seq1 = pF1KB8531.tfa, 2889 bp
seq2 = pF1KB8531/gi568815588r_31915532.tfa (gi568815588r:31915532_32155973), 240442 bp

>pF1KB8531 2889
>gi568815588r:31915532_32155973 (Chr10)

(complement)

1-126  (100001-100126)   100% ->
127-214  (107423-107510)   100% ->
215-288  (115517-115590)   100% ->
289-393  (116543-116647)   100% ->
394-442  (117148-117196)   100% ->
443-498  (117756-117811)   100% ->
499-586  (118367-118454)   100% ->
587-711  (118596-118720)   100% ->
712-816  (119980-120084)   100% ->
817-962  (120307-120452)   100% ->
963-1111  (121136-121284)   100% ->
1112-1305  (121936-122129)   100% ->
1306-1374  (123200-123268)   100% ->
1375-1581  (124695-124901)   100% ->
1582-1725  (127403-127546)   100% ->
1726-1914  (132938-133126)   100% ->
1915-2032  (133717-133834)   100% ->
2033-2098  (134687-134752)   97% ->
2099-2204  (134847-134952)   100% ->
2205-2306  (136015-136116)   100% ->
2307-2367  (137412-137472)   100% ->
2368-2439  (137587-137658)   100% ->
2440-2544  (137818-137922)   100% ->
2545-2761  (138615-138831)   100% ->
2762-2889  (140315-140442)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGACCTGGCCGAGTGCAACATCAAAGTGATGTGTCGCTTCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGACCTGGCCGAGTGCAACATCAAAGTGATGTGTCGCTTCAGACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTCAACGAGTCTGAAGTGAACCGCGGCGACAAGTACATCGCCAAGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTCAACGAGTCTGAAGTGAACCGCGGCGACAAGTACATCGCCAAGTTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGGAGAAGACACGGTCGTGATCGCG         TCCAAGCCTTATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100101 AGGGAGAAGACACGGTCGTGATCGCGGTG...CAGTCCAAGCCTTATGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTGATCGGGTGTTCCAGTCAAGCACATCTCAAGAGCAAGTGTATAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107438 TTTGATCGGGTGTTCCAGTCAAGCACATCTCAAGAGCAAGTGTATAATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGTGCAAAGAAGATTGTTAAAG         ATGTACTTGAAGGATATA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 107488 CTGTGCAAAGAAGATTGTTAAAGGTA...TAGATGTACTTGAAGGATATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGGAACAATATTTGCATATGGACAAACATCCTCTGGGAAGACACACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115535 ATGGAACAATATTTGCATATGGACAAACATCCTCTGGGAAGACACACACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATGGAG         GGTAAACTTCATGATCCAGAAGGCATGGGAATTAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115585 ATGGAGGTA...TAGGGTAAACTTCATGATCCAGAAGGCATGGGAATTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCCAAGAATAGTGCAAGATATTTTTAATTATATTTACTCCATGGATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116578 TCCAAGAATAGTGCAAGATATTTTTAATTATATTTACTCCATGGATGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATTTGGAATTTCATATTAAG         GTTTCATATTTTGAAATATAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 116628 ATTTGGAATTTCATATTAAGGTA...TAGGTTTCATATTTTGAAATATAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TTGGATAAGATAAGGGACCTGTTAGATG         TTTCAAAGACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 117169 TTGGATAAGATAAGGGACCTGTTAGATGGTA...CAGTTTCAAAGACCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CCTTTCAGTTCATGAAGACAAAAACCGAGTTCCCTATGTAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 117769 CCTTTCAGTTCATGAAGACAAAAACCGAGTTCCCTATGTAAAGGTA...C

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    499   GGGTGCACAGAGCGTTTTGTATGTAGTCCAGATGAAGTTATGGATACC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118365 AGGGGTGCACAGAGCGTTTTGTATGTAGTCCAGATGAAGTTATGGATACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 ATAGATGAAGGAAAATCCAACAGACATGTAGCAGTTACAA         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 118415 ATAGATGAAGGAAAATCCAACAGACATGTAGCAGTTACAAGTA...CAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 TATGAATGAACATAGCTCTAGGAGTCACAGTATATTTCTTATTAATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118597 TATGAATGAACATAGCTCTAGGAGTCACAGTATATTTCTTATTAATGTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 AACAAGAGAACACACAAACGGAACAAAAGCTGAGTGGAAAACTTTATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118647 AACAAGAGAACACACAAACGGAACAAAAGCTGAGTGGAAAACTTTATCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GTTGATTTAGCTGGTAGTGAAAAG         GTTAGTAAAACTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 118697 GTTGATTTAGCTGGTAGTGAAAAGGTA...TAGGTTAGTAAAACTGGAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TGAAGGTGCTGTGCTGGATGAAGCTAAAAACATCAACAAGTCACTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119997 TGAAGGTGCTGTGCTGGATGAAGCTAAAAACATCAACAAGTCACTTTCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 CTCTTGGAAATGTTATTTCTGCTTTGGCTGAGGGTAGT         ACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 120047 CTCTTGGAAATGTTATTTCTGCTTTGGCTGAGGGTAGTGTG...CAGACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 TATGTTCCATATCGAGATAGTAAAATGACAAGAATCCTTCAAGATTCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120310 TATGTTCCATATCGAGATAGTAAAATGACAAGAATCCTTCAAGATTCATT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 AGGTGGCAACTGTAGAACCACTATTGTAATTTGCTGCTCTCCATCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120360 AGGTGGCAACTGTAGAACCACTATTGTAATTTGCTGCTCTCCATCATCAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 ACAATGAGTCTGAAACAAAATCTACACTCTTATTTGGCCAAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 120410 ACAATGAGTCTGAAACAAAATCTACACTCTTATTTGGCCAAAGGTT...T

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    963   GGCCAAAACAATTAAGAACACAGTTTGTGTCAATGTGGAGTTAACTGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121134 AGGGCCAAAACAATTAAGAACACAGTTTGTGTCAATGTGGAGTTAACTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 AGAACAGTGGAAAAAGAAGTATGAAAAAGAAAAAGAAAAAAATAAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121184 AGAACAGTGGAAAAAGAAGTATGAAAAAGAAAAAGAAAAAAATAAGATCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TGCGGAACACTATTCAGTGGCTTGAAAATGAGCTCAACAGATGGCGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121234 TGCGGAACACTATTCAGTGGCTTGAAAATGAGCTCAACAGATGGCGTAAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 G         GGGAGACGGTGCCTATTGATGAACAGTTTGACAAAGAGAA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121284 GGTA...TAGGGGAGACGGTGCCTATTGATGAACAGTTTGACAAAGAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 AGCCAACTTGGAAGCTTTCACAGTGGATAAAGATATTACTCTTACCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121976 AGCCAACTTGGAAGCTTTCACAGTGGATAAAGATATTACTCTTACCAATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 ATAAACCAGCAACCGCAATTGGAGTTATAGGAAATTTTACTGATGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122026 ATAAACCAGCAACCGCAATTGGAGTTATAGGAAATTTTACTGATGCTGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 AGAAGAAAGTGTGAAGAAGAAATTGCTAAATTATACAAACAGCTTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122076 AGAAGAAAGTGTGAAGAAGAAATTGCTAAATTATACAAACAGCTTGATGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CAAG         GATGAAGAAATTAACCAGCAAAGTCAACTGGTAGAGA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122126 CAAGGTA...TAGGATGAAGAAATTAACCAGCAAAGTCAACTGGTAGAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 AACTGAAGACGCAAATGTTGGATCAGGAGGAG         CTTTTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 123237 AACTGAAGACGCAAATGTTGGATCAGGAGGAGGTG...TAGCTTTTGGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 TCTACCAGAAGGGATCAAGACAATATGCAAGCTGAGCTGAATCGCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124704 TCTACCAGAAGGGATCAAGACAATATGCAAGCTGAGCTGAATCGCCTTCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 AGCAGAAAATGATGCCTCTAAAGAAGAAGTGAAAGAAGTTTTACAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124754 AGCAGAAAATGATGCCTCTAAAGAAGAAGTGAAAGAAGTTTTACAGGCCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 TAGAAGAACTTGCTGTCAATTATGATCAGAAGTCTCAGGAAGTTGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124804 TAGAAGAACTTGCTGTCAATTATGATCAGAAGTCTCAGGAAGTTGAAGAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 AAAACTAAGGAATATGAATTGCTTAGTGATGAATTGAATCAGAAATCG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 124854 AAAACTAAGGAATATGAATTGCTTAGTGATGAATTGAATCAGAAATCGGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1582        GCAACTTTAGCGAGTATAGATGCTGAGCTTCAGAAACTTAAGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124904 A...TAGGCAACTTTAGCGAGTATAGATGCTGAGCTTCAGAAACTTAAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 AAATGACCAACCACCAGAAAAAACGAGCAGCTGAGATGATGGCATCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127446 AAATGACCAACCACCAGAAAAAACGAGCAGCTGAGATGATGGCATCTTTA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 CTAAAAGACCTTGCAGAAATAGGAATTGCTGTGGGAAATAATGATGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127496 CTAAAAGACCTTGCAGAAATAGGAATTGCTGTGGGAAATAATGATGTAAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 G         CAGCCTGAGGGAACTGGCATGATAGATGAAGAGTTCACTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127546 GGTA...CAGCAGCCTGAGGGAACTGGCATGATAGATGAAGAGTTCACTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1766 TTGCAAGACTCTACATTAGCAAAATGAAGTCAGAAGTAAAAACCATGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132978 TTGCAAGACTCTACATTAGCAAAATGAAGTCAGAAGTAAAAACCATGGTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 AAACGTTGCAAGCAGTTAGAAAGCACACAAACTGAGAGCAACAAAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133028 AAACGTTGCAAGCAGTTAGAAAGCACACAAACTGAGAGCAACAAAAAAAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 GGAAGAAAATGAAAAGGAGTTAGCAGCATGTCAGCTTCGTATCTCTCAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 133078 GGAAGAAAATGAAAAGGAGTTAGCAGCATGTCAGCTTCGTATCTCTCAAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1915         CATGAAGCCAAAATCAAGTCATTGACTGAATACCTTCAAAAT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133128 TA...AAGCATGAAGCCAAAATCAAGTCATTGACTGAATACCTTCAAAAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 GTGGAACAAAAGAAAAGACAGTTGGAGGAATCTGTCGATGCCCTCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133759 GTGGAACAAAAGAAAAGACAGTTGGAGGAATCTGTCGATGCCCTCAGTGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 AGAACTAGTCCAGCTTCGAGCACAAG         AGAAAGTCCATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 133809 AGAACTAGTCCAGCTTCGAGCACAAGGTA...CAGAGAAAGTCCATGAAA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2048 TGGAAAAGGAGCACTTAAATAAGGTTCAGACTGCAAATGAAGTTAAG CA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||
 134702 TGGAAAAGGAGCACTTAAATAAGGTTCAGACTGCAAATGAAGTTAAGGCA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2097 AG         CTGTTGAACAGCAGATCCAGAGCCATAGAGAAACTCATC
        |->>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134752 A GTT...AAGCTGTTGAACAGCAGATCCAGAGCCATAGAGAAACTCATC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2138 AAAAACAGATCAGTAGTTTGAGAGATGAAGTAGAAGCAAAAGCAAAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134886 AAAAACAGATCAGTAGTTTGAGAGATGAAGTAGAAGCAAAAGCAAAACTT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2188 ATTACTGATCTTCAAGA         CCAAAACCAGAAAATGATGTTAGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 134936 ATTACTGATCTTCAAGAGTA...CAGCCAAAACCAGAAAATGATGTTAGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2229 GCAGGAACGTCTAAGAGTAGAACATGAGAAGTTGAAAGCCACAGATCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136039 GCAGGAACGTCTAAGAGTAGAACATGAGAAGTTGAAAGCCACAGATCAGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2279 AAAAGAGCAGAAAACTACATGAACTTAC         GGTTATGCAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 136089 AAAAGAGCAGAAAACTACATGAACTTACGTG...TAGGGTTATGCAAGAT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2320 AGACGAGAACAAGCAAGACAAGACTTGAAGGGTTTGGAAGAGACAGTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 137425 AGACGAGAACAAGCAAGACAAGACTTGAAGGGTTTGGAAGAGACAGTGGT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2368        GCAAAAGAACTTCAGACTTTACACAACCTGCGCAAACTCTTTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137475 A...AAGGCAAAAGAACTTCAGACTTTACACAACCTGCGCAAACTCTTTG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2411 TTCAGGACCTGGCTACAAGAGTTAAAAAG         AGTGCTGAGATT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 137630 TTCAGGACCTGGCTACAAGAGTTAAAAAGGTA...CAGAGTGCTGAGATT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2452 GATTCTGATGACACCGGAGGCAGCGCTGCTCAGAAGCAAAAAATCTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137830 GATTCTGATGACACCGGAGGCAGCGCTGCTCAGAAGCAAAAAATCTCCTT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2502 TCTTGAAAATAATCTTGAACAGCTCACTAAAGTGCACAAACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 137880 TCTTGAAAATAATCTTGAACAGCTCACTAAAGTGCACAAACAGGTA...T

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2545   TTGGTACGTGATAATGCAGATCTCCGCTGTGAACTTCCTAAGTTGGAA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138613 AGTTGGTACGTGATAATGCAGATCTCCGCTGTGAACTTCCTAAGTTGGAA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2593 AAGCGACTTCGAGCTACAGCTGAGAGAGTGAAAGCTTTGGAATCAGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138663 AAGCGACTTCGAGCTACAGCTGAGAGAGTGAAAGCTTTGGAATCAGCACT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2643 GAAAGAAGCTAAAGAAAATGCATCTCGTGATCGCAAACGCTATCAGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138713 GAAAGAAGCTAAAGAAAATGCATCTCGTGATCGCAAACGCTATCAGCAAG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2693 AAGTAGATCGCATAAAGGAAGCAGTCAGGTCAAAGAATATGGCCAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138763 AAGTAGATCGCATAAAGGAAGCAGTCAGGTCAAAGAATATGGCCAGAAGA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2743 GGGCATTCTGCACAGATTG         CTAAACCTATTCGTCCCGGGCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 138813 GGGCATTCTGCACAGATTGGTT...TAGCTAAACCTATTCGTCCCGGGCA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2784 ACATCCAGCAGCTTCTCCAACTCACCCAAGTGCAATTCGTGGAGGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140337 ACATCCAGCAGCTTCTCCAACTCACCCAAGTGCAATTCGTGGAGGAGGTG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2834 CATTTGTTCAGAACAGCCAGCCAGTGGCAGTGCGAGGTGGAGGAGGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140387 CATTTGTTCAGAACAGCCAGCCAGTGGCAGTGCGAGGTGGAGGAGGCAAA

   3100     .
   2884 CAAGTG
        ||||||
 140437 CAAGTG