAAAGTAGAAAAGGTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1426       GCCACTGGAAAACGAGATCATAGACTTGCAATGTTGAAAACTCG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120945 ...CAGGCCACTGGAAAACGAGATCATAGACTTGCAATGTTGAAAACTCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TCGCTCCTACCTGGAGAAAAGGAGGGAGGAGGAATTGAAGCAATTTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128569 TCGCTCCTACCTGGAGAAAAGGAGGGAGGAGGAATTGAAGCAATTTGATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 AGAATACTAATTGGCTCCATCGTGTCGAAAAAGAAATGGGACTCTTAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128619 AGAATACTAATTGGCTCCATCGTGTCGAAAAAGAAATGGGACTCTTAAGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CAAAACGGTCATATTCCAAAG         GAACTCAAGAAAGATCTTCA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 128669 CAAAACGGTCATATTCCAAAGGTA...TAGGAACTCAAGAAAGATCTTCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 TTGTCACCATTTGCACCTCCAGAACAAAGATTTGAAAGCACAAATTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135452 TTGTCACCATTTGCACCTCCAGAACAAAGATTTGAAAGCACAAATTAGAC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 ATATGATGGATCTAGCTTGTCTTCAGGAACAGCAACACAGGCAGACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135502 ATATGATGGATCTAGCTTGTCTTCAGGAACAGCAACACAGGCAGACTGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 GC         AGTATTGAATGCTTTACTTCCAACCCTAAGAAAACAATA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135552 GCGTG...TAGAGTATTGAATGCTTTACTTCCAACCCTAAGAAAACAATA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 TTGCACATTAAAAGAAGCCGGCCTGTCAAATGCTGCTTTTGAATCTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138826 TTGCACATTAAAAGAAGCCGGCCTGTCAAATGCTGCTTTTGAATCTGACT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 TCAAAGAGATCGAACATTTGGTAGAGAGGAAAAAAGTGGTAGTTTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138876 TCAAAGAGATCGAACATTTGGTAGAGAGGAAAAAAGTGGTAGTTTGGGCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 GACCAAACTGCCGAACAACCAAAGCAAAACGATCTACCAGGGATTTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138926 GACCAAACTGCCGAACAACCAAAGCAAAACGATCTACCAGGGATTTCTGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 TCTTATGACCTTTCCACAACTTGGACCAGTTCAGCCTATTCCTTGTT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 138976 TCTTATGACCTTTCCACAACTTGGACCAGTTCAGCCTATTCCTTGTTGTA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1949       GCTCATCTTCAGGTGGAACTAATCTGGTTAAGATTCCTACAGAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139026 ...TAGGCTCATCTTCAGGTGGAACTAATCTGGTTAAGATTCCTACAGAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 AAAAGAACTCGGAGAAAACTAATGCCATCTCCCTTGAAAGGACAGCATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161328 AAAAGAACTCGGAGAAAACTAATGCCATCTCCCTTGAAAGGACAGCATAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 TCTAAAGTCTCCACCATCTCAAAGTGTGCAGCTCAATGATTCTCTTAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161378 TCTAAAGTCTCCACCATCTCAAAGTGTGCAGCTCAATGATTCTCTTAGCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 AAGAACTTCAGCCTATTGTATATACACCAGAAGACTGTAGAAAAGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161428 AAGAACTTCAGCCTATTGTATATACACCAGAAGACTGTAGAAAAGCTTTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2143 CAAAATCCGTCTACAGTAACCTTAATGAAACCATCATCATTTACTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161478 CAAAATCCGTCTACAGTAACCTTAATGAAACCATCATCATTTACTACAAG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2193 TTTTCAGGCTATCAGCTCAAACATAAACAGTGATAATTGTCTGAAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161528 TTTTCAGGCTATCAGCTCAAACATAAACAGTGATAATTGTCTGAAAATGT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2243 TGTGTGAAGTAGCTATCCCTCATAATAGAAGAAAAGAATGTGGACAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161578 TGTGTGAAGTAGCTATCCCTCATAATAGAAGAAAAGAATGTGGACAGGAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 GACTTGGACTCTACATTTACTATATGTGAAGACATCAAGAGCTCGAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161628 GACTTGGACTCTACATTTACTATATGTGAAGACATCAAGAGCTCGAAGTG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2343 TAAATTACCCGAACAAGAATCACTACCAAATGATAACAAAGACATTTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161678 TAAATTACCCGAACAAGAATCACTACCAAATGATAACAAAGACATTTTAC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2393 AACG         GCTTGATCCTTCTTCATTCTCAACTAAGCATTCTATG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161728 AACGGTA...CAGGCTTGATCCTTCTTCATTCTCAACTAAGCATTCTATG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2434 CCTGTACCAAGCATGGTGCCATCCTACATGGCAATGACTACTGCTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162491 CCTGTACCAAGCATGGTGCCATCCTACATGGCAATGACTACTGCTGCCAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2484 AAGGAAACGGAAATTAACAAG         TTCTACATCAAACAGTTCGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 162541 AAGGAAACGGAAATTAACAAGGTA...AAGTTCTACATCAAACAGTTCGT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2525 TAACTGCAGACGTAAATTCTGGATTTGCCAAACGTGTTCGACAAGATAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 174118 TAACTGCAGACGTAAATTCTGGATTTGCCAAACGTGTTCGACAAGATAAT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2575 TCAAGTGAGAAGCACTTACAAGAAAACAAACCAACAATGG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 174168 TCAAGTGAGAAGCACTTACAAGAAAACAAACCAACAATGGGTA...TAGA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2616 ACATAAAAGAAACATCTGTAAAATAAATCCAAGCATGGTTAGAAAATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176667 ACATAAAAGAAACATCTGTAAAATAAATCCAAGCATGGTTAGAAAATTTG

   2800     .    :    .    :    .
   2666 GAAGAAATATTTCAAAAGGAAATCTAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||
 176717 GAAGAAATATTTCAAAAGGAAATCTAAGA