seq1 = pF1KB8515.tfa, 2844 bp
seq2 = pF1KB8515/gi568815579f_14340291.tfa (gi568815579f:14340291_14571781), 231491 bp

>pF1KB8515 2844
>gi568815579f:14340291_14571781 (Chr19)

1-39  (100001-100039)   100% ->
40-340  (100853-101153)   100% ->
341-492  (103180-103331)   100% ->
493-628  (106136-106271)   100% ->
629-774  (110028-110173)   100% ->
775-988  (110606-110819)   99% ->
989-1183  (111539-111733)   100% ->
1184-1293  (117741-117850)   100% ->
1294-1437  (117942-118085)   100% ->
1438-1513  (123377-123452)   100% ->
1514-1655  (123538-123679)   100% ->
1656-1749  (123770-123863)   100% ->
1750-1826  (127275-127351)   100% ->
1827-1902  (127428-127503)   100% ->
1903-1994  (127586-127677)   100% ->
1995-2171  (129051-129227)   100% ->
2172-2234  (129462-129524)   100% ->
2235-2311  (129622-129698)   100% ->
2312-2454  (129873-130015)   99% ->
2455-2562  (130285-130392)   100% ->
2563-2643  (130481-130561)   100% ->
2644-2844  (131291-131491)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGGCCAATAACCCCTCGGAGCAGGAGCTGGAG         AG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100001 ATGGCGGAGGCCAATAACCCCTCGGAGCAGGAGCTGGAGGTG...CAGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGAGCCTCGCAGCTGGTCCCTGCTAGAGCAGCTGGGCCTGGCCGGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100855 TGAGCCTCGCAGCTGGTCCCTGCTAGAGCAGCTGGGCCTGGCCGGGGCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACCTGGCGGCCCCCGGGGTACAGCAGCAGCTGGAGCTGGAGCGGGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100905 ACCTGGCGGCCCCCGGGGTACAGCAGCAGCTGGAGCTGGAGCGGGAGCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGCGGCGGGAAATCCGCAAGGAGCTGAAGCTGAAGGAGGGTGCTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100955 CTGCGGCGGGAAATCCGCAAGGAGCTGAAGCTGAAGGAGGGTGCTGAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTGCGGCGGGCCACCACTGACCTGGGCCGCAGCCTGGGCCCCGTAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101005 CCTGCGGCGGGCCACCACTGACCTGGGCCGCAGCCTGGGCCCCGTAGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCTGCTGCGGGGCTCCTCGCGCCGCCTCGACCTGCTGCACCAGCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101055 TGCTGCTGCGGGGCTCCTCGCGCCGCCTCGACCTGCTGCACCAGCAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAGGAGCTGCACGCCCACGTGGTGCTTCCCGACCCGGCGGCCACCCACG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 101105 CAGGAGCTGCACGCCCACGTGGTGCTTCCCGACCCGGCGGCCACCCACGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    341         ATGGCCCCCAGTCCCCTGGTGCGGGTGGCCCCACCTGCTCGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101155 TG...CAGATGGCCCCCAGTCCCCTGGTGCGGGTGGCCCCACCTGCTCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCACCAACCTGAGCCGCGTGGCGGGCCTGGAGAAGCAGTTGGCCATTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103222 CCACCAACCTGAGCCGCGTGGCGGGCCTGGAGAAGCAGTTGGCCATTGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTGAAGGTGAAGCAGGGGGCGGAGAACATGATCCAGACCTACAGCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103272 CTGAAGGTGAAGCAGGGGGCGGAGAACATGATCCAGACCTACAGCAATGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CAGCACCAAG         GACCGGAAGCTGCTGCTGACAGCCCAGCAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 103322 CAGCACCAAGGTG...CAGGACCGGAAGCTGCTGCTGACAGCCCAGCAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGTTGCAGGACAGTAAGACCAAGATTGACATCATCCGCATGCAACTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106167 TGTTGCAGGACAGTAAGACCAAGATTGACATCATCCGCATGCAACTCCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CGGGCGCTGCAGGCCGGCCAGCTGGAGAACCAGGCAGCCCCGGATGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106217 CGGGCGCTGCAGGCCGGCCAGCTGGAGAACCAGGCAGCCCCGGATGACAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCAAG         GGAGTCCTGACCTGGGGGCTGTGGAGCTGCGCATCG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106267 CCAAGGTG...CAGGGAGTCCTGACCTGGGGGCTGTGGAGCTGCGCATCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAGAGCTGCGGCACCACTTCCGAGTGGAGCACGCGGTGGCCGAGGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110064 AAGAGCTGCGGCACCACTTCCGAGTGGAGCACGCGGTGGCCGAGGGTGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AAGAACGTACTGCGCCTGCTCAGCGCTGCCAAGGCCCCGGACCGCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110114 AAGAACGTACTGCGCCTGCTCAGCGCTGCCAAGGCCCCGGACCGCAAGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGTCAGCGAG         GCCCAGGAGAAATTGACAGAATCCAACCAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||| ||||||||||||||||
 110164 AGTCAGCGAGGTG...CAGGCCCAGGAGAAATTAACAGAATCCAACCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGCTGGGGCTGCTGCGGGAGGCTCTGGAGCGGAGACTTGGGGAGCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110637 AGCTGGGGCTGCTGCGGGAGGCTCTGGAGCGGAGACTTGGGGAGCTGCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GCCGACCACCCCAAGGGGCGGCTGCTGCGAGAAGAGCTCGCTGCGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110687 GCCGACCACCCCAAGGGGCGGCTGCTGCGAGAAGAGCTCGCTGCGGCCTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CTCCGCTGCCTTCAGCACCCGCCTGGCCGGGCCCTTTCCCGCCACGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110737 CTCCGCTGCCTTCAGCACCCGCCTGGCCGGGCCCTTTCCCGCCACGCACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 ACAGCACCCTGTGCAAGCCCGCGCCGCTCACAG         GGACCCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 110787 ACAGCACCCTGTGCAAGCCCGCGCCGCTCACAGGTG...CAGGGACCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GAGGTACGAGTGGTGGGCTGCAGAGACCTCCCAGAGACCATCCCGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111547 GAGGTACGAGTGGTGGGCTGCAGAGACCTCCCAGAGACCATCCCGTGGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CCCTACCCCCTCAATGGGGGGACCTGGGACCCCAGACAGCCGCCCCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111597 CCCTACCCCCTCAATGGGGGGACCTGGGACCCCAGACAGCCGCCCCCCCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TCCTGAGCCGCCCAGCCCGGGGCCTTTACAGCCGAAGCGGAAGCCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111647 TCCTGAGCCGCCCAGCCCGGGGCCTTTACAGCCGAAGCGGAAGCCTCAGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GGCCGGAGCAGCCTCAAAGCAGAAGCCGAGAACACCA         GTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 111697 GGCCGGAGCAGCCTCAAAGCAGAAGCCGAGAACACCAGTG...CAGGTGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 AGTCAGCACTGTGCTTAAGCTGGATAACACAGTGGTGGGGCAGACGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117745 AGTCAGCACTGTGCTTAAGCTGGATAACACAGTGGTGGGGCAGACGTCTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GGAAGCCATGTGGCCCCAATGCCTGGGACCAGAGCTTCACTCTGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117795 GGAAGCCATGTGGCCCCAATGCCTGGGACCAGAGCTTCACTCTGGAGCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GAAAGG         GCACGGGAACTGGAGTTGGCTGTGTTCTGGCGGGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117845 GAAAGGGTG...CAGGCACGGGAACTGGAGTTGGCTGTGTTCTGGCGGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CCAGCGGGGCCTGTGTGCCCTCAAATTCCTGAAGTTGGAGGATTTCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117977 CCAGCGGGGCCTGTGTGCCCTCAAATTCCTGAAGTTGGAGGATTTCTTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 ACAATGAGAGGCATGAGGTGCAGCTGGACATGGAACCCCAGGGCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118027 ACAATGAGAGGCATGAGGTGCAGCTGGACATGGAACCCCAGGGCTGCCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 GTGGCTGAG         GTCACCTTCCGCAACCCTGTCATTGAGAGGAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 118077 GTGGCTGAGGTA...CAGGTCACCTTCCGCAACCCTGTCATTGAGAGGAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TCCTCGGCTCCGACGGCAGAAGAAAATTTTCTCCAAGCAGCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 123409 TCCTCGGCTCCGACGGCAGAAGAAAATTTTCTCCAAGCAGCAAGGTG...

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1514    GGAAGGCGTTCCAGCGTGCTAGGCAGATGAACATCGATGTCGCCACG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123535 CAGGGAAGGCGTTCCAGCGTGCTAGGCAGATGAACATCGATGTCGCCACG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 TGGGTGCGGCTGCTCCGGAGGCTCATCCCCAATGCCACGGGCACAGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123585 TGGGTGCGGCTGCTCCGGAGGCTCATCCCCAATGCCACGGGCACAGGCAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CTTTAGCCCTGGGGCTTCTCCAGGATCCGAGGCCCGGACCACGGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 123635 CTTTAGCCCTGGGGCTTCTCCAGGATCCGAGGCCCGGACCACGGGGTA..

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656     TGACATATCGGTGGAGAAGCTGAACCTCGGCACTGACTCGGACAGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123685 .CAGTGACATATCGGTGGAGAAGCTGAACCTCGGCACTGACTCGGACAGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 TCACCTCAGAAGAGCTCGCGGGATCCTCCTTCCAGCCCATCGAGCCTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 123816 TCACCTCAGAAGAGCTCGCGGGATCCTCCTTCCAGCCCATCGAGCCTGGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1750        AGCTCCCCCATCCAGGAATCCACTGCTCCCGAGCTGCCTTCGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123866 G...CAGAGCTCCCCCATCCAGGAATCCACTGCTCCCGAGCTGCCTTCGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 AGACCCAGGAGACCCCAGGCCCCGCCCTGTGCAG         CCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 127318 AGACCCAGGAGACCCCAGGCCCCGCCCTGTGCAGGTG...CAGCCCTCTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 AGGAAGTCACCTCTGACCCTCGAAGATTTCAAGTTCCTGGCGGTGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127435 AGGAAGTCACCTCTGACCCTCGAAGATTTCAAGTTCCTGGCGGTGCTGGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 CCGGGGTCATTTTGGGAAG         GTGCTCCTCTCCGAATTCCGGC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 127485 CCGGGGTCATTTTGGGAAGGTG...CAGGTGCTCCTCTCCGAATTCCGGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 CCAGTGGGGAGCTGTTCGCCATCAAGGCTCTGAAGAAAGGGGACATTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127608 CCAGTGGGGAGCTGTTCGCCATCAAGGCTCTGAAGAAAGGGGACATTGTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 GCCCGAGACGAGGTGGAGAG         CCTGATGTGTGAGAAGCGGAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 127658 GCCCGAGACGAGGTGGAGAGGTG...CAGCCTGATGTGTGAGAAGCGGAT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 ATTGGCGGCAGTGACCAGTGCGGGACACCCCTTCCTGGTGAACCTCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129072 ATTGGCGGCAGTGACCAGTGCGGGACACCCCTTCCTGGTGAACCTCTTCG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2066 GCTGTTTCCAGACACCGGAGCACGTGTGCTTCGTGATGGAGTACTCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129122 GCTGTTTCCAGACACCGGAGCACGTGTGCTTCGTGATGGAGTACTCGGCC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 GGTGGGGACCTGATGCTGCACATCCACAGCGACGTGTTCTCTGAGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129172 GGTGGGGACCTGATGCTGCACATCCACAGCGACGTGTTCTCTGAGCCCCG

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 TGCCAT         CTTTTATTCCGCCTGCGTGGTGCTGGGCCTACAGT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129222 TGCCATGTG...CAGCTTTTATTCCGCCTGCGTGGTGCTGGGCCTACAGT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 TTCTTCACGAACACAAGATCGTCTACAG         GGACCTGAAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 129497 TTCTTCACGAACACAAGATCGTCTACAGGTG...CAGGGACCTGAAGTTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 GACAATTTGCTCCTGGACACCGAGGGCTACGTCAAGATCGCAGACTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129635 GACAATTTGCTCCTGGACACCGAGGGCTACGTCAAGATCGCAGACTTTGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 CCTCTGCAAGGAGG         GGATGGGCTATGGGGACCGGACCAGCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 129685 CCTCTGCAAGGAGGGTG...CAGGGATGGGCTATGGGGACCGGACCAGCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2339 CATTCTGTGGGACCCCGGAGTTCCTGGCCCCTGAGGTGCTGACGGACACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129900 CATTCTGTGGGACCCCGGAGTTCCTGGCCCCTGAGGTGCTGACGGACACG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2389 TCGTACACGCGGGCTGTGGACTGGTGGGGACTGGGTGTGCTGCTCTACGA
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129950 TCGTACACGCGAGCTGTGGACTGGTGGGGACTGGGTGTGCTGCTCTACGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2439 GATGCTGGTTGGCGAG         TCCCCATTCCCAGGGGATGATGAGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 130000 GATGCTGGTTGGCGAGGTG...CAGTCCCCATTCCCAGGGGATGATGAGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2480 AGGAGGTCTTCGACAGCATCGTCAACGACGAGGTTCGCTACCCCCGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130310 AGGAGGTCTTCGACAGCATCGTCAACGACGAGGTTCGCTACCCCCGCTTC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2530 CTGTCGGCCGAAGCCATCGGCATCATGAGAAGG         CTGCTTCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 130360 CTGTCGGCCGAAGCCATCGGCATCATGAGAAGGGTG...AAGCTGCTTCG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2571 GAGGAACCCAGAGCGGAGGCTGGGATCTAGCGAGAGAGATGCAGAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130489 GAGGAACCCAGAGCGGAGGCTGGGATCTAGCGAGAGAGATGCAGAAGATG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2621 TGAAGAAACAGCCCTTCTTCAGG         ACTCTGGGCTGGGAAGCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 130539 TGAAGAAACAGCCCTTCTTCAGGGTG...CAGACTCTGGGCTGGGAAGCC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2662 CTGTTGGCCCGGCGCCTGCCACCGCCCTTTGTGCCCACGCTGTCCGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131309 CTGTTGGCCCGGCGCCTGCCACCGCCCTTTGTGCCCACGCTGTCCGGCCG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2712 CACCGACGTCAGCAACTTCGACGAGGAGTTCACCGGGGAGGCCCCCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131359 CACCGACGTCAGCAACTTCGACGAGGAGTTCACCGGGGAGGCCCCCACAC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2762 TGAGCCCGCCCCGCGACGCGCGGCCCCTCACAGCCGCGGAGCAGGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131409 TGAGCCCGCCCCGCGACGCGCGGCCCCTCACAGCCGCGGAGCAGGCAGCC

   3000     .    :    .    :    .    :
   2812 TTCCTGGACTTCGACTTCGTGGCCGGGGGCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 131459 TTCCTGGACTTCGACTTCGTGGCCGGGGGCTGC