seq1 = pF1KB8562.tfa, 2733 bp
seq2 = pF1KB8562/gi568815581r_44150461.tfa (gi568815581r:44150461_44362729), 212269 bp

>pF1KB8562 2733
>gi568815581r:44150461_44362729 (Chr17)

(complement)

13-106  (100001-100094)   100% ->
107-168  (101094-101155)   100% ->
169-349  (101915-102095)   100% ->
350-485  (102191-102326)   100% ->
486-609  (102798-102921)   100% ->
610-694  (103149-103233)   100% ->
695-876  (103386-103567)   100% ->
877-1087  (104107-104317)   100% ->
1088-1282  (104550-104744)   100% ->
1283-1431  (104923-105071)   100% ->
1432-1626  (105186-105380)   100% ->
1627-1800  (106884-107057)   100% ->
1801-1890  (107434-107523)   100% ->
1891-2057  (108068-108234)   100% ->
2058-2311  (109359-109612)   100% ->
2312-2481  (111142-111311)   100% ->
2482-2655  (111398-111571)   100% ->
2656-2733  (112192-112269)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     13 CAGGATGATTATGAAGACATGATGGAGGAGAATCTGGAGCAGGAGGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 CAGGATGATTATGAAGACATGATGGAGGAGAATCTGGAGCAGGAGGAATA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     63 TGAAGACCCAGACATCCCCGAGTCCCAGATGGAGGAGCCGGCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100051 TGAAGACCCAGACATCCCCGAGTCCCAGATGGAGGAGCCGGCAGGTG...

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    107    CTCACGACACCGAGGCAACAGCCACAGACTACCACACCACATCACAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101091 CAGCTCACGACACCGAGGCAACAGCCACAGACTACCACACCACATCACAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    154 CCGGGTACCCACAAG         GTCTATGTGGAGCTGCAGGAGCTGGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101141 CCGGGTACCCACAAGGTG...CAGGTCTATGTGGAGCTGCAGGAGCTGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    195 GATGGACGAAAAGAACCAGGAGCTGAGATGGATGGAGGCGGCGCGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101941 GATGGACGAAAAGAACCAGGAGCTGAGATGGATGGAGGCGGCGCGCTGGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    245 TGCAACTGGAGGAGAACCTGGGGGAGAATGGGGCCTGGGGCCGCCCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101991 TGCAACTGGAGGAGAACCTGGGGGAGAATGGGGCCTGGGGCCGCCCGCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    295 CTCTCTCACCTCACCTTCTGGAGCCTCCTAGAGCTGCGTAGAGTCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102041 CTCTCTCACCTCACCTTCTGGAGCCTCCTAGAGCTGCGTAGAGTCTTCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    345 CAAGG         GTACTGTCCTCCTAGACCTGCAAGAGACCTCCCTGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102091 CAAGGGTG...CAGGTACTGTCCTCCTAGACCTGCAAGAGACCTCCCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    386 CTGGAGTGGCCAACCAACTGCTAGACAGGTTTATCTTTGAAGACCAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102227 CTGGAGTGGCCAACCAACTGCTAGACAGGTTTATCTTTGAAGACCAGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    436 CGGCCTCAGGACCGAGAGGAGCTGCTCCGGGCCCTGCTGCTTAAACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102277 CGGCCTCAGGACCGAGAGGAGCTGCTCCGGGCCCTGCTGCTTAAACACAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    486          CCACGCTGGAGAGCTGGAGGCCCTGGGGGGTGTGAAGCCTG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102327 GTG...CAGCCACGCTGGAGAGCTGGAGGCCCTGGGGGGTGTGAAGCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    527 CAGTCCTGACACGCTCTGGGGATCCTTCACAGCCTCTGCTCCCCCAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102839 CAGTCCTGACACGCTCTGGGGATCCTTCACAGCCTCTGCTCCCCCAACAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    577 TCCTCACTGGAGACACAGCTCTTCTGTGAGCAG         GGAGATGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 102889 TCCTCACTGGAGACACAGCTCTTCTGTGAGCAGGTG...CAGGGAGATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    618 GGGCACAGAAGGGCACTCACCATCTGGAATTCTGGAAAAGATTCCCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103157 GGGCACAGAAGGGCACTCACCATCTGGAATTCTGGAAAAGATTCCCCCGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    668 ATTCAGAGGCCACGTTGGTGCTAGTGG         GCCGCGCCGACTTC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 103207 ATTCAGAGGCCACGTTGGTGCTAGTGGGTA...CAGGCCGCGCCGACTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    709 CTGGAGCAGCCGGTGCTGGGCTTCGTGAGGCTGCAGGAGGCAGCGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103400 CTGGAGCAGCCGGTGCTGGGCTTCGTGAGGCTGCAGGAGGCAGCGGAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    759 GGAGGCGGTGGAGCTGCCGGTGCCTATACGCTTCCTCTTTGTGTTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103450 GGAGGCGGTGGAGCTGCCGGTGCCTATACGCTTCCTCTTTGTGTTGCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    809 GACCTGAGGCCCCCCACATCGATTACACCCAGCTTGGCCGGGCTGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103500 GACCTGAGGCCCCCCACATCGATTACACCCAGCTTGGCCGGGCTGCTGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    859 ACCCTCATGTCAGAGAGG         GTGTTCCGCATAGATGCCTACAT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 103550 ACCCTCATGTCAGAGAGGGTA...TAGGTGTTCCGCATAGATGCCTACAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    900 GGCTCAGAGCCGAGGGGAGCTGCTGCACTCCCTAGAGGGCTTCCTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104130 GGCTCAGAGCCGAGGGGAGCTGCTGCACTCCCTAGAGGGCTTCCTGGACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    950 GCAGCCTAGTGCTGCCTCCCACCGATGCCCCCTCCGAGCAGGCACTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104180 GCAGCCTAGTGCTGCCTCCCACCGATGCCCCCTCCGAGCAGGCACTGCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1000 AGTCTGGTGCCTGTGCAGAGGGAGCTACTTCGAAGGCGCTATCAGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104230 AGTCTGGTGCCTGTGCAGAGGGAGCTACTTCGAAGGCGCTATCAGTCCAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1050 CCCTGCCAAGCCAGACTCCAGCTTCTACAAGGGCCTAG         ACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 104280 CCCTGCCAAGCCAGACTCCAGCTTCTACAAGGGCCTAGGTA...CAGACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1091 TAAATGGGGGCCCAGATGACCCTCTGCAGCAGACAGGCCAGCTCTTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104553 TAAATGGGGGCCCAGATGACCCTCTGCAGCAGACAGGCCAGCTCTTCGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1141 GGCCTGGTGCGTGATATCCGGCGCCGCTACCCCTATTACCTGAGTGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104603 GGCCTGGTGCGTGATATCCGGCGCCGCTACCCCTATTACCTGAGTGACAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1191 CACAGATGCATTCAGCCCCCAGGTCCTGGCTGCCGTCATCTTCATCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104653 CACAGATGCATTCAGCCCCCAGGTCCTGGCTGCCGTCATCTTCATCTACT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1241 TTGCTGCACTGTCACCCGCCATCACCTTCGGCGGCCTCCTGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 104703 TTGCTGCACTGTCACCCGCCATCACCTTCGGCGGCCTCCTGGGTC...CA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283  GAGAAAAGACCCGGAACCAGATGGGAGTGTCGGAGCTGCTGATCTCCAC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104922 GGAGAAAAGACCCGGAACCAGATGGGAGTGTCGGAGCTGCTGATCTCCAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1332 TGCAGTGCAGGGCATTCTCTTCGCCCTGCTGGGGGCTCAGCCCCTGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104972 TGCAGTGCAGGGCATTCTCTTCGCCCTGCTGGGGGCTCAGCCCCTGCTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1382 TGGTCGGCTTCTCAGGACCCCTGCTGGTGTTTGAGGAAGCCTTCTTCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105022 TGGTCGGCTTCTCAGGACCCCTGCTGGTGTTTGAGGAAGCCTTCTTCTCG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1432          TTCTGCGAGACCAACGGTCTAGAGTACATCGTGGGCCGCGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105072 GTA...CAGTTCTGCGAGACCAACGGTCTAGAGTACATCGTGGGCCGCGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1473 GTGGATCGGCTTCTGGCTCATCCTGCTGGTGGTGTTGGTGGTGGCCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105227 GTGGATCGGCTTCTGGCTCATCCTGCTGGTGGTGTTGGTGGTGGCCTTCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1523 AGGGTAGCTTCCTGGTCCGCTTCATCTCCCGCTATACCCAGGAGATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105277 AGGGTAGCTTCCTGGTCCGCTTCATCTCCCGCTATACCCAGGAGATCTTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1573 TCCTTCCTCATTTCCCTCATCTTCATCTATGAGACTTTCTCCAAGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105327 TCCTTCCTCATTTCCCTCATCTTCATCTATGAGACTTTCTCCAAGCTGAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1623 CAAG         ATCTTCCAGGACCACCCACTACAGAAGACTTATAACT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105377 CAAGGTG...CAGATCTTCCAGGACCACCCACTACAGAAGACTTATAACT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1664 ACAACGTGTTGATGGTGCCCAAACCTCAGGGCCCCCTGCCCAACACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106921 ACAACGTGTTGATGGTGCCCAAACCTCAGGGCCCCCTGCCCAACACAGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1714 CTCCTCTCCCTTGTGCTCATGGCCGGTACCTTCTTCTTTGCCATGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106971 CTCCTCTCCCTTGTGCTCATGGCCGGTACCTTCTTCTTTGCCATGATGCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1764 GCGCAAGTTCAAGAACAGCTCCTATTTCCCTGGCAAG         CTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 107021 GCGCAAGTTCAAGAACAGCTCCTATTTCCCTGGCAAGGTC...CAGCTGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1805 GTCGGGTCATCGGGGACTTCGGGGTCCCCATCTCCATCCTGATCATGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107438 GTCGGGTCATCGGGGACTTCGGGGTCCCCATCTCCATCCTGATCATGGTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1855 CTGGTGGATTTCTTCATTCAGGATACCTACACCCAG         AAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 107488 CTGGTGGATTTCTTCATTCAGGATACCTACACCCAGGTG...CAGAAACT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1896 CTCGGTGCCTGATGGCTTCAAGGTGTCCAACTCCTCAGCCCGGGGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108073 CTCGGTGCCTGATGGCTTCAAGGTGTCCAACTCCTCAGCCCGGGGCTGGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1946 TCATCCACCCACTGGGCTTGCGTTCCGAGTTTCCCATCTGGATGATGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108123 TCATCCACCCACTGGGCTTGCGTTCCGAGTTTCCCATCTGGATGATGTTT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1996 GCCTCCGCCCTGCCTGCTCTGCTGGTCTTCATCCTCATATTCCTGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108173 GCCTCCGCCCTGCCTGCTCTGCTGGTCTTCATCCTCATATTCCTGGAGTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2046 TCAGATCACCAC         GCTGATTGTCAGCAAACCTGAGCGCAAGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 108223 TCAGATCACCACGTG...TAGGCTGATTGTCAGCAAACCTGAGCGCAAGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2087 TGGTCAAGGGCTCCGGCTTCCACCTGGACCTGCTGCTGGTAGTAGGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109388 TGGTCAAGGGCTCCGGCTTCCACCTGGACCTGCTGCTGGTAGTAGGCATG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2137 GGTGGGGTGGCCGCCCTCTTTGGGATGCCCTGGCTCAGTGCCACCACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109438 GGTGGGGTGGCCGCCCTCTTTGGGATGCCCTGGCTCAGTGCCACCACCGT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2187 GCGTTCCGTCACCCATGCCAACGCCCTCACTGTCATGGGCAAAGCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109488 GCGTTCCGTCACCCATGCCAACGCCCTCACTGTCATGGGCAAAGCCAGCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2237 CCCCAGGGGCTGCAGCCCAGATCCAGGAGGTCAAAGAGCAGCGGATCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109538 CCCCAGGGGCTGCAGCCCAGATCCAGGAGGTCAAAGAGCAGCGGATCAGT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2287 GGACTCCTGGTCGCTGTGCTTGTGG         GCCTGTCCATCCTCAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 109588 GGACTCCTGGTCGCTGTGCTTGTGGGTG...CAGGCCTGTCCATCCTCAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2328 GGAGCCCATCCTGTCCCGCATCCCCCTGGCTGTACTGTTTGGCATCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111158 GGAGCCCATCCTGTCCCGCATCCCCCTGGCTGTACTGTTTGGCATCTTCC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2378 TCTACATGGGGGTCACGTCGCTCAGCGGCATCCAGCTCTTTGACCGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111208 TCTACATGGGGGTCACGTCGCTCAGCGGCATCCAGCTCTTTGACCGCATC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2428 TTGCTTCTGTTCAAGCCACCCAAGTATCACCCAGATGTGCCCTACGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111258 TTGCTTCTGTTCAAGCCACCCAAGTATCACCCAGATGTGCCCTACGTCAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2478 GCGG         GTGAAGACCTGGCGCATGCACTTATTCACGGGCATCC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111308 GCGGGTA...CAGGTGAAGACCTGGCGCATGCACTTATTCACGGGCATCC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2519 AGATCATCTGCCTGGCAGTGCTGTGGGTGGTGAAGTCCACGCCGGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111435 AGATCATCTGCCTGGCAGTGCTGTGGGTGGTGAAGTCCACGCCGGCCTCC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2569 CTGGCCCTGCCCTTCGTCCTCATCCTCACTGTGCCGCTGCGGCGCGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111485 CTGGCCCTGCCCTTCGTCCTCATCCTCACTGTGCCGCTGCGGCGCGTCCT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2619 GCTGCCGCTCATCTTCAGGAACGTGGAGCTTCAGTGT         CTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 111535 GCTGCCGCTCATCTTCAGGAACGTGGAGCTTCAGTGTGTG...CAGCTGG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2660 ATGCTGATGATGCCAAGGCAACCTTTGATGAGGAGGAAGGTCGGGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112196 ATGCTGATGATGCCAAGGCAACCTTTGATGAGGAGGAAGGTCGGGATGAA

   2850     .    :    .    :
   2710 TACGACGAAGTGGCCATGCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||
 112246 TACGACGAAGTGGCCATGCCTGTG