seq1 = pF1KB8492.tfa, 2574 bp
seq2 = pF1KB8492/gi568815579r_3876557.tfa (gi568815579r:3876557_4084351), 207795 bp

>pF1KB8492 2574
>gi568815579r:3876557_4084351 (Chr19)

(complement)

1-218  (100000-100216)   99% ->
219-400  (101061-101242)   100% ->
401-612  (101334-101545)   100% ->
613-791  (101928-102106)   100% ->
792-897  (102300-102405)   100% ->
898-1011  (102900-103013)   100% ->
1012-1150  (103373-103511)   100% ->
1151-1346  (103643-103838)   100% ->
1347-1605  (104286-104544)   100% ->
1606-1713  (104916-105023)   100% ->
1714-2067  (106180-106533)   100% ->
2068-2250  (106742-106924)   100% ->
2251-2383  (107005-107137)   100% ->
2384-2574  (107605-107795)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGAACTTCACGGTAGACCAGATCCGCGCCATCATGGACAAGAAGGC
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GGTGAACTTCACGGTAGACCAGATCCGCGCCATCATGGACAAGAAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACATCCGCAACATGTCTGTCATCGCCCACGTGGACCATGGCAAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 CAACATCCGCAACATGTCTGTCATCGCCCACGTGGACCATGGCAAGTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCTGACAGACTCCCTGGTGTGCAAGGCGGGCATCATCGCCTCGGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100099 CGCTGACAGACTCCCTGGTGTGCAAGGCGGGCATCATCGCCTCGGCCCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCGGGGAGACACGCTTCACTGATACCCGGAAGGACGAGCAGGAGCGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100149 GCCGGGGAGACACGCTTCACTGATACCCGGAAGGACGAGCAGGAGCGTTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATCACCATCAAGTCAAC         TGCCATCTCCCTCTTCTACGAGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100199 CATCACCATCAAGTCAACGTG...CAGTGCCATCTCCCTCTTCTACGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCTCGGAGAATGACTTGAACTTCATCAAGCAGAGCAAGGACGGTGCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101084 TCTCGGAGAATGACTTGAACTTCATCAAGCAGAGCAAGGACGGTGCCGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCCTCATCAACCTCATTGACTCCCCCGGGCATGTCGACTTCTCCTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101134 TTCCTCATCAACCTCATTGACTCCCCCGGGCATGTCGACTTCTCCTCGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGTGACTGCTGCCCTCCGAGTCACCGATGGCGCATTGGTGGTGGTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101184 GGTGACTGCTGCCCTCCGAGTCACCGATGGCGCATTGGTGGTGGTGGACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GCGTGTCAG         GCGTGTGCGTGCAGACGGAGACAGTGCTGCGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 101234 GCGTGTCAGGTA...CAGGCGTGTGCGTGCAGACGGAGACAGTGCTGCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAGGCCATTGCCGAGCGCATCAAGCCTGTGCTGATGATGAACAAGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101366 CAGGCCATTGCCGAGCGCATCAAGCCTGTGCTGATGATGAACAAGATGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCGCGCCCTGCTGGAGCTGCAGCTGGAGCCCGAGGAGCTCTACCAGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101416 CCGCGCCCTGCTGGAGCTGCAGCTGGAGCCCGAGGAGCTCTACCAGACTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCCAGCGCATCGTGGAGAACGTGAACGTCATCATCTCCACCTACGGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101466 TCCAGCGCATCGTGGAGAACGTGAACGTCATCATCTCCACCTACGGCGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GGCGAGAGCGGCCCCATGGGCAACATCATG         ATCGATCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 101516 GGCGAGAGCGGCCCCATGGGCAACATCATGGTA...CAGATCGATCCTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCTCGGTACCGTGGGCTTTGGGTCTGGCCTCCACGGGTGGGCCTTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101939 CCTCGGTACCGTGGGCTTTGGGTCTGGCCTCCACGGGTGGGCCTTCACCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGAAGCAGTTTGCCGAGATGTATGTGGCCAAGTTCGCCGCCAAGGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101989 TGAAGCAGTTTGCCGAGATGTATGTGGCCAAGTTCGCCGCCAAGGGGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GGCCAGTTGGGGCCTGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102039 GGCCAGTTGGGGCCTGCCGAGCGGGCCAAGAAAGTAGAGGACATGATGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GAAGCTGTGGGGTGACAG         GTACTTTGACCCAGCCAACGGCA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 102089 GAAGCTGTGGGGTGACAGGTG...CAGGTACTTTGACCCAGCCAACGGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGTTCAGCAAGTCAGCCACCAGCCCCGAAGGGAAGAAGCTGCCACGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102323 AGTTCAGCAAGTCAGCCACCAGCCCCGAAGGGAAGAAGCTGCCACGCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TTCTGCCAGCTGATCCTGGACCCCATCTTCAAG         GTGTTTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 102373 TTCTGCCAGCTGATCCTGGACCCCATCTTCAAGGTG...TAGGTGTTTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGCGATCATGAATTTCAAGAAAGAGGAGACAGCAAAACTGATAGAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102908 TGCGATCATGAATTTCAAGAAAGAGGAGACAGCAAAACTGATAGAGAAAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGGACATCAAACTGGACAGCGAGGACAAGGACAAAGAAGGCAAACCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102958 TGGACATCAAACTGGACAGCGAGGACAAGGACAAAGAAGGCAAACCCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 CTGAAG         GCTGTGATGCGCCGCTGGCTGCCTGCCGGAGACGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103008 CTGAAGGTG...CAGGCTGTGATGCGCCGCTGGCTGCCTGCCGGAGACGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CTTGTTGCAGATGATCACCATCCACCTGCCCTCCCCTGTGACGGCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103408 CTTGTTGCAGATGATCACCATCCACCTGCCCTCCCCTGTGACGGCCCAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 AGTACCGCTGCGAGCTCCTGTACGAGGGGCCCCCGGACGACGAGGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103458 AGTACCGCTGCGAGCTCCTGTACGAGGGGCCCCCGGACGACGAGGCTGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 ATGG         GCATTAAAAGCTGTGACCCCAAAGGCCCTCTTATGAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103508 ATGGGTA...CAGGCATTAAAAGCTGTGACCCCAAAGGCCCTCTTATGAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GTATATTTCCAAAATGGTGCCAACCTCCGACAAAGGTCGGTTCTACGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103680 GTATATTTCCAAAATGGTGCCAACCTCCGACAAAGGTCGGTTCTACGCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TTGGACGAGTCTTCTCGGGGCTGGTCTCCACTGGCCTGAAGGTCAGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103730 TTGGACGAGTCTTCTCGGGGCTGGTCTCCACTGGCCTGAAGGTCAGGATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 ATGGGGCCCAACTATACCCCTGGGAAGAAGGAGGACCTCTACCTGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103780 ATGGGGCCCAACTATACCCCTGGGAAGAAGGAGGACCTCTACCTGAAGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 AATCCAGAG         AACAATCTTGATGATGGGCCGCTACGTGGAGC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 103830 AATCCAGAGGTG...CAGAACAATCTTGATGATGGGCCGCTACGTGGAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CCATCGAGGATGTGCCTTGTGGGAACATTGTGGGCCTCGTGGGCGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104318 CCATCGAGGATGTGCCTTGTGGGAACATTGTGGGCCTCGTGGGCGTGGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CAGTTCCTGGTGAAGACGGGCACCATCACCACCTTCGAGCACGCGCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104368 CAGTTCCTGGTGAAGACGGGCACCATCACCACCTTCGAGCACGCGCACAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 CATGCGGGTGATGAAGTTCAGCGTCAGCCCTGTTGTCAGAGTGGCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104418 CATGCGGGTGATGAAGTTCAGCGTCAGCCCTGTTGTCAGAGTGGCCGTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1529 AGGCCAAGAACCCGGCTGACCTGCCCAAGCTGGTGGAGGGGCTGAAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104468 AGGCCAAGAACCCGGCTGACCTGCCCAAGCTGGTGGAGGGGCTGAAGCGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 CTGGCCAAGTCCGACCCCATGGTGCAG         TGCATCATCGAGGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 104518 CTGGCCAAGTCCGACCCCATGGTGCAGGTG...CAGTGCATCATCGAGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 GTCGGGAGAGCATATCATCGCGGGCGCCGGCGAGCTGCACCTGGAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104930 GTCGGGAGAGCATATCATCGCGGGCGCCGGCGAGCTGCACCTGGAGATCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 GCCTGAAGGACCTGGAGGAGGACCACGCCTGCATCCCCATCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 104980 GCCTGAAGGACCTGGAGGAGGACCACGCCTGCATCCCCATCAAGGTG...

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1714    AAATCTGACCCGGTCGTCTCGTACCGCGAGACGGTCAGTGAAGAGTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106177 CAGAAATCTGACCCGGTCGTCTCGTACCGCGAGACGGTCAGTGAAGAGTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 GAACGTGCTCTGCCTCTCCAAGTCCCCCAACAAGCACAACCGGCTGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106227 GAACGTGCTCTGCCTCTCCAAGTCCCCCAACAAGCACAACCGGCTGTACA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 TGAAGGCGCGGCCCTTCCCCGACGGCCTGGCCGAGGACATCGATAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106277 TGAAGGCGCGGCCCTTCCCCGACGGCCTGGCCGAGGACATCGATAAAGGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 GAGGTGTCCGCCCGTCAGGAGCTCAAGCAGCGGGCGCGCTACCTGGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106327 GAGGTGTCCGCCCGTCAGGAGCTCAAGCAGCGGGCGCGCTACCTGGCCGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1911 GAAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106377 GAAGTACGAGTGGGACGTGGCTGAGGCCCGCAAGATCTGGTGCTTTGGGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 CCGACGGCACCGGCCCCAACATCCTCACCGACATCACCAAGGGTGTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106427 CCGACGGCACCGGCCCCAACATCCTCACCGACATCACCAAGGGTGTGCAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 TACCTCAACGAGATCAAGGACAGTGTGGTGGCCGGCTTCCAGTGGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106477 TACCTCAACGAGATCAAGGACAGTGTGGTGGCCGGCTTCCAGTGGGCCAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 CAAGGAG         GGCGCACTGTGTGAGGAGAACATGCGGGGTGTGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106527 CAAGGAGGTG...CAGGGCGCACTGTGTGAGGAGAACATGCGGGGTGTGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2102 GCTTCGACGTCCACGACGTCACCCTGCACGCCGACGCCATCCACCGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106776 GCTTCGACGTCCACGACGTCACCCTGCACGCCGACGCCATCCACCGCGGA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 GGGGGCCAGATCATCCCCACAGCACGGCGCTGCCTCTATGCCAGTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106826 GGGGGCCAGATCATCCCCACAGCACGGCGCTGCCTCTATGCCAGTGTGCT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202 GACCGCCCAGCCACGCCTCATGGAGCCCATCTACCTTGTGGAGATCCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 106876 GACCGCCCAGCCACGCCTCATGGAGCCCATCTACCTTGTGGAGATCCAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2251         TGTCCAGAGCAGGTGGTCGGTGGCATCTACGGGGTTTTGAAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106926 TG...CAGTGTCCAGAGCAGGTGGTCGGTGGCATCTACGGGGTTTTGAAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2293 AGGAAGCGGGGCCACGTGTTCGAGGAGTCCCAGGTGGCCGGCACCCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107047 AGGAAGCGGGGCCACGTGTTCGAGGAGTCCCAGGTGGCCGGCACCCCCAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2343 GTTTGTGGTCAAGGCCTATCTGCCCGTCAACGAGTCCTTTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 107097 GTTTGTGGTCAAGGCCTATCTGCCCGTCAACGAGTCCTTTGGTG...CAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2384 GCTTCACCGCTGACCTGAGGTCCAACACGGGCGGCCAGGCGTTCCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107605 GCTTCACCGCTGACCTGAGGTCCAACACGGGCGGCCAGGCGTTCCCCCAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2434 TGTGTGTTTGACCACTGGCAGATCCTGCCCGGAGACCCCTTCGACAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107655 TGTGTGTTTGACCACTGGCAGATCCTGCCCGGAGACCCCTTCGACAACAG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2484 CAGCCGCCCCAGCCAGGTGGTGGCGGAGACCCGCAAGCGCAAGGGCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107705 CAGCCGCCCCAGCCAGGTGGTGGCGGAGACCCGCAAGCGCAAGGGCCTGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :
   2534 AAGAAGGCATCCCTGCCCTGGACAACTTCCTGGACAAATTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107755 AAGAAGGCATCCCTGCCCTGGACAACTTCCTGGACAAATTG