seq1 = pF1KB8571.tfa, 1719 bp
seq2 = pF1KB8571/gi568815581f_73135483.tfa (gi568815581f:73135483_73347338), 211856 bp

>pF1KB8571 1719
>gi568815581f:73135483_73347338 (Chr17)

1-1513  (100001-101513)   99% ->
1514-1621  (107414-107521)   99% ->
1622-1719  (111759-111856)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGATAATCCACCCAGAATGGAAGTGTGTCCTTACTGTAAGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTGATAATCCACCCAGAATGGAAGTGTGTCCTTACTGTAAGAAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATTTAAACGATTAAAATCCCACTTGCCATACTGTAAGATGATAGGATCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 100051 ATTTAAACGATTAAAATCCCACTTGCCATACTGTAAGATGATAGGACCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCATACCTACTGATCAAAAAGTTTATCAGTCCAAGCCAGCTACACTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCATACCTACTGATCAAAAAGTTTATCAGTCCAAGCCAGCTACACTCCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGTGCTAAAAAGATGAAAGGACCAATCAAAGATTTAATTAAAGCTAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGTGCTAAAAAGATGAAAGGACCAATCAAAGATTTAATTAAAGCTAAAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAAGAGTTAGAGACAGAGAATGAAGAAAGAAATTCTAAGTTGGTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAAGAGTTAGAGACAGAGAATGAAGAAAGAAATTCTAAGTTGGTGGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACAAACCAGAACAGACAGTGAAGACCTTTCCACTGCCAGCTGTTGGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACAAACCAGAACAGACAGTGAAGACCTTTCCACTGCCAGCTGTTGGTTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAAAGAGCAGCTACTACAAAGGCAGATAAAGACATCAAGAATCCAATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAAAGAGCAGCTACTACAAAGGCAGATAAAGACATCAAGAATCCAATCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACCATCCTTCAAAATGTTAAAAAATACTAAACCAATGACTACTTTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACCATCCTTCAAAATGTTAAAAAATACTAAACCAATGACTACTTTCCAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAGAAACCAAGGCTCAGTTTTACGCATCAGAGAAAACCTCTCCTAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAGAAACCAAGGCTCAGTTTTACGCATCAGAGAAAACCTCTCCTAAAAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAACTTGCCAAAGATTTGCCTAAATCAGGAGAAAGTCGATGTAATCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAACTTGCCAAAGATTTGCCTAAATCAGGAGAAAGTCGATGTAATCCTTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGAAGCTGGAGCGTCTTTACTGGTTGGCTCAATAGAACCTTCTTTGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGAAGCTGGAGCGTCTTTACTGGTTGGCTCAATAGAACCTTCTTTGTCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATCAAGATAGAAAATATTCCTCAACTCTACCTAATGATGTACAAACTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATCAAGATAGAAAATATTCCTCAACTCTACCTAATGATGTACAAACTACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCTGGTGATCTCAAATTGGACAAAATTGATCCCCAAAGACAGGAACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCTGGTGATCTCAAATTGGACAAAATTGATCCCCAAAGACAGGAACTTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGTAAAATTACTAGATGTGCCTACTGGTGATTGTCATATTTCTCCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGTAAAATTACTAGATGTGCCTACTGGTGATTGTCATATTTCTCCAAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATGTCAGTGATGGGGTTAAAAGGGTAAGAACATTATTAAGCAATGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATGTCAGTGATGGGGTTAAAAGGGTAAGAACATTATTAAGCAATGAGAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GATTCCAAAGGCAGGGATCACCTCTCAGGAGTCCCTACTGATGTTACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GATTCCAAAGGCAGGGATCACCTCTCAGGAGTCCCTACTGATGTTACAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TACTGAGACTCCAGAAAAGAACACAGAATCCCTCATTTTAAGCCTTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TACTGAGACTCCAGAAAAGAACACAGAATCCCTCATTTTAAGCCTTAAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGAGCTCATTAGGTAAAATCCAAGTCATGGAGAAACAAGAGAAAGGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGAGCTCATTAGGTAAAATCCAAGTCATGGAGAAACAAGAGAAAGGACTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACCCTGGGAGTAGAGACGTGTGGGAGCAAAGGAAATGCAGAGAAAAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACCCTGGGAGTAGAGACGTGTGGGAGCAAAGGAAATGCAGAGAAAAGTAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GTCTGCAACAGAAAAGCAGGAACGGACTGTCATGAGCCATGGCTGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GTCTGCAACAGAAAAGCAGGAACGGACTGTCATGAGCCATGGCTGTGAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ACTTCAACACCAGGGATTCAGTCACAGGAAAGGAGTCTCAAGGGGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ACTTCAACACCAGGGATTCAGTCACAGGAAAGGAGTCTCAAGGGGAAAGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CCACATTTAAGTTTGTTCATTCCGAGGGAGACGACTTACCAGTTTCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CCACATTTAAGTTTGTTCATTCCGAGGGAGACGACTTACCAGTTTCATTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGTATCGCAGTCAAGTAGTCAAAGTCTTGCCTCTCTAGCTACAACATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TGTATCGCAGTCAAGTAGTCAAAGTCTTGCCTCTCTAGCTACAACATTTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TTCAAGAAAAGAAAGCAGAAGCCCAGAATCATAATTGTGTCCCTGATGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 101151 TTCAAGAAAAGAAAGCAGAAGCCCAGAATCATCATTGTGTCCCTGATGTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AAGGCATTAATGGAGAGTCCCGAGGGACAGTTATCTCTGGAGCCCAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AAGGCATTAATGGAGAGTCCCGAGGGACAGTTATCTCTGGAGCCCAAATC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TGATAGTCAGTTCCAAGCATCACACACTGGGTGCCAGAGCCCTTTATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TGATAGTCAGTTCCAAGCATCACACACTGGGTGCCAGAGCCCTTTATGTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CAGCCCAGCGTCACACTCCTCAGAGCCCCTTCACCAATCATGCTGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CAGCCCAGCGTCACACTCCTCAGAGCCCCTTCACCAATCATGCTGCAGCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GCTGGCAGGAAGACTCTTCGCAGCTGCATGGGGCTGGAGTGGTTTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GCTGGCAGGAAGACTCTTCGCAGCTGCATGGGGCTGGAGTGGTTTCCAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GCTCTATCCTGGTTACCTTGGACTAGGGGTGTTGCCAGGGAAGCCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GCTCTATCCTGGTTACCTTGGACTAGGGGTGTTGCCAGGGAAGCCTCAGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GTTGGAATGCAATGACCCAGAAGCCACAACTTATCAGTCCCCAGGGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 GTTGGAATGCAATGACCCAGAAGCCACAACTTATCAGTCCCCAGGGGGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 AGACTCTCACAAG         GCTGGATCAGGTGCAACACCACCATAAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 101501 AGACTCTCACAAGGTA...CAGGCTGGATCAGGTGCAACACCACCATAAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 GAAGAGTGGATTCGGTGGCATCACTATGCTCTTCACAGGATACTTCGTCC
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 107442 GAAGAGTGGATTCGGTGGCATCACGATGCTCTTCACAGGATACTTCGTCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 TGTGTTGTAGCTGGAGTTTCAGACGTCTGA         AAAAATTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 107492 TGTGTTGTAGCTGGAGTTTCAGACGTCTGAGTA...CAGAAAAATTGTGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 CGACCCCTGCCCTGGAAGAGCACAGTACCTCCATGCATTGGTGTGGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111770 CGACCCCTGCCCTGGAAGAGCACAGTACCTCCATGCATTGGTGTGGCGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .
   1683 GACGACTGGGGATTGCCGCTCTAAAACATGTTTGGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111820 GACGACTGGGGATTGCCGCTCTAAAACATGTTTGGAT