seq1 = pF1KB8516.tfa, 2613 bp
seq2 = pF1KB8516/gi568815586r_109683624.tfa (gi568815586r:109683624_109914796), 231173 bp

>pF1KB8516 2613
>gi568815586r:109683624_109914796 (Chr12)

(complement)

1-386  (100001-100386)   100% ->
387-559  (106329-106501)   100% ->
560-712  (111654-111806)   100% ->
713-853  (114039-114179)   100% ->
854-1152  (115885-116183)   100% ->
1153-1332  (118093-118272)   100% ->
1333-1491  (120310-120468)   100% ->
1492-1584  (120775-120867)   100% ->
1585-1658  (121197-121270)   100% ->
1659-1824  (121980-122145)   100% ->
1825-1891  (122368-122434)   100% ->
1892-2208  (126081-126397)   100% ->
2209-2336  (127960-128087)   100% ->
2337-2458  (130360-130481)   100% ->
2459-2613  (131019-131173)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGATTCCAGCGAAGGCCCCCGCGCGGGGCCCGGGGAGGTGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGATTCCAGCGAAGGCCCCCGCGCGGGGCCCGGGGAGGTGGCTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCCCCGGGGATGAGAGTGGCACCCCAGGTGGGGAGGCTTTTCCTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCCCCGGGGATGAGAGTGGCACCCCAGGTGGGGAGGCTTTTCCTCTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTCCCTGGCCAATCTGTTTGAGGGGGAGGATGGCTCCCTTTCGCCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTCCCTGGCCAATCTGTTTGAGGGGGAGGATGGCTCCCTTTCGCCCTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGGCTGATGCCAGTCGCCCTGCTGGCCCAGGCGATGGGCGACCAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCGGCTGATGCCAGTCGCCCTGCTGGCCCAGGCGATGGGCGACCAAATCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGCATGAAGTTCCAGGGCGCCTTCCGCAAGGGGGTGCCCAACCCCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCGCATGAAGTTCCAGGGCGCCTTCCGCAAGGGGGTGCCCAACCCCATCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATCTGCTGGAGTCCACCCTATATGAGTCCTCGGTGGTGCCTGGGCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATCTGCTGGAGTCCACCCTATATGAGTCCTCGGTGGTGCCTGGGCCCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAAGCACCCATGGACTCACTGTTTGACTACGGCACCTATCGTCACCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAAGCACCCATGGACTCACTGTTTGACTACGGCACCTATCGTCACCACTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGTGACAACAAGAGGTGGAGGAAGAAGATCATAGA         GAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100351 CAGTGACAACAAGAGGTGGAGGAAGAAGATCATAGAGTG...CAGGAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGCCGCAGAGCCCCAAAGCCCCTGCCCCTCAGCCGCCCCCCATCCTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106334 AGCCGCAGAGCCCCAAAGCCCCTGCCCCTCAGCCGCCCCCCATCCTCAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTCTTCAACCGGCCTATCCTCTTTGACATCGTGTCCCGGGGCTCCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106384 GTCTTCAACCGGCCTATCCTCTTTGACATCGTGTCCCGGGGCTCCACTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGACCTGGACGGGCTGCTCCCATTCTTGCTGACCCACAAGAAACGCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106434 TGACCTGGACGGGCTGCTCCCATTCTTGCTGACCCACAAGAAACGCCTAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTGATGAGGAGTTTCGAG         AGCCATCTACGGGGAAGACCTGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 106484 CTGATGAGGAGTTTCGAGGTG...TAGAGCCATCTACGGGGAAGACCTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTGCCCAAGGCCTTGCTGAACCTGAGCAATGGCCGCAACGACACCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111677 CTGCCCAAGGCCTTGCTGAACCTGAGCAATGGCCGCAACGACACCATCCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGTGCTGCTGGACATCGCGGAGCGCACCGGCAACATGAGGGAGTTCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111727 TGTGCTGCTGGACATCGCGGAGCGCACCGGCAACATGAGGGAGTTCATTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACTCGCCCTTCCGTGACATCTACTATCGAG         GTCAGACAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 111777 ACTCGCCCTTCCGTGACATCTACTATCGAGGTG...CAGGTCAGACAGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CTGCACATCGCCATTGAGCGTCGCTGCAAACACTACGTGGAACTTCTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114050 CTGCACATCGCCATTGAGCGTCGCTGCAAACACTACGTGGAACTTCTCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GGCCCAGGGAGCTGATGTCCACGCCCAGGCCCGTGGGCGCTTCTTCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114100 GGCCCAGGGAGCTGATGTCCACGCCCAGGCCCGTGGGCGCTTCTTCCAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCAAGGATGAGGGGGGCTACTTCTACTTTG         GGGAGCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 114150 CCAAGGATGAGGGGGGCTACTTCTACTTTGGTA...CAGGGGAGCTGCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CTGTCGCTGGCTGCCTGCACCAACCAGCCCCACATTGTCAACTACCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115896 CTGTCGCTGGCTGCCTGCACCAACCAGCCCCACATTGTCAACTACCTGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GGAGAACCCCCACAAGAAGGCGGACATGCGGCGCCAGGACTCGCGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115946 GGAGAACCCCCACAAGAAGGCGGACATGCGGCGCCAGGACTCGCGAGGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 ACACAGTGCTGCATGCGCTGGTGGCCATTGCTGACAACACCCGTGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115996 ACACAGTGCTGCATGCGCTGGTGGCCATTGCTGACAACACCCGTGAGAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 ACCAAGTTTGTTACCAAGATGTACGACCTGCTGCTGCTCAAGTGTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116046 ACCAAGTTTGTTACCAAGATGTACGACCTGCTGCTGCTCAAGTGTGCCCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CCTCTTCCCCGACAGCAACCTGGAGGCCGTGCTCAACAACGACGGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116096 CCTCTTCCCCGACAGCAACCTGGAGGCCGTGCTCAACAACGACGGCCTCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 CGCCCCTCATGATGGCTGCCAAGACGGGCAAGATTGGG         ATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 116146 CGCCCCTCATGATGGCTGCCAAGACGGGCAAGATTGGGGTG...CAGATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 TTTCAGCACATCATCCGGCGGGAGGTGACGGATGAGGACACACGGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118096 TTTCAGCACATCATCCGGCGGGAGGTGACGGATGAGGACACACGGCACCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GTCCCGCAAGTTCAAGGACTGGGCCTATGGGCCAGTGTATTCCTCGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118146 GTCCCGCAAGTTCAAGGACTGGGCCTATGGGCCAGTGTATTCCTCGCTTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 ATGACCTCTCCTCCCTGGACACGTGTGGGGAAGAGGCCTCCGTGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118196 ATGACCTCTCCTCCCTGGACACGTGTGGGGAAGAGGCCTCCGTGCTGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 ATCCTGGTGTACAACAGCAAGATTGAG         AACCGCCACGAGAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 118246 ATCCTGGTGTACAACAGCAAGATTGAGGTG...TAGAACCGCCACGAGAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 GCTGGCTGTGGAGCCCATCAATGAACTGCTGCGGGACAAGTGGCGCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120324 GCTGGCTGTGGAGCCCATCAATGAACTGCTGCGGGACAAGTGGCGCAAGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 TCGGGGCCGTCTCCTTCTACATCAACGTGGTCTCCTACCTGTGTGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120374 TCGGGGCCGTCTCCTTCTACATCAACGTGGTCTCCTACCTGTGTGCCATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 GTCATCTTCACTCTCACCGCCTACTACCAGCCGCTGGAGGGCACA     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 120424 GTCATCTTCACTCTCACCGCCTACTACCAGCCGCTGGAGGGCACAGTG..

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492     CCGCCGTACCCTTACCGCACCACGGTGGACTACCTGCGGCTGGCTG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120474 .CAGCCGCCGTACCCTTACCGCACCACGGTGGACTACCTGCGGCTGGCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 GCGAGGTCATTACGCTCTTCACTGGGGTCCTGTTCTTCTTCACCAAC   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 120821 GCGAGGTCATTACGCTCTTCACTGGGGTCCTGTTCTTCTTCACCAACGTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1585       ATCAAAGACTTGTTCATGAAGAAATGCCCTGGAGTGAATTCTCT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120871 ...CAGATCAAAGACTTGTTCATGAAGAAATGCCCTGGAGTGAATTCTCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 CTTCATTGATGGCTCCTTCCAGCTGCTCTA         CTTCATCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 121241 CTTCATTGATGGCTCCTTCCAGCTGCTCTAGTG...CAGCTTCATCTACT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 CTGTCCTGGTGATCGTCTCAGCAGCCCTCTACCTGGCAGGGATCGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121991 CTGTCCTGGTGATCGTCTCAGCAGCCCTCTACCTGGCAGGGATCGAGGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 TACCTGGCCGTGATGGTCTTTGCCCTGGTCCTGGGCTGGATGAATGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122041 TACCTGGCCGTGATGGTCTTTGCCCTGGTCCTGGGCTGGATGAATGCCCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1770 TTACTTCACCCGTGGGCTGAAGCTGACGGGGACCTATAGCATCATGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122091 TTACTTCACCCGTGGGCTGAAGCTGACGGGGACCTATAGCATCATGATCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 AGAAG         ATTCTCTTCAAGGACCTTTTCCGATTCCTGCTCGTC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122141 AGAAGGTA...TAGATTCTCTTCAAGGACCTTTTCCGATTCCTGCTCGTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 TACTTGCTCTTCATGATCGGCTACGCTTCAG         CCCTGGTCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 122404 TACTTGCTCTTCATGATCGGCTACGCTTCAGGTG...CAGCCCTGGTCTC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CCTCCTGAACCCGTGTGCCAACATGAAGGTGTGCAATGAGGACCAGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126091 CCTCCTGAACCCGTGTGCCAACATGAAGGTGTGCAATGAGGACCAGACCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 ACTGCACAGTGCCCACTTACCCCTCGTGCCGTGACAGCGAGACCTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126141 ACTGCACAGTGCCCACTTACCCCTCGTGCCGTGACAGCGAGACCTTCAGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 ACCTTCCTCCTGGACCTGTTTAAGCTGACCATCGGCATGGGCGACCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126191 ACCTTCCTCCTGGACCTGTTTAAGCTGACCATCGGCATGGGCGACCTGGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2052 GATGCTGAGCAGCACCAAGTACCCCGTGGTCTTCATCATCCTGCTGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126241 GATGCTGAGCAGCACCAAGTACCCCGTGGTCTTCATCATCCTGCTGGTGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2102 CCTACATCATCCTCACCTTTGTGCTGCTCCTCAACATGCTCATTGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126291 CCTACATCATCCTCACCTTTGTGCTGCTCCTCAACATGCTCATTGCCCTC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 ATGGGCGAGACAGTGGGCCAGGTCTCCAAGGAGAGCAAGCACATCTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126341 ATGGGCGAGACAGTGGGCCAGGTCTCCAAGGAGAGCAAGCACATCTGGAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202 GCTGCAG         TGGGCCACCACCATCCTGGACATTGAGCGCTCCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126391 GCTGCAGGTG...CAGTGGGCCACCACCATCCTGGACATTGAGCGCTCCT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2243 TCCCCGTATTCCTGAGGAAGGCCTTCCGCTCTGGGGAGATGGTCACCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127994 TCCCCGTATTCCTGAGGAAGGCCTTCCGCTCTGGGGAGATGGTCACCGTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 GGCAAGAGCTCGGACGGCACTCCTGACCGCAGGTGGTGCTTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 128044 GGCAAGAGCTCGGACGGCACTCCTGACCGCAGGTGGTGCTTCAGGTG...

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2337    GGTGGATGAGGTGAACTGGTCTCACTGGAACCAGAACTTGGGCATCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130357 CAGGGTGGATGAGGTGAACTGGTCTCACTGGAACCAGAACTTGGGCATCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2384 TCAACGAGGACCCGGGCAAGAATGAGACCTACCAGTATTATGGCTTCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130407 TCAACGAGGACCCGGGCAAGAATGAGACCTACCAGTATTATGGCTTCTCG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2434 CATACCGTGGGCCGCCTCCGCAGGG         ATCGCTGGTCCTCGGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 130457 CATACCGTGGGCCGCCTCCGCAGGGGTG...CAGATCGCTGGTCCTCGGT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2475 GGTACCCCGCGTGGTGGAACTGAACAAGAACTCGAACCCGGACGAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131035 GGTACCCCGCGTGGTGGAACTGAACAAGAACTCGAACCCGGACGAGGTGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2525 TGGTGCCTCTGGACAGCATGGGGAACCCCCGCTGCGATGGCCACCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131085 TGGTGCCTCTGGACAGCATGGGGAACCCCCGCTGCGATGGCCACCAGCAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .
   2575 GGTTACCCCCGCAAGTGGAGGACTGATGACGCCCCGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131135 GGTTACCCCCGCAAGTGGAGGACTGATGACGCCCCGCTC