seq1 = pF1KB8570.tfa, 2469 bp
seq2 = pF1KB8570/gi568815596r_94715034.tfa (gi568815596r:94715034_94957169), 242136 bp

>pF1KB8570 2469
>gi568815596r:94715034_94957169 (Chr2)

(complement)

1-203  (100001-100203)   98% ->
204-318  (103518-103632)   99% ->
319-492  (103795-103968)   97% ->
493-599  (107863-107969)   97% ->
600-737  (109016-109153)   98% ->
738-793  (111735-111790)   98% ->
794-824  (118327-118357)   100% ->
825-894  (121041-121110)   98% ->
895-979  (125079-125163)   98% ->
980-1008  (127972-128000)   100% ->
1009-1081  (128092-128164)   97% ->
1082-1152  (134096-134166)   100% ->
1153-1316  (138246-138409)   98% ->
1317-1497  (139817-139997)   100% ->
1498-2469  (141165-142136)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGTTATTCGGCTTCGGGAGCCGCAGGGGCCAGACGGCCCAGGGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 100001 ATGAAGTTATTCGGCTTCGGGAGCCGCAGGGGCCAGACGGCCGAGGGCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATAGACCACGTCTACACGGGTTCCGGATACCGAATCCGGGACTCCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 100051 CATAGACCACGTCTACACGGGTTCCGGATACCGAATCCGGGACTCCGAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCAGAAGATCCACAGGGCAGCTGTCAAAGGCGACGCCGCGGAGGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCAGAAGATCCACAGGGCAGCTGTCAAAGGCGACGCCGCGGAGGTGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCTGCTTGGCGCGCAGGAGCGGAGACCTGGACGCCCTGGACAAGCAGCA
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 100151 CGCTGCCTGGCGCGCAGGAGCGGAGACCTGGACGCCCGGGACAAGCAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAG         AACTGCTCTACACTTGGCCTGTGCCAGTGGCCATGTGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGGTA...TAGAACTGCTCTACACTTGGCCTGTGCCAGTGGCCATGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAGTGGTCACTCTCCTGGTTAACAGAAAATGCCAGATTGATGTCTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 103556 AAGTGGTCACTCTCCTGGTTAACAGAAAATGCCAGATTGATATCTGTGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAAGAAAACAGAACGCCTTTGATACAG         GCTGTCCATTGCCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 103606 AAAGAAAACAGAACGCCTTTGATACAGGTA...CAGGCTGTCCATTGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGAAGAGGCTTGTGCCGTTATTCTGCTGGAACATGGCGCCAATCCAAACT
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| 
 103809 GGAAGAGGCTTGTGCCGTTATTCTGCTGAAACATGGCGCCAATCCAAACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTAAGGATATCTACGGCAACACTGCTCTCCATTATGCCGTGTATAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 103859 TTAAGGATATCTACGGCAACACTGCTCTCCATTATGCTGTGTATAGTGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AGCACCTCACTGGCAGAAAAACTGCTTTCCCATGGTGCACATATTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 103909 AGCACCTCACTGGCAGAAAAACTGCTTTCCCATGGTGCACACATTGAAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ACTGGACAAG         GACAATAATACCCCACTTTTATTTGCTATAA
        ||||||||||>>>...>>>|||| |||||||||||||||||| |||||||
 103959 ACTGGACAAGGTA...TAGGACAGTAATACCCCACTTTTATTCGCTATAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TTTGCAAGAAAGAGAAAATGGTGGAATTTTTATTGAAAAAGAAAGCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107894 TTTGCAAGAAAGAGAAAATGGTGGAATTTTTATTGAAAAAGAAAGCAAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCACATGCCGTTGATAGGCTGAGACG         GTCAGCTCTCATGCT
         |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 107944 ACACATGCCGTTGATAGGCTGAGACGGTA...TAGGTCAGCTCTCATGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGCTGTATACTATGACTCACCAGGTATTGTCAATATCCTTCTTAAGCAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 109031 TGCTGTATACTATGACTCACCAGGTATTGTCAGTATCCTTCTTAAGCAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATATTGATGTCTTCGCTCAAGACATGTGTGGACGAGATGCAGAAGATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 109081 ATATTGATGTCTTCGCTCAAGACATGTGTGGACGAGATGCAGAAGATTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GCTATTTCTCATCATTTGACAAA         AATTCAACAACAAATTTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 109131 GCTATTTCTCATCATTTGACAAAGTA...TAGAATTCAACAACAAATTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GGAACATAAAAAGAAGATACTTAAAAAGGAGAAATCAG         ATG
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 111753 GGAACATAAACAGAAGATACTTAAAAAGGAGAAATCAGGTA...TAGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TTGGAAGTTCTGATGAATCTGCAGTCAG         CATTTTCCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 118330 TTGGAAGTTCTGATGAATCTGCAGTCAGGTA...AAGCATTTTCCATGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CTGCGTGTGGATTCATTGCCTGCATCGGATGACAAAGACTTGAATGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 121054 CTGCGTGTGGATTCATTGCCTGCATCGGATGACAAAGACTTGAGTGTTGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TACTAAG         CAGTGTGTCCCCGAGAAAGTGTCAGAGCCTTTAC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121104 TACTAAGGTA...TAGCAGTGTGTCCCCGAGAAAGTGTCAGAGCCTTTAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CTGGATCTTCGCATGAAAAAGGAAACAGAATAGTCAATGGACAAGGAGAA
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125113 CTGGACCTTCGCATGAAAAAGGAAACAGAATAGTCAATGGACAAGGAGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 G         GGCCTCCTGCAAAACATCCTTCCTTGAAG         CC
        |>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 125163 GGTG...TAGGGCCTCCTGCAAAACATCCTTCCTTGAAGGTA...CAGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 TAGCACTGAAGTGGAAGATCCTGCTGTGAAAGGAGCAGTACAAAGAAAGA
        || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128094 TACCACTGGAGTGGAAGATCCTGCTGTGAAAGGAGCAGTACAAAGAAAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 ATGTACAGACATTGAGAGCAG         AACAAGCCTTACCAGTGGCT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 128144 ATGTACAGACATTGAGAGCAGGTA...CAGAACAAGCCTTACCAGTGGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 TCAGAGGAAGAGCAAGAAAGGCATGAAAGAAGTGAAAAGAAGCAACCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134116 TCAGAGGAAGAGCAAGAAAGGCATGAAAGAAGTGAAAAGAAGCAACCACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 G         GTCAAAGAAGGAAATAATACAAACAAAAGTGAAAAAATAC
        |>>>...>>>|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 134166 GGTA...AAGGTCAAAAAAGGAAATAATACAAACAAAAGTGAAAAAATAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 AACTTTCAGAAAATATATGTGATAGTACATCTTCTGCTGCTGCTGGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138286 AACTTTCAGAAAATATATGTGATAGTACATCTTCTGCTGCTGCTGGCAGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 TTAACCCAACAAAGAAAGATTGGGAAAACGTATCCTCAGCAATTTCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138336 TTAACCCAACAAAGAAAGATTGGGAAAACGTATCCTCAGCAATTTCCCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 GAAGCTGAAGGAAGAGCATGATAG         ATGCACCTTAAAACAAG
        ||||||||||||||||||||||| >>>...>>>|||||||||||||||||
 138386 GAAGCTGAAGGAAGAGCATGATAAGTA...CAGATGCACCTTAAAACAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 AAAATGAAGAAAAAACAAATGTTAATATGCTGTACAAAAAAAATAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139834 AAAATGAAGAAAAAACAAATGTTAATATGCTGTACAAAAAAAATAGAGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 GAATTAGAAAGGAAAGAGAAACAATATAAGAAAGAAGTTGAAGCAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139884 GAATTAGAAAGGAAAGAGAAACAATATAAGAAAGAAGTTGAAGCAAAACA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 ACTTGAACCAACTGTTCAGTCACTAGAGATGAAATCAAAGACTGCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139934 ACTTGAACCAACTGTTCAGTCACTAGAGATGAAATCAAAGACTGCAAGAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 ATACTCCAAATCGG         GATTTTCATAATCATGAAGAAATGAAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||| ||||
 139984 ATACTCCAAATCGGGTA...TAGGATTTTCATAATCATGAAGAAACGAAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1525 GGTCTGATGGATGAAAATTGCATTTTGAAGGCAGATATTGCTATACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 141192 GGTCTGATGGATGAAAATTGCATTTTGAAGGCAGATATTGCCATACTCAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 ACAGGAAATATGTACAATGAAAAATGACAACTTGGAAAAAGAAAATAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141242 ACAGGAAATATGTACAATGAAAAATGACAACTTGGAAAAAGAAAATAAAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 ATCTTAAGGACATTAAAATTGTTAAAGAAACAAATGCTGCCCTTGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141292 ATCTTAAGGACATTAAAATTGTTAAAGAAACAAATGCTGCCCTTGAAAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 TATATAAAACTCAATGAGGAAATGATAACAGAAACAGCATTCCGGTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141342 TATATAAAACTCAATGAGGAAATGATAACAGAAACAGCATTCCGGTATCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 ACAAGAGCTTAATGATCTCAAGGCTGAGAATACAAGGCTCAATGCCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141392 ACAAGAGCTTAATGATCTCAAGGCTGAGAATACAAGGCTCAATGCCGAAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TGTTGAAGGAAAAAGAAAGCAAGAAAAGACTGGAAGCTGACATTGAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141442 TGTTGAAGGAAAAAGAAAGCAAGAAAAGACTGGAAGCTGACATTGAATCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 TATCAGTCTAGACTGGCTGCTGCTATAAGCAAACACAGTGAAAGTGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||
 141492 TATCAGTCTAGACTGGCTGCTGCTATAGGTAAACACAGTGAAAGTGTGAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1875 AACAGAAAGAAACCTAAAACTTGCTTTAGAGAGAACACGAGATGTTTCTG
        ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 141542 AACAGAAAGAAACGTAAAACTTGCTTTAGAGAGAACACAAGATGTTTCTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 TACAAGTAGAAATGAGTTCTGCTATTTCCAAAGTAAAAGCTGAGAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 141592 TACAAGTAGAAATGAGTTCTGCTATTTCCAAAGTAAAAGATGAGAATGAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 TTTCTTACTGAACAACTTTCTGAAACACAAATTAAATTCAATGCCTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141642 TTTCTTACTGAACAACTTTCTGAAACACAAATTAAATTCAATGCCTTAAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 AGATAAGTTCTGTAAGACAAGAGATAGTCTCAGAAAAAAGTCATTGGCTT
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141692 AGATAAGTTCCGTAAGACAAGAGATAGTCTCAGAAAAAAGTCATTGGCTT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 TAGAAACTGTACAAAACGACCTAAGCCAAACACAGCAGCAAACACAGGAA
        |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||
 141742 TAGAAACTGTACAAAATGACCTAAGAAAAACACAGCAGCAAACACAGGAA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 ATGAAAGAGATGTATCAAAATGCAGAAGCTAAAGTGAATAATTCCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141792 ATGAAAGAGATGTATCAAAATGCAGAAGCTAAAGTGAATAATTCCACTGG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 AAAGTGGAACTGTGTAGAAGAGAGGATATGTCACCTCCAACGTGAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141842 AAAGTGGAACTGTGTAGAAGAGAGGATATGTCACCTCCAACGTGAAAATG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 CGTGGCTTGTACAGCAACTAGATGACGTTCATCAGAAAGAGGATCATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141892 CGTGGCTTGTACAGCAACTAGATGACGTTCATCAGAAAGAGGATCATAAA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 GAGATAGTAACTAATATCCAAAGAGGCTTTATTGAGAGTGAAAAGAAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 141942 GAGATAGTAACTAATATCCAAAGAGGCTTTATTGAGAGTGGAAAGAAAGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 CCTCGTGCTAGAAGAGAAAAGTAAGAAGCTAATGAATGAATGTGATCATT
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141992 CCTCGTACTAGAAGAGAAAAGTAAGAAGCTAATGAATGAATGTGATCATT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 TAAAAGAAAGTCTCTTTCAGTATGAGAGAGAGAAAACAGGAGGAGTAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||
 142042 TAAAAGAAAGTCTCTTTCAGTATGAGAGAGAGAAAGCAGAAGGAGTAGTA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2425 AGTATCAAGGAAGATAAATATTTTCAAACTTCTAGAAAGACAATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 142092 AGTATCAAGGAAGATAAATATTTTCAAACTTCTAGAAAGAAAATT